21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_3993 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_3993  hypothetical protein  100 
 
 
177 aa  363  1e-100  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4382  hypothetical protein  85.88 
 
 
176 aa  300  6.000000000000001e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.12539 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2520  hypothetical protein  72.73 
 
 
173 aa  271  3e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4861  hypothetical protein  63.13 
 
 
179 aa  243  9.999999999999999e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.967207  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3574  hypothetical protein  58.42 
 
 
202 aa  228  4e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3558  hypothetical protein  58.62 
 
 
203 aa  210  7.999999999999999e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1929  hypothetical protein  49.03 
 
 
233 aa  202  2e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00303  hypothetical protein  54.8 
 
 
170 aa  194  6e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.316829  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1347  hypothetical protein  51.96 
 
 
189 aa  191  4e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.151011  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0272  hypothetical protein  44.39 
 
 
215 aa  177  4.999999999999999e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2669  hypothetical protein  49.75 
 
 
214 aa  173  9e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30990  hypothetical protein  33.97 
 
 
222 aa  115  5e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000727395  unclonable  3.33317e-22 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0739  hypothetical protein  30.48 
 
 
226 aa  103  1e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5615  hypothetical protein  33 
 
 
217 aa  100  8e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.90828  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2239  hypothetical protein  29.13 
 
 
226 aa  98.6  4e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.000870146  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3965  hypothetical protein  29.91 
 
 
230 aa  97.8  7e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1771  hypothetical protein  31.66 
 
 
212 aa  96.7  2e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.9978  normal  0.0273818 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3197  hypothetical protein  29.17 
 
 
233 aa  94.4  7e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2952  hypothetical protein  32.57 
 
 
208 aa  86.3  2e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5163  hypothetical protein  27.36 
 
 
218 aa  79  0.00000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1805  hypothetical protein  33.33 
 
 
228 aa  69.7  0.00000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>