21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_1347 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_1347  hypothetical protein  100 
 
 		 189 aa  384  1e-106  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.151011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3993  hypothetical protein  51.96 
 
 		 177 aa  191  4e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4382  hypothetical protein  48.86 
 
 		 176 aa  184  6e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.12539 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3574  hypothetical protein  45.32 
 
 		 202 aa  184  8e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2520  hypothetical protein  49.44 
 
 		 173 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4861  hypothetical protein  48.11 
 
 		 179 aa  181  4.0000000000000006e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.967207  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0272  hypothetical protein  46.8 
 
 		 215 aa  181  5.0000000000000004e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1929  hypothetical protein  45.15 
 
 		 233 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3558  hypothetical protein  45.59 
 
 		 203 aa  177  8e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2669  hypothetical protein  44.33 
 
 		 214 aa  163  1.0000000000000001e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00303  hypothetical protein  45.24 
 
 		 170 aa  155  5.0000000000000005e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.316829  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30990  hypothetical protein  33.49 
 
 		 222 aa  111  5e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000727395  unclonable  3.33317e-22 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2239  hypothetical protein  28.7 
 
 		 226 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.000870146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0739  hypothetical protein  31.28 
 
 		 226 aa  109  3e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1771  hypothetical protein  30.58 
 
 		 212 aa  104  8e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.9978  normal  0.0273818 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3965  hypothetical protein  29.49 
 
 		 230 aa  100  1e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5615  hypothetical protein  29.11 
 
 		 217 aa  98.2  7e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.90828  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5163  hypothetical protein  30.24 
 
 		 218 aa  97.8  8e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2952  hypothetical protein  31.18 
 
 		 208 aa  86.3  2e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3197  hypothetical protein  31.4 
 
 		 233 aa  70.9  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1805  hypothetical protein  31.18 
 
 		 228 aa  65.5  0.0000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>