56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0648 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_0648  hypothetical protein  100 
 
 		 120 aa  233  7e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1367  hypothetical protein  62.96 
 
 		 119 aa  144  4.0000000000000006e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000537574 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1973  hypothetical protein  63.89 
 
 		 116 aa  141  3e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7649  hypothetical protein  64.35 
 
 		 119 aa  140  6e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.557144 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4838  hypothetical protein  57.89 
 
 		 123 aa  132  1.9999999999999998e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0037  hypothetical protein  60.38 
 
 		 122 aa  131  3e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3500  hypothetical protein  67.31 
 
 		 120 aa  130  7.999999999999999e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.395821  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2464  protein of unknown function DUF1304  59 
 
 		 116 aa  128  3e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.283344  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3066  protein of unknown function DUF1304  64 
 
 		 116 aa  123  8.000000000000001e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.269223 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01662  hypothetical protein  61.54 
 
 		 117 aa  123  1e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.987782  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1051  hypothetical protein  54.55 
 
 		 123 aa  122  2e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.555272  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0584  protein of unknown function DUF1304  60.38 
 
 		 120 aa  118  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1871  hypothetical protein  66.67 
 
 		 118 aa  118  3e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.33795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1370  protein of unknown function DUF1304  51.72 
 
 		 120 aa  113  8.999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0191403  normal  0.202643 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0699  protein of unknown function DUF1304  56.86 
 
 		 120 aa  109  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0455556  normal  0.920773 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4228  protein of unknown function DUF1304  55.24 
 
 		 120 aa  107  7.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.728576  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4116  protein of unknown function DUF1304  55.24 
 
 		 120 aa  107  7.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.532223  normal  0.15572 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2834  hypothetical protein  52.68 
 
 		 117 aa  102  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.931347  hitchhiker  0.00331454 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6325  protein of unknown function DUF1304  50.93 
 
 		 129 aa  102  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1349  protein of unknown function DUF1304  52.34 
 
 		 120 aa  100  5e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3957  protein of unknown function DUF1304  49.56 
 
 		 120 aa  100  8e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.232243 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3402  hypothetical protein  43.1 
 
 		 123 aa  99  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1841  hypothetical protein  43.1 
 
 		 123 aa  99  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.995737 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1705  protein of unknown function DUF1304  53.21 
 
 		 117 aa  98.6  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.449523  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05690  hypothetical protein  50.48 
 
 		 120 aa  98.6  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04765  hypothetical protein  50.48 
 
 		 120 aa  98.6  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0975  hypothetical protein  44.64 
 
 		 123 aa  97.4  6e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000480438  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0977  hypothetical protein  43.75 
 
 		 123 aa  96.3  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.47495  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1160  hypothetical protein  43.75 
 
 		 123 aa  95.5  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0989  hypothetical protein  43.75 
 
 		 123 aa  95.5  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1059  hypothetical protein  43.75 
 
 		 123 aa  95.5  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1143  hypothetical protein  43.75 
 
 		 123 aa  95.1  3e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1223  hypothetical protein  43.75 
 
 		 123 aa  94.4  5e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1910  hypothetical protein  42.86 
 
 		 124 aa  78.2  0.00000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.724765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1971  hypothetical protein  37.72 
 
 		 120 aa  74.7  0.0000000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000233421  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1561  hypothetical protein  30.7 
 
 		 119 aa  62.4  0.000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.513127  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12650  predicted membrane protein  46.77 
 
 		 133 aa  59.3  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.725167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0374  hypothetical protein  43.24 
 
 		 129 aa  57.8  0.00000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.111718  normal  0.385258 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2133  hypothetical protein  34.17 
 
 		 118 aa  57.4  0.00000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3823  hypothetical protein  39.19 
 
 		 128 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.314285 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2576  hypothetical protein  40.58 
 
 		 128 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1508  hypothetical protein  37.04 
 
 		 117 aa  53.1  0.000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4598  protein of unknown function DUF1304  45.28 
 
 		 128 aa  51.6  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0276  hypothetical protein  41.54 
 
 		 130 aa  52  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.75531  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2180  protein of unknown function DUF1304  45.16 
 
 		 127 aa  51.2  0.000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.299642  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0949  hypothetical protein  34.96 
 
 		 119 aa  47.8  0.00006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.996626  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0508  protein of unknown function DUF1304  45.28 
 
 		 134 aa  47.8  0.00006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1034  hypothetical protein  33.64 
 
 		 113 aa  47.4  0.00006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0608505  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0073  protein of unknown function DUF1304  40 
 
 		 126 aa  47  0.00008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1921  protein of unknown function DUF1304  47.83 
 
 		 128 aa  46.6  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.980411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1666  hypothetical protein  34.19 
 
 		 118 aa  45.4  0.0003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0443  hypothetical protein  25.44 
 
 		 119 aa  43.9  0.0007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0455  hypothetical protein  25.44 
 
 		 119 aa  43.9  0.0007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.720124  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08980  predicted membrane protein  31.93 
 
 		 120 aa  42.4  0.002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.482637 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1459  protein of unknown function DUF1304  38.89 
 
 		 127 aa  42.4  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1637  hypothetical protein  33.63 
 
 		 143 aa  41.2  0.005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0253  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>