56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_1871 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_1871  hypothetical protein  100 
 
 
118 aa  228  1e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.33795  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7649  hypothetical protein  71.3 
 
 
119 aa  158  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.557144 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1367  hypothetical protein  60.19 
 
 
119 aa  138  3e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000537574 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1973  hypothetical protein  62.28 
 
 
116 aa  138  3e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3500  hypothetical protein  73.33 
 
 
120 aa  136  7.999999999999999e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.395821  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0648  hypothetical protein  67.29 
 
 
120 aa  136  8.999999999999999e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2464  protein of unknown function DUF1304  60.4 
 
 
116 aa  129  1.0000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.283344  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0037  hypothetical protein  58.82 
 
 
122 aa  124  5e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3066  protein of unknown function DUF1304  61.46 
 
 
116 aa  119  9.999999999999999e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.269223 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2834  hypothetical protein  59.32 
 
 
117 aa  115  3e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.931347  hitchhiker  0.00331454 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4838  hypothetical protein  55.96 
 
 
123 aa  112  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01662  hypothetical protein  62.11 
 
 
117 aa  112  2.0000000000000002e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.987782  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0584  protein of unknown function DUF1304  59.26 
 
 
120 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1051  hypothetical protein  53.98 
 
 
123 aa  112  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.555272  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1370  protein of unknown function DUF1304  52.1 
 
 
120 aa  111  3e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0191403  normal  0.202643 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4116  protein of unknown function DUF1304  54.63 
 
 
120 aa  109  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.532223  normal  0.15572 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4228  protein of unknown function DUF1304  54.63 
 
 
120 aa  109  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.728576  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0699  protein of unknown function DUF1304  56.73 
 
 
120 aa  103  8e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0455556  normal  0.920773 
 
 
-
 
NC_003296  RS05690  hypothetical protein  51.85 
 
 
120 aa  103  9e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS04765  hypothetical protein  51.85 
 
 
120 aa  103  9e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1705  protein of unknown function DUF1304  53.33 
 
 
117 aa  100  6e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.449523  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6325  protein of unknown function DUF1304  53.7 
 
 
129 aa  99  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1841  hypothetical protein  44.54 
 
 
123 aa  96.3  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.995737 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3402  hypothetical protein  44.54 
 
 
123 aa  96.3  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3957  protein of unknown function DUF1304  51.89 
 
 
120 aa  95.9  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.232243 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1349  protein of unknown function DUF1304  51.4 
 
 
120 aa  92  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0977  hypothetical protein  43.24 
 
 
123 aa  89  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.47495  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1160  hypothetical protein  43.24 
 
 
123 aa  88.2  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1059  hypothetical protein  43.24 
 
 
123 aa  88.2  3e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0989  hypothetical protein  43.24 
 
 
123 aa  88.2  3e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1143  hypothetical protein  43.24 
 
 
123 aa  87.8  4e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0975  hypothetical protein  42.34 
 
 
123 aa  86.7  9e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000480438  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1223  hypothetical protein  42.34 
 
 
123 aa  85.9  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1910  hypothetical protein  45.71 
 
 
124 aa  76.6  0.0000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.724765  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1971  hypothetical protein  36.61 
 
 
120 aa  69.3  0.00000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000233421  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0949  hypothetical protein  34.75 
 
 
119 aa  61.6  0.000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.996626  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2133  hypothetical protein  35 
 
 
118 aa  57.4  0.00000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12650  predicted membrane protein  45.61 
 
 
133 aa  53.5  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.725167  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1666  hypothetical protein  33.91 
 
 
118 aa  52.8  0.000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2180  protein of unknown function DUF1304  50 
 
 
127 aa  52.4  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.299642  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0073  protein of unknown function DUF1304  36.78 
 
 
126 aa  50.4  0.000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0276  hypothetical protein  47.37 
 
 
130 aa  50.4  0.000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.75531  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1561  hypothetical protein  31.48 
 
 
119 aa  50.1  0.00001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.513127  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3823  hypothetical protein  37.35 
 
 
128 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.314285 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2576  hypothetical protein  40.98 
 
 
128 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0374  hypothetical protein  39.02 
 
 
129 aa  48.5  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.111718  normal  0.385258 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0508  protein of unknown function DUF1304  47.17 
 
 
134 aa  48.1  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4598  protein of unknown function DUF1304  41.51 
 
 
128 aa  47.8  0.00006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1921  protein of unknown function DUF1304  46.67 
 
 
128 aa  47  0.00008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.980411  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0455  hypothetical protein  24.17 
 
 
119 aa  45.8  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.720124  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0443  hypothetical protein  24.17 
 
 
119 aa  45.8  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08980  predicted membrane protein  34.58 
 
 
120 aa  43.9  0.0008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.482637 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1508  hypothetical protein  32.04 
 
 
117 aa  43.5  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1459  protein of unknown function DUF1304  39.06 
 
 
127 aa  43.5  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1034  hypothetical protein  28.3 
 
 
113 aa  42  0.003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0608505  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1637  hypothetical protein  34.23 
 
 
143 aa  40  0.01  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0253  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>