30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1459 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1459  protein of unknown function DUF1304  100 
 
 		 127 aa  239  7e-63  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4598  protein of unknown function DUF1304  60.18 
 
 		 128 aa  129  1.0000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2576  hypothetical protein  54.76 
 
 		 128 aa  126  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2180  protein of unknown function DUF1304  58.41 
 
 		 127 aa  119  9.999999999999999e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.299642  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3823  hypothetical protein  55.74 
 
 		 128 aa  117  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.314285 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0374  hypothetical protein  58.56 
 
 		 129 aa  114  5e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.111718  normal  0.385258 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0073  protein of unknown function DUF1304  49.11 
 
 		 126 aa  112  2.0000000000000002e-24  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1921  protein of unknown function DUF1304  58 
 
 		 128 aa  99.4  1e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.980411  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12650  predicted membrane protein  51.43 
 
 		 133 aa  98.2  3e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.725167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0276  hypothetical protein  50 
 
 		 130 aa  90.9  5e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.75531  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0508  protein of unknown function DUF1304  51.35 
 
 		 134 aa  89  2e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4838  hypothetical protein  44.12 
 
 		 123 aa  58.5  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1705  protein of unknown function DUF1304  59.57 
 
 		 117 aa  57  0.00000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.449523  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1973  hypothetical protein  50.91 
 
 		 116 aa  55.5  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1051  hypothetical protein  50 
 
 		 123 aa  49.7  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.555272  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7649  hypothetical protein  44.64 
 
 		 119 aa  49.7  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.557144 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1367  hypothetical protein  35.71 
 
 		 119 aa  47.8  0.00005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000537574 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2464  protein of unknown function DUF1304  42.62 
 
 		 116 aa  47.8  0.00006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.283344  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0648  hypothetical protein  39.71 
 
 		 120 aa  47.4  0.00007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0699  protein of unknown function DUF1304  39.29 
 
 		 120 aa  44.3  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0455556  normal  0.920773 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01662  hypothetical protein  43.64 
 
 		 117 aa  43.9  0.0007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.987782  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1349  protein of unknown function DUF1304  33.33 
 
 		 120 aa  43.9  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08980  predicted membrane protein  36.17 
 
 		 120 aa  43.9  0.0008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.482637 
 
 
-
 
NC_003296  RS05690  hypothetical protein  41.82 
 
 		 120 aa  42.7  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3500  hypothetical protein  40 
 
 		 120 aa  42.7  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.395821  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04765  hypothetical protein  41.82 
 
 		 120 aa  42.7  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3066  protein of unknown function DUF1304  42.86 
 
 		 116 aa  42.7  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.269223 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4228  protein of unknown function DUF1304  41.82 
 
 		 120 aa  42  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.728576  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4116  protein of unknown function DUF1304  41.82 
 
 		 120 aa  42  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.532223  normal  0.15572 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3957  protein of unknown function DUF1304  38.46 
 
 		 120 aa  40.4  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.232243 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>