39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_12650 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_12650  predicted membrane protein  100 
 
 		 133 aa  256  9e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.725167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4598  protein of unknown function DUF1304  59.63 
 
 		 128 aa  121  4e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3823  hypothetical protein  50 
 
 		 128 aa  110  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.314285 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2576  hypothetical protein  50 
 
 		 128 aa  108  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1459  protein of unknown function DUF1304  51.82 
 
 		 127 aa  103  1e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0073  protein of unknown function DUF1304  41.73 
 
 		 126 aa  97.1  7e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0374  hypothetical protein  54.05 
 
 		 129 aa  94.4  5e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.111718  normal  0.385258 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1921  protein of unknown function DUF1304  54.37 
 
 		 128 aa  92.8  1e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.980411  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2180  protein of unknown function DUF1304  46.15 
 
 		 127 aa  92.4  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.299642  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0276  hypothetical protein  49.14 
 
 		 130 aa  90.9  5e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.75531  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0508  protein of unknown function DUF1304  50.43 
 
 		 134 aa  89.7  1e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1973  hypothetical protein  56.6 
 
 		 116 aa  62.4  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0648  hypothetical protein  42.67 
 
 		 120 aa  60.5  0.000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4838  hypothetical protein  49.21 
 
 		 123 aa  60.1  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01662  hypothetical protein  51.52 
 
 		 117 aa  59.7  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.987782  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1051  hypothetical protein  52.54 
 
 		 123 aa  58.5  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.555272  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7649  hypothetical protein  50.88 
 
 		 119 aa  58.5  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.557144 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1367  hypothetical protein  45.16 
 
 		 119 aa  56.2  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000537574 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3500  hypothetical protein  50.75 
 
 		 120 aa  56.6  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.395821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1705  protein of unknown function DUF1304  50.91 
 
 		 117 aa  53.9  0.0000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.449523  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3066  protein of unknown function DUF1304  49.06 
 
 		 116 aa  51.2  0.000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.269223 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2464  protein of unknown function DUF1304  40.85 
 
 		 116 aa  50.8  0.000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.283344  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0037  hypothetical protein  44.44 
 
 		 122 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0699  protein of unknown function DUF1304  44.44 
 
 		 120 aa  44.7  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0455556  normal  0.920773 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0975  hypothetical protein  35.44 
 
 		 123 aa  44.7  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000480438  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04765  hypothetical protein  41.33 
 
 		 120 aa  44.3  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05690  hypothetical protein  41.33 
 
 		 120 aa  44.3  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0584  protein of unknown function DUF1304  46.03 
 
 		 120 aa  43.9  0.0007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2834  hypothetical protein  44.26 
 
 		 117 aa  43.5  0.0009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.931347  hitchhiker  0.00331454 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4116  protein of unknown function DUF1304  43.1 
 
 		 120 aa  43.1  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.532223  normal  0.15572 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1871  hypothetical protein  44.19 
 
 		 118 aa  43.1  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.33795  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4228  protein of unknown function DUF1304  43.1 
 
 		 120 aa  43.1  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.728576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1143  hypothetical protein  34.18 
 
 		 123 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1059  hypothetical protein  34.18 
 
 		 123 aa  42.7  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0977  hypothetical protein  34.18 
 
 		 123 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.47495  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0989  hypothetical protein  34.18 
 
 		 123 aa  42.7  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0441  hypothetical protein  28.71 
 
 		 132 aa  41.2  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1160  hypothetical protein  32.91 
 
 		 123 aa  41.2  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1223  hypothetical protein  34.18 
 
 		 123 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>