32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_2576 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_2576  hypothetical protein  100 
 
 
128 aa  242  9.999999999999999e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3823  hypothetical protein  75.78 
 
 
128 aa  181  3e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.314285 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4598  protein of unknown function DUF1304  65.18 
 
 
128 aa  138  3e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2180  protein of unknown function DUF1304  54.17 
 
 
127 aa  121  3e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.299642  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1459  protein of unknown function DUF1304  56.25 
 
 
127 aa  120  6e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0073  protein of unknown function DUF1304  49.17 
 
 
126 aa  118  3.9999999999999996e-26  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1921  protein of unknown function DUF1304  62.93 
 
 
128 aa  115  9.999999999999999e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.980411  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0374  hypothetical protein  52.34 
 
 
129 aa  110  7.000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.111718  normal  0.385258 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0276  hypothetical protein  54.31 
 
 
130 aa  107  7.000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.75531  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12650  predicted membrane protein  49.52 
 
 
133 aa  99  2e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.725167  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0508  protein of unknown function DUF1304  52.25 
 
 
134 aa  87.8  5e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1705  protein of unknown function DUF1304  39.09 
 
 
117 aa  63.9  0.0000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.449523  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4838  hypothetical protein  35.54 
 
 
123 aa  61.2  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1051  hypothetical protein  46.55 
 
 
123 aa  55.5  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.555272  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1973  hypothetical protein  52.08 
 
 
116 aa  54.7  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0648  hypothetical protein  40.58 
 
 
120 aa  53.9  0.0000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7649  hypothetical protein  46.3 
 
 
119 aa  53.5  0.0000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.557144 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01662  hypothetical protein  45.71 
 
 
117 aa  53.5  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.987782  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1367  hypothetical protein  36.51 
 
 
119 aa  50.8  0.000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000537574 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0699  protein of unknown function DUF1304  40 
 
 
120 aa  48.9  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0455556  normal  0.920773 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3066  protein of unknown function DUF1304  46.15 
 
 
116 aa  48.5  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.269223 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4228  protein of unknown function DUF1304  41.18 
 
 
120 aa  48.9  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.728576  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4116  protein of unknown function DUF1304  41.18 
 
 
120 aa  48.9  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.532223  normal  0.15572 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2464  protein of unknown function DUF1304  40.32 
 
 
116 aa  46.6  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.283344  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04765  hypothetical protein  41.54 
 
 
120 aa  46.2  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05690  hypothetical protein  41.54 
 
 
120 aa  46.2  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0037  hypothetical protein  42 
 
 
122 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3500  hypothetical protein  47.17 
 
 
120 aa  43.9  0.0007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.395821  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2834  hypothetical protein  46.67 
 
 
117 aa  42.4  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.931347  hitchhiker  0.00331454 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2764  hypothetical protein  26.92 
 
 
125 aa  40.8  0.006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000986388 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6325  protein of unknown function DUF1304  40 
 
 
129 aa  40.8  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2133  hypothetical protein  35.37 
 
 
118 aa  40  0.01  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>