28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_0508 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_0508  protein of unknown function DUF1304  100 
 
 
134 aa  263  5e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0276  hypothetical protein  75.21 
 
 
130 aa  169  1e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.75531  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3823  hypothetical protein  52.38 
 
 
128 aa  110  5e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.314285 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4598  protein of unknown function DUF1304  53.57 
 
 
128 aa  107  5e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2576  hypothetical protein  52.38 
 
 
128 aa  105  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1459  protein of unknown function DUF1304  50.89 
 
 
127 aa  97.4  6e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12650  predicted membrane protein  49.53 
 
 
133 aa  90.1  8e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.725167  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2180  protein of unknown function DUF1304  44 
 
 
127 aa  87.8  4e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.299642  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0374  hypothetical protein  43.08 
 
 
129 aa  83.6  9e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.111718  normal  0.385258 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0073  protein of unknown function DUF1304  42.37 
 
 
126 aa  78.6  0.00000000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1921  protein of unknown function DUF1304  49.06 
 
 
128 aa  76.3  0.0000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.980411  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7649  hypothetical protein  54 
 
 
119 aa  53.5  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.557144 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4838  hypothetical protein  42.65 
 
 
123 aa  53.1  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1973  hypothetical protein  44.12 
 
 
116 aa  52.8  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01662  hypothetical protein  47.76 
 
 
117 aa  50.4  0.000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.987782  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0648  hypothetical protein  41.18 
 
 
120 aa  49.7  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1051  hypothetical protein  44.9 
 
 
123 aa  47  0.00009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.555272  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1367  hypothetical protein  43.08 
 
 
119 aa  46.6  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000537574 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0037  hypothetical protein  46.3 
 
 
122 aa  45.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0441  hypothetical protein  34 
 
 
132 aa  44.7  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2834  hypothetical protein  42.19 
 
 
117 aa  44.3  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.931347  hitchhiker  0.00331454 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3500  hypothetical protein  45.21 
 
 
120 aa  44.7  0.0005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.395821  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3066  protein of unknown function DUF1304  41.18 
 
 
116 aa  43.5  0.0009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.269223 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1020  hypothetical protein  32.35 
 
 
135 aa  43.1  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0584  protein of unknown function DUF1304  50 
 
 
120 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0699  protein of unknown function DUF1304  43.1 
 
 
120 aa  42.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0455556  normal  0.920773 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2464  protein of unknown function DUF1304  40.3 
 
 
116 aa  42  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.283344  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1705  protein of unknown function DUF1304  43.1 
 
 
117 aa  42  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.449523  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>