51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_4228 on replicon NC_012857
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010678  Rpic_4116  protein of unknown function DUF1304  100 
 
 		 120 aa  234  3e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.532223  normal  0.15572 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4228  protein of unknown function DUF1304  100 
 
 		 120 aa  234  3e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.728576  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04765  hypothetical protein  88.33 
 
 		 120 aa  212  9.999999999999999e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05690  hypothetical protein  88.33 
 
 		 120 aa  212  9.999999999999999e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7649  hypothetical protein  51.82 
 
 		 119 aa  107  5e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.557144 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1051  hypothetical protein  52.14 
 
 		 123 aa  103  7e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.555272  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0037  hypothetical protein  54.55 
 
 		 122 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1705  protein of unknown function DUF1304  58.65 
 
 		 117 aa  99.8  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.449523  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1370  protein of unknown function DUF1304  46.96 
 
 		 120 aa  99.4  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0191403  normal  0.202643 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1973  hypothetical protein  54 
 
 		 116 aa  98.6  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0648  hypothetical protein  53.68 
 
 		 120 aa  97.1  7e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3957  protein of unknown function DUF1304  50.49 
 
 		 120 aa  96.3  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.232243 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3066  protein of unknown function DUF1304  52.58 
 
 		 116 aa  95.9  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.269223 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1871  hypothetical protein  54.9 
 
 		 118 aa  94.4  5e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.33795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4838  hypothetical protein  46.15 
 
 		 123 aa  94  7e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01662  hypothetical protein  54.46 
 
 		 117 aa  91.3  4e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.987782  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0584  protein of unknown function DUF1304  54.17 
 
 		 120 aa  89.4  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1349  protein of unknown function DUF1304  49.06 
 
 		 120 aa  87.8  5e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2464  protein of unknown function DUF1304  48.42 
 
 		 116 aa  87.4  6e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.283344  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0699  protein of unknown function DUF1304  51.09 
 
 		 120 aa  85.9  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0455556  normal  0.920773 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1367  hypothetical protein  44 
 
 		 119 aa  84.7  4e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000537574 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1910  hypothetical protein  45.54 
 
 		 124 aa  80.5  0.000000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.724765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6325  protein of unknown function DUF1304  45.37 
 
 		 129 aa  79  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3500  hypothetical protein  51.04 
 
 		 120 aa  79.3  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.395821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2834  hypothetical protein  49.07 
 
 		 117 aa  75.5  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.931347  hitchhiker  0.00331454 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3402  hypothetical protein  39.62 
 
 		 123 aa  67.4  0.00000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1841  hypothetical protein  39.62 
 
 		 123 aa  67.4  0.00000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.995737 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0989  hypothetical protein  38.61 
 
 		 123 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1059  hypothetical protein  38.61 
 
 		 123 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1160  hypothetical protein  37.62 
 
 		 123 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0977  hypothetical protein  37.62 
 
 		 123 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.47495  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1143  hypothetical protein  37.62 
 
 		 123 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0975  hypothetical protein  37.62 
 
 		 123 aa  62.8  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000480438  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1223  hypothetical protein  37.62 
 
 		 123 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2180  protein of unknown function DUF1304  48.15 
 
 		 127 aa  57.8  0.00000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.299642  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0374  hypothetical protein  34.78 
 
 		 129 aa  49.7  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.111718  normal  0.385258 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1971  hypothetical protein  31.37 
 
 		 120 aa  48.9  0.00002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000233421  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2576  hypothetical protein  41.18 
 
 		 128 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1921  protein of unknown function DUF1304  54.55 
 
 		 128 aa  48.5  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.980411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3823  hypothetical protein  37.35 
 
 		 128 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.314285 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0073  protein of unknown function DUF1304  39.66 
 
 		 126 aa  47.4  0.00007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2133  hypothetical protein  33.94 
 
 		 118 aa  47.4  0.00008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1561  hypothetical protein  30.51 
 
 		 119 aa  46.2  0.0002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.513127  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1034  hypothetical protein  35.71 
 
 		 113 aa  44.7  0.0004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0608505  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1508  hypothetical protein  44.62 
 
 		 117 aa  44.7  0.0005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0949  hypothetical protein  30.25 
 
 		 119 aa  44.3  0.0005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.996626  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12650  predicted membrane protein  43.1 
 
 		 133 aa  43.5  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.725167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4598  protein of unknown function DUF1304  34.94 
 
 		 128 aa  41.6  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1637  hypothetical protein  31.09 
 
 		 143 aa  42  0.003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0253  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1459  protein of unknown function DUF1304  40.74 
 
 		 127 aa  40.8  0.006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0276  hypothetical protein  41.07 
 
 		 130 aa  40.4  0.008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.75531  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>