32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3823 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_3823  hypothetical protein  100 
 
 
128 aa  242  9.999999999999999e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.314285 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2576  hypothetical protein  75.78 
 
 
128 aa  181  3e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4598  protein of unknown function DUF1304  58.56 
 
 
128 aa  128  2.0000000000000002e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0073  protein of unknown function DUF1304  51.67 
 
 
126 aa  127  7.000000000000001e-29  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2180  protein of unknown function DUF1304  52.54 
 
 
127 aa  117  3.9999999999999996e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.299642  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1459  protein of unknown function DUF1304  56.25 
 
 
127 aa  113  7.999999999999999e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1921  protein of unknown function DUF1304  61 
 
 
128 aa  107  4.0000000000000004e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.980411  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0374  hypothetical protein  54.05 
 
 
129 aa  104  5e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.111718  normal  0.385258 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0276  hypothetical protein  51.33 
 
 
130 aa  102  2e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.75531  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12650  predicted membrane protein  48.57 
 
 
133 aa  95.9  2e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.725167  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0508  protein of unknown function DUF1304  51.35 
 
 
134 aa  92.4  2e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4838  hypothetical protein  46.38 
 
 
123 aa  59.7  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1705  protein of unknown function DUF1304  57.14 
 
 
117 aa  58.5  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.449523  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1973  hypothetical protein  48.28 
 
 
116 aa  57  0.00000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2764  hypothetical protein  30.39 
 
 
125 aa  56.6  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000986388 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1051  hypothetical protein  46.3 
 
 
123 aa  55.5  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.555272  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0648  hypothetical protein  39.19 
 
 
120 aa  54.7  0.0000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1367  hypothetical protein  34.67 
 
 
119 aa  53.9  0.0000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000537574 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01662  hypothetical protein  46.67 
 
 
117 aa  53.1  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.987782  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7649  hypothetical protein  50 
 
 
119 aa  52.8  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.557144 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2464  protein of unknown function DUF1304  50 
 
 
116 aa  51.6  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.283344  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0699  protein of unknown function DUF1304  38.16 
 
 
120 aa  50.1  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0455556  normal  0.920773 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3066  protein of unknown function DUF1304  50 
 
 
116 aa  49.3  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.269223 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4228  protein of unknown function DUF1304  37.35 
 
 
120 aa  47.8  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.728576  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4116  protein of unknown function DUF1304  37.35 
 
 
120 aa  47.8  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.532223  normal  0.15572 
 
 
-
 
NC_003296  RS04765  hypothetical protein  37.36 
 
 
120 aa  47  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05690  hypothetical protein  37.36 
 
 
120 aa  47  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0037  hypothetical protein  44 
 
 
122 aa  43.9  0.0007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6325  protein of unknown function DUF1304  39.34 
 
 
129 aa  43.1  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2834  hypothetical protein  51.85 
 
 
117 aa  42.4  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.931347  hitchhiker  0.00331454 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3500  hypothetical protein  49.06 
 
 
120 aa  42.4  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.395821  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1643  hypothetical protein  34.78 
 
 
135 aa  40  0.01  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0753951  normal  0.111935 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>