45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E2586 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E2586  inner membrane protein YbhI  100 
 
 		 103 aa  198  1.9999999999999998e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2892  anion transporter  93.2 
 
 		 477 aa  187  4e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.151263 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2872  anion transporter  93.2 
 
 		 477 aa  187  4e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.675436  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0874  anion transporter  93.2 
 
 		 477 aa  187  4e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0797  anion transporter  93.2 
 
 		 477 aa  187  4e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0516558  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0824  anion transporter  93.2 
 
 		 477 aa  187  4e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.595752  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0793  anion transporter  91.26 
 
 		 477 aa  182  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.575691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4122  anion transporter  43.56 
 
 		 475 aa  82.8  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0092  divalent anion:Na+ symporter (DASS) family protein  43.56 
 
 		 475 aa  82.8  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0091  divalent anion:Na+ symporter family protein  43.56 
 
 		 475 aa  82.8  0.000000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0015  anion transporter  37.11 
 
 		 475 aa  62.4  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00186698  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0658  sodium:sulfate symporter family protein  32.48 
 
 		 487 aa  60.5  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0731  sodium:sulfate symporter family protein  32.48 
 
 		 487 aa  60.5  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0672  sodium:sulfate symporter family protein  33.04 
 
 		 487 aa  59.7  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0777  sodium:sulfate symporter family protein  31.62 
 
 		 487 aa  58.9  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.406229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3165  anion transporter  34.21 
 
 		 487 aa  58.5  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0663  sodium:sulfate symporter family protein  32.17 
 
 		 487 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3032  anion transporter  32.17 
 
 		 487 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0634  citrate transporter  32.17 
 
 		 487 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00569  hypothetical protein  32.17 
 
 		 487 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3013  anion transporter  32.17 
 
 		 487 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0421609  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00580  citrate:succinate antiporter  32.17 
 
 		 487 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02933  predicted tartrate:succinate antiporter  30.28 
 
 		 487 aa  55.5  0.0000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00145949  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02883  hypothetical protein  30.28 
 
 		 487 aa  55.5  0.0000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00124392  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0636  anion transporter  30.28 
 
 		 487 aa  55.5  0.0000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000570216  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0637  anion transporter  30.28 
 
 		 487 aa  55.5  0.0000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000275084  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1274  anion transporter  37.14 
 
 		 469 aa  54.7  0.0000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4375  anion transporter  30.28 
 
 		 487 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00267264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3243  anion transporter  30.28 
 
 		 487 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000262372  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3527  anion transporter  30.28 
 
 		 487 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000412852  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3356  anion transporter  30.28 
 
 		 487 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000525621  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4103  anion transporter  29.41 
 
 		 470 aa  52.8  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1490  divalent anion:Na+ symporter (DASS) family protein  34.44 
 
 		 466 aa  51.6  0.000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2559  anion transporter  31.62 
 
 		 502 aa  50.8  0.000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.133462  normal  0.0525533 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0700  sodium:sulfate symporter family protein  33.33 
 
 		 476 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0631  sodium:sulfate symporter family protein  33.33 
 
 		 476 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0037  anion transporter  29.41 
 
 		 470 aa  47  0.00008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0043  anion transporter  29.41 
 
 		 470 aa  47  0.00008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2725  anion transporter  28.87 
 
 		 469 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0162733 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26970  anion transporter  30.77 
 
 		 517 aa  46.2  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3912  anion transporter  29.09 
 
 		 483 aa  46.2  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0347  anion transporter  31.07 
 
 		 467 aa  45.4  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0104  anion transporter  30.85 
 
 		 476 aa  43.1  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2412  anion transporter  32.67 
 
 		 481 aa  41.2  0.005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.570521  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1482  anion transporter  32.5 
 
 		 473 aa  40.4  0.008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.168166  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>