47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3950 on replicon NC_009426
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009426  Saro_3950  hypothetical protein  100 
 
 		 182 aa  371  1e-102  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5186  hypothetical protein  50.64 
 
 		 154 aa  149  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.093904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5174  hypothetical protein  50.64 
 
 		 183 aa  148  5e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0282662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5244  hypothetical protein  50.98 
 
 		 152 aa  145  4.0000000000000006e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5236  hypothetical protein  48.84 
 
 		 174 aa  144  7.0000000000000006e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.642352 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9175  hypothetical protein  40 
 
 		 118 aa  65.5  0.0000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.378667  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0185  hypothetical protein  34.55 
 
 		 183 aa  58.5  0.00000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.575618 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5046  hypothetical protein  28.43 
 
 		 99 aa  52.4  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.879598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5043  hypothetical protein  28.43 
 
 		 99 aa  52.4  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4760  hypothetical protein  31.48 
 
 		 116 aa  50.8  0.000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0216684  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2862  hypothetical protein  29.09 
 
 		 108 aa  48.9  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0535731  normal  0.116122 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2134  hypothetical protein  30.63 
 
 		 107 aa  47  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.909083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0840  hypothetical protein  27.88 
 
 		 104 aa  46.6  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.128749  hitchhiker  0.00366118 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7724  hypothetical protein  30.63 
 
 		 169 aa  46.6  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0566039  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0529  hypothetical protein  28.44 
 
 		 108 aa  46.6  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.202922  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5532  protein of unknown function DUF736  30.28 
 
 		 105 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0325205 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3021  hypothetical protein  30.91 
 
 		 107 aa  46.6  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3070  protein of unknown function DUF736  30.91 
 
 		 107 aa  46.2  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0715  hypothetical protein  29.09 
 
 		 108 aa  46.2  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.319092  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3810  hypothetical protein  30.39 
 
 		 103 aa  45.4  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.789532  normal  0.512739 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3715  hypothetical protein  28.97 
 
 		 105 aa  45.4  0.0005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.473433  normal  0.0762661 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6057  hypothetical protein  33.33 
 
 		 105 aa  45.1  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2341  hypothetical protein  30.91 
 
 		 107 aa  45.1  0.0006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.201148  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8119  hypothetical protein  27.88 
 
 		 100 aa  44.7  0.0007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00762818  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8111  hypothetical protein  27.88 
 
 		 100 aa  44.7  0.0007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0332077  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0361  hypothetical protein  31.19 
 
 		 110 aa  44.7  0.0007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9572  hypothetical protein  30.84 
 
 		 105 aa  43.9  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.155114  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4484  hypothetical protein  30.84 
 
 		 116 aa  43.5  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.147043  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3536  hypothetical protein  28.32 
 
 		 139 aa  42.7  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.506052  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1873  protein of unknown function DUF736  27.62 
 
 		 104 aa  42.7  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2628  hypothetical protein  28.04 
 
 		 105 aa  42.7  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1199  hypothetical protein  28.32 
 
 		 139 aa  42.7  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0755  hypothetical protein  29.63 
 
 		 111 aa  42.7  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.60264 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2803  protein of unknown function DUF736  32.43 
 
 		 111 aa  42.4  0.004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0764  hypothetical protein  28.7 
 
 		 108 aa  42  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1518  hypothetical protein  29.2 
 
 		 107 aa  42  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.54718  normal  0.0915723 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0280  hypothetical protein  28.3 
 
 		 115 aa  42  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2791  protein of unknown function DUF736  28.7 
 
 		 108 aa  42  0.005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.912107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1484  hypothetical protein  31.48 
 
 		 107 aa  42  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3561  hypothetical protein  29.63 
 
 		 107 aa  41.6  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3524  hypothetical protein  29.36 
 
 		 120 aa  41.2  0.008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.898336  normal  0.799269 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1248  hypothetical protein  27.52 
 
 		 117 aa  41.2  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.021102 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1211  hypothetical protein  29.36 
 
 		 120 aa  41.2  0.008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2644  hypothetical protein  27.52 
 
 		 117 aa  41.2  0.009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.614359  normal  0.0333856 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1041  protein of unknown function DUF736  31.48 
 
 		 108 aa  41.2  0.009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0683424  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1480  hypothetical protein  27.62 
 
 		 104 aa  41.2  0.009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.418116  normal  0.814908 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3555  hypothetical protein  30.91 
 
 		 133 aa  40.8  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>