15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1213 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_1213  hypothetical protein  100 
 
 
908 aa  1779    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1757  hypothetical protein  25.39 
 
 
930 aa  214  4.9999999999999996e-54  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1285  hypothetical protein  24.53 
 
 
934 aa  207  6e-52  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5310  hypothetical protein  26.06 
 
 
803 aa  184  8.000000000000001e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.651081  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0697  hypothetical protein  26 
 
 
972 aa  160  1e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.418548  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2860  hypothetical protein  25.75 
 
 
932 aa  158  4e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.297998 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0613  hypothetical protein  21.95 
 
 
1043 aa  140  1e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0453  OmpA/MotB domain-containing protein  24.45 
 
 
993 aa  95.9  3e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.164289  hitchhiker  0.000000000838864 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2567  hypothetical protein  21.62 
 
 
1020 aa  89.4  3e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00980048 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10368  hypothetical protein  21.14 
 
 
878 aa  82.4  0.00000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1303  sporulation related  22.74 
 
 
1096 aa  62.8  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2872  hypothetical protein  20.74 
 
 
876 aa  59.3  0.0000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3056  hypothetical protein  24.07 
 
 
874 aa  58.5  0.0000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.136617 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0585  cell wall anchor domain-containing protein  29.14 
 
 
1337 aa  44.7  0.008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0599  cell wall anchor domain-containing protein  29.14 
 
 
1337 aa  44.7  0.008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>