13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_2872 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_2872  hypothetical protein  100 
 
 		 876 aa  1797    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2567  hypothetical protein  47.34 
 
 		 1020 aa  811    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00980048 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5310  hypothetical protein  24.45 
 
 		 803 aa  147  1e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.651081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1757  hypothetical protein  20.56 
 
 		 930 aa  125  3e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1285  hypothetical protein  21.31 
 
 		 934 aa  121  6e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0697  hypothetical protein  21.99 
 
 		 972 aa  112  4.0000000000000004e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.418548  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0613  hypothetical protein  28.29 
 
 		 1043 aa  107  1e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2860  hypothetical protein  24.63 
 
 		 932 aa  81.6  0.00000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.297998 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1303  sporulation related  19.15 
 
 		 1096 aa  73.6  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0453  OmpA/MotB domain-containing protein  35.35 
 
 		 993 aa  63.9  0.00000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.164289  hitchhiker  0.000000000838864 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1213  hypothetical protein  20.74 
 
 		 908 aa  59.3  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2393  hypothetical protein  44 
 
 		 1809 aa  53.5  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4918  hypothetical protein  31.73 
 
 		 880 aa  49.3  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0265175  normal  0.302203 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>