More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_0453 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010644  Emin_0453  OmpA/MotB domain-containing protein  100 
 
 
993 aa  2032    Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.164289  hitchhiker  0.000000000838864 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0613  hypothetical protein  23.72 
 
 
1043 aa  105  4e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1757  hypothetical protein  21.31 
 
 
930 aa  104  1e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1213  hypothetical protein  24.36 
 
 
908 aa  96.3  2e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5310  hypothetical protein  25.34 
 
 
803 aa  85.1  0.000000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.651081  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2860  hypothetical protein  28.93 
 
 
932 aa  82  0.00000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.297998 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4592  OmpA/MotB domain-containing protein  38.46 
 
 
296 aa  80.5  0.0000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  35.92 
 
 
294 aa  77.4  0.000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1285  hypothetical protein  23.26 
 
 
934 aa  76.6  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1121  OmpA/MotB domain protein  37.38 
 
 
230 aa  76.3  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.372182  hitchhiker  0.00000554839 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0697  OmpA/MotB domain-containing protein  38.46 
 
 
487 aa  76.3  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1157  OmpA/MotB domain-containing protein  37.38 
 
 
230 aa  76.3  0.000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.239161  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4295  OmpA/MotB domain-containing protein  37.38 
 
 
230 aa  75.9  0.000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.331314  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1316  OmpA/MotB  37.5 
 
 
260 aa  75.5  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00375724 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1220  OmpA/MotB  37.38 
 
 
231 aa  75.1  0.000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1220  OmpA/MotB domain protein  39.6 
 
 
168 aa  75.1  0.000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.936608 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1142  OmpA/MotB domain-containing protein  36.45 
 
 
230 aa  74.3  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.679829 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3025  OmpA/MotB domain protein  44.3 
 
 
208 aa  74.3  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.970815  normal  0.30495 
 
 
-
 
NC_003296  RS01947  lipoprotein  38.83 
 
 
277 aa  73.6  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0163  OmpA/MotB domain protein  44.3 
 
 
223 aa  73.2  0.00000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2186  OmpA/MotB  34.33 
 
 
261 aa  73.2  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.813055  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4338  hypothetical protein  38.89 
 
 
210 aa  72.8  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.288471  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000499  outer membrane protein A precursor  33.66 
 
 
330 aa  73.2  0.00000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000000410155  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50880  hypothetical protein  38.89 
 
 
210 aa  72.8  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000407187 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1143  OmpA/MotB domain-containing protein  36.36 
 
 
237 aa  72.4  0.00000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.667913 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1422  OmpA/MotB domain-containing protein  32.35 
 
 
210 aa  72.4  0.00000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0642505  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0195  OmpA/MotB domain-containing protein  35.24 
 
 
228 aa  71.6  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0509  surface antigen protein  33.06 
 
 
218 aa  71.6  0.00000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0324571  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4294  OmpA/MotB domain-containing protein  32.39 
 
 
239 aa  71.6  0.00000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0728  OmpA/MotB domain protein  32.84 
 
 
209 aa  71.6  0.00000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1506  ompA family protein  36.54 
 
 
260 aa  71.2  0.00000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2321  OmpA/MotB domain-containing protein  42.5 
 
 
727 aa  71.2  0.00000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1502  OmpA/MotB domain protein  30.43 
 
 
263 aa  70.9  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0641332  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4220  OmpA/MotB domain-containing protein  30.43 
 
 
263 aa  70.9  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.956448  normal  0.667838 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4115  OmpA/MotB domain-containing protein  30.43 
 
 
262 aa  70.9  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5108  OmpA/MotB domain-containing protein  45.33 
 
 
224 aa  70.1  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.889998  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0293  OmpA/MotB domain protein  35.64 
 
 
213 aa  70.1  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0608822  normal 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4399  OmpA/MotB domain-containing protein  32.46 
 
 
333 aa  70.1  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.421249  normal  0.955819 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0062  putative outer membrane lipoprotein  27.74 
 
 
220 aa  70.1  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1033  OmpA family protein  42.11 
 
 
228 aa  70.1  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.383964  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1599  outer membrane fibronectin-binding protein  36 
 
 
333 aa  70.1  0.0000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  unclonable  0.00000000197596  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1667  OmpA/MotB  40.51 
 
 
219 aa  70.1  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.500476  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2694  OmpA/MotB domain-containing protein  42.11 
 
 
228 aa  70.1  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.110946 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1158  OmpA/MotB domain-containing protein  38.38 
 
 
239 aa  69.7  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.112434  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2804  OmpA/MotB domain-containing protein  43.75 
 
 
215 aa  70.1  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4576  OmpA/MotB domain-containing protein  44.74 
 
 
224 aa  70.5  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3859  putative outer membrane lipoprotein  29.2 
 
 
220 aa  69.7  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3924  putative outer membrane lipoprotein  29.2 
 
 
220 aa  69.7  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.835288 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3476  OmpA/MotB domain-containing protein  44.87 
 
 
220 aa  69.7  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.92305  normal  0.488327 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4028  putative outer membrane lipoprotein  29.2 
 
 
220 aa  69.7  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0388504  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0492  OmpA/MotB domain-containing protein  35.24 
 
 
187 aa  69.7  0.0000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000142767  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01273  hypothetical protein  33.66 
 
 
318 aa  69.3  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2067  OmpA/MotB domain protein  34.51 
 
 
216 aa  69.3  0.0000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.697357  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3968  putative outer membrane lipoprotein  29.2 
 
 
220 aa  69.7  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.508971  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3840  putative outer membrane lipoprotein  29.2 
 
 
220 aa  69.7  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2448  OmpA/MotB  34.29 
 
 
221 aa  69.7  0.0000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.777464  normal  0.153951 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2909  OmpA/MotB domain-containing protein  34.91 
 
 
316 aa  69.7  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  30.69 
 
 
319 aa  68.9  0.0000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_013132  Cpin_4918  hypothetical protein  21.72 
 
 
880 aa  69.3  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0265175  normal  0.302203 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1107  OmpA/MotB domain-containing protein  30.43 
 
 
263 aa  69.3  0.0000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03402  predicted outer membrane lipoprotein  28.47 
 
 
219 aa  68.9  0.0000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1745  OmpA domain-containing protein  33.93 
 
 
524 aa  68.6  0.0000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.155252  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03353  hypothetical protein  28.47 
 
 
219 aa  68.9  0.0000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48650  OmpA/MotB family protein  32.06 
 
 
261 aa  68.6  0.0000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0160  OmpA/MotB domain protein  28.47 
 
 
219 aa  68.6  0.0000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3873  putative outer membrane lipoprotein  28.47 
 
 
219 aa  68.6  0.0000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4047  putative outer membrane lipoprotein  28.47 
 
 
219 aa  68.6  0.0000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3753  putative outer membrane lipoprotein  28.47 
 
 
219 aa  68.6  0.0000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4928  putative outer membrane lipoprotein  28.47 
 
 
219 aa  68.6  0.0000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.843277 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0164  putative outer membrane lipoprotein  28.47 
 
 
219 aa  68.6  0.0000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3974  putative outer membrane lipoprotein  28.47 
 
 
219 aa  68.6  0.0000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1303  sporulation related  23.09 
 
 
1096 aa  68.2  0.0000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1796  outer membrane protein 3a  25.94 
 
 
903 aa  68.2  0.0000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.446296  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2769  OmpA/MotB domain protein  33.65 
 
 
215 aa  68.2  0.0000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1316  OmpA/MotB domain protein  35.24 
 
 
188 aa  67.8  0.0000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000829076  hitchhiker  6.79334e-27 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2727  OmpA/MotB  28.48 
 
 
398 aa  67.8  0.0000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1522  conserved repeat domain protein  34.51 
 
 
1984 aa  67.8  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000121408 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2043  OmpA/MotB domain protein  38.78 
 
 
349 aa  67.8  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0433092  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1122  OmpA/MotB domain protein  36.36 
 
 
264 aa  67  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0205488  hitchhiker  0.00000560377 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1805  outer membrane protein OmpA  39.24 
 
 
321 aa  67  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4921  OmpA/MotB domain protein  32.04 
 
 
320 aa  66.6  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.730269  normal  0.0282337 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3529  outer membrane protein OprF precursor  29.1 
 
 
350 aa  66.6  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2223  OmpA/MotB  32.12 
 
 
186 aa  67  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2042  OmpA/MotB  35.24 
 
 
286 aa  67  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0181  OmpA/MotB domain protein  31.53 
 
 
263 aa  67  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.833655  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10918  outer membrane protein A ompA  40.51 
 
 
326 aa  66.6  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2786  OmpA/MotB  25 
 
 
481 aa  66.6  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.187099  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41570  major porin and structural outer membrane porin OprF precursor  29.1 
 
 
350 aa  66.6  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000484221  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0418  OmpA/MotB domain-containing protein  33.02 
 
 
316 aa  66.2  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.661169 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1563  OmpA/MotB domain protein  33.33 
 
 
231 aa  66.2  0.000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.398665  normal  0.301983 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3958  OmpA/MotB domain protein  38.32 
 
 
499 aa  65.9  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.330203 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23330  major outer membrane porin OprF  31.43 
 
 
351 aa  66.2  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0169824  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2246  OmpA/MotB  31.68 
 
 
167 aa  65.9  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.18876  normal  0.277213 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3363  OmpA/MotB domain-containing protein  33.65 
 
 
261 aa  65.9  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2718  conserved repeat domain protein  32.74 
 
 
2000 aa  65.9  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3770  OmpA/MotB domain-containing protein  38.75 
 
 
440 aa  65.5  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3309  OmpA/MotB  32.76 
 
 
226 aa  65.9  0.000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49900  hypothetical protein  31.34 
 
 
168 aa  65.5  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.482093 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06262  hypothetical protein  32.67 
 
 
334 aa  65.1  0.000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5224  OmpA/MotB domain-containing protein  44 
 
 
221 aa  65.5  0.000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0179146  normal  0.128612 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>