11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1303 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_1303  sporulation related  100 
 
 		 1096 aa  2243    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0613  hypothetical protein  24.3 
 
 		 1043 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2872  hypothetical protein  19.15 
 
 		 876 aa  74.3  0.00000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2567  hypothetical protein  21.59 
 
 		 1020 aa  72  0.00000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00980048 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0453  OmpA/MotB domain-containing protein  23.09 
 
 		 993 aa  68.2  0.0000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.164289  hitchhiker  0.000000000838864 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2860  hypothetical protein  21.97 
 
 		 932 aa  64.3  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.297998 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1213  hypothetical protein  22.74 
 
 		 908 aa  63.2  0.00000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5310  hypothetical protein  25.71 
 
 		 803 aa  58.2  0.0000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.651081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0697  hypothetical protein  20.47 
 
 		 972 aa  48.9  0.0005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.418548  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1285  hypothetical protein  24.15 
 
 		 934 aa  46.6  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1757  hypothetical protein  22.84 
 
 		 930 aa  45.8  0.005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>