13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_0697 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008789  Hhal_0697  hypothetical protein  100 
 
 
972 aa  1936    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.418548  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1757  hypothetical protein  24.66 
 
 
930 aa  179  3e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1285  hypothetical protein  24.34 
 
 
934 aa  173  1e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5310  hypothetical protein  24.41 
 
 
803 aa  160  8e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.651081  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1213  hypothetical protein  25.93 
 
 
908 aa  155  5e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0613  hypothetical protein  22.58 
 
 
1043 aa  144  7e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2860  hypothetical protein  25.25 
 
 
932 aa  135  5e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.297998 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2567  hypothetical protein  23.17 
 
 
1020 aa  129  3e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00980048 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2872  hypothetical protein  22 
 
 
876 aa  112  3e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4918  hypothetical protein  22.29 
 
 
880 aa  66.2  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0265175  normal  0.302203 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0453  OmpA/MotB domain-containing protein  21.48 
 
 
993 aa  63.5  0.00000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.164289  hitchhiker  0.000000000838864 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10368  hypothetical protein  20.57 
 
 
878 aa  61.6  0.00000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1303  sporulation related  22.77 
 
 
1096 aa  47.4  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>