67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_1195 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_1195  tagatose-6-phosphate kinase  100 
 
 		 422 aa  861    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.60962 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2601  tagatose-bisphosphate aldolase noncatalytic subunit  60.85 
 
 		 428 aa  503  1e-141  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2534  tagatose-bisphosphate aldolase noncatalytic subunit  60.61 
 
 		 428 aa  502  1e-141  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2700  tagatose-bisphosphate aldolase noncatalytic subunit  60.52 
 
 		 428 aa  499  1e-140  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3572  tagatose-bisphosphate aldolase noncatalytic subunit  52.71 
 
 		 431 aa  422  1e-117  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.219278 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3612  D-tagatose-bisphosphate aldolase, class II, non-catalytic subunit  51.76 
 
 		 426 aa  412  1e-114  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3429  D-tagatose-bisphosphate aldolase, class II, non-catalytic subunit  51.53 
 
 		 426 aa  410  1e-113  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3322  D-tagatose-bisphosphate aldolase, class II, non-catalytic subunit  51.29 
 
 		 426 aa  408  1e-113  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0568  D-tagatose-bisphosphate aldolase, class II, non-catalytic subunit  51.29 
 
 		 426 aa  408  1e-113  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4446  D-tagatose-bisphosphate aldolase, class II, non-catalytic subunit  51.29 
 
 		 426 aa  410  1e-113  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.752498  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02948  hypothetical protein  51.29 
 
 		 426 aa  409  1e-113  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0573  D-tagatose-bisphosphate aldolase, class II, non-catalytic subunit  51.53 
 
 		 426 aa  411  1e-113  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02997  tagatose 6-phosphate aldolase 1, kbaZ subunit  51.29 
 
 		 426 aa  409  1e-113  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3848  tagatose-6-phosphate kinase  50.35 
 
 		 427 aa  389  1e-107  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3446  D-tagatose-bisphosphate aldolase, class II, non-catalytic subunit  49.76 
 
 		 423 aa  388  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0192859  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3612  D-tagatose-bisphosphate aldolase  49.76 
 
 		 423 aa  388  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0182354  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2386  D-tagatose-bisphosphate aldolase, class II, non-catalytic subunit  50.47 
 
 		 430 aa  389  1e-107  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3515  D-tagatose-bisphosphate aldolase, class II, non-catalytic subunit  49.29 
 
 		 441 aa  382  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.166887  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3552  D-tagatose-bisphosphate aldolase, class II, non-catalytic subunit  48.81 
 
 		 423 aa  379  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.263704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1145  tagatose-bisphosphate aldolase noncatalytic subunit  48.1 
 
 		 421 aa  379  1e-104  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1143  putative tagatose-6-phosphate kinase  50.35 
 
 		 420 aa  376  1e-103  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.291767  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3817  D-tagatose-bisphosphate aldolase, class II, non-catalytic subunit  49.65 
 
 		 444 aa  376  1e-103  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.897143  normal  0.959297 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0969  putative tagatose-6-phosphate kinase  50.35 
 
 		 420 aa  377  1e-103  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.566701 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3444  D-tagatose-bisphosphate aldolase, class II, non-catalytic subunit  48.81 
 
 		 441 aa  378  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02021  putative tagatose 6-phosphate kinase 1  50.12 
 
 		 420 aa  373  1e-102  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01987  hypothetical protein  50.12 
 
 		 420 aa  373  1e-102  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1552  D-tagatose-bisphosphate aldolase, class II, non-catalytic subunit  50.12 
 
 		 420 aa  374  1e-102  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2145  putative tagatose 6-phosphate kinase protein  50.81 
 
 		 451 aa  374  1e-102  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000526082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2383  D-tagatose-bisphosphate aldolase, class II, non-catalytic subunit  49.88 
 
 		 420 aa  372  1e-102  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1562  D-tagatose-bisphosphate aldolase, class II, non-catalytic subunit  49.88 
 
 		 420 aa  372  1e-102  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0080189  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2231  putative tagatose-6-phosphate kinase  50.12 
 
 		 420 aa  374  1e-102  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.26036  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4762  D-tagatose-bisphosphate aldolase, class II, non-catalytic subunit  51.97 
 
 		 433 aa  373  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.715507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3074  putative tagatose-6-phosphate kinase  50.12 
 
 		 420 aa  374  1e-102  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00154416 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0942  D-tagatose-bisphosphate aldolase, class II, non-catalytic subunit  48.36 
 
 		 432 aa  370  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0288  tagatose-6-phosphate kinase  50.47 
 
 		 428 aa  364  1e-99  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3179  D-tagatose-bisphosphate aldolase, class II, non-catalytic subunit  49.4 
 
 		 457 aa  363  3e-99  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.265096  normal  0.0346233 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3106  tagatose-6-phosphate kinase  45.22 
 
 		 429 aa  352  1e-95  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00963647  hitchhiker  0.000335639 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3376  D-tagatose-bisphosphate aldolase  48.36 
 
 		 432 aa  351  1e-95  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.338504 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0317  D-tagatose-bisphosphate aldolase, class II, non-catalytic subunit  48.94 
 
 		 432 aa  351  1e-95  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0839239  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0994  D-tagatose-bisphosphate aldolase, class II, non-catalytic subunit  48.36 
 
 		 432 aa  351  1e-95  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0640  tagatose-bisphosphate aldolase noncatalytic subunit  50.83 
 
 		 427 aa  347  2e-94  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.581785  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1986  tagatose-6-phosphate kinase  48.6 
 
 		 450 aa  345  1e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.119411  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2596  tagatose-6-phosphate kinase  48.6 
 
 		 450 aa  345  1e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2620  D-tagatose-bisphosphate aldolase, class II, non-catalytic subunit  48.37 
 
 		 450 aa  342  5e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.634192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5927  tagatose-bisphosphate aldolase noncatalytic subunit  47.44 
 
 		 450 aa  342  7e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4765  tagatose-6-phosphate kinase  48.95 
 
 		 426 aa  342  1e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.648377 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0694  hypothetical protein  45.63 
 
 		 477 aa  339  5e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.772161  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5361  D-tagatose-bisphosphate aldolase, class II, non-catalytic subunit  49.14 
 
 		 432 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.583103  normal  0.44842 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2644  tagatose-6-phosphate kinase  46.76 
 
 		 452 aa  330  4e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2512  D-tagatose-bisphosphate aldolase, class II, non-catalytic subunit  46.76 
 
 		 452 aa  329  7e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.670435 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4847  tagatose-6-phosphate kinase  50 
 
 		 425 aa  325  1e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.722709 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0870  tagatose 6-phosphate kinase  45.59 
 
 		 498 aa  322  7e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1033  putative tagatose 6-phosphate kinase protein  45.59 
 
 		 498 aa  322  8e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0874  tagatose 6-phosphate kinase  45.59 
 
 		 498 aa  322  9.000000000000001e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.210909  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0701  D-tagatose-bisphosphate aldolase, class II, non-catalytic subunit  49.3 
 
 		 443 aa  320  3e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.344652  normal  0.544688 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1008  D-tagatose-bisphosphate aldolase class II accessory protein AgaZ  43.56 
 
 		 438 aa  318  1e-85  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.833631  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3587  hypothetical protein  48.03 
 
 		 426 aa  306  6e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.00157379  normal  0.457211 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0291  D-tagatose-bisphosphate aldolase class II accessory protein AgaZ  49.61 
 
 		 425 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.849518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0630  tagatose 6 phosphate kinase  47.29 
 
 		 481 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2464  putative tagatose 6-phosphate kinase gatZ  47.29 
 
 		 481 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14550  predicted tagatose 6-phosphate kinase  41.23 
 
 		 444 aa  301  1e-80  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.107814 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0262  Tagatose-6-phosphate kinase  50.53 
 
 		 431 aa  298  9e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1192  tagatose-6-phosphate kinase  44.92 
 
 		 427 aa  284  2.0000000000000002e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0385  Tagatose-6-phosphate kinase  33.25 
 
 		 408 aa  254  2.0000000000000002e-66  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2483  tagatose-6-phosphate kinase  46.55 
 
 		 290 aa  190  4e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2543  hypothetical protein  34.5 
 
 		 420 aa  56.6  0.0000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0014  hypothetical protein  28.79 
 
 		 426 aa  48.5  0.0002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.109361  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>