19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0014 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0014  hypothetical protein  100 
 
 		 426 aa  879    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.109361  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2543  hypothetical protein  30.62 
 
 		 420 aa  151  2e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1330  hypothetical protein  26.93 
 
 		 333 aa  100  7e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.017133  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4446  D-tagatose-bisphosphate aldolase, class II, non-catalytic subunit  25 
 
 		 426 aa  53.9  0.000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.752498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3612  D-tagatose-bisphosphate aldolase, class II, non-catalytic subunit  24.76 
 
 		 426 aa  53.9  0.000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3429  D-tagatose-bisphosphate aldolase, class II, non-catalytic subunit  24.76 
 
 		 426 aa  53.9  0.000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02997  tagatose 6-phosphate aldolase 1, kbaZ subunit  24.76 
 
 		 426 aa  53.5  0.000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02948  hypothetical protein  24.76 
 
 		 426 aa  53.5  0.000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0942  D-tagatose-bisphosphate aldolase, class II, non-catalytic subunit  25.06 
 
 		 432 aa  53.1  0.000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0573  D-tagatose-bisphosphate aldolase, class II, non-catalytic subunit  24.76 
 
 		 426 aa  53.1  0.000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0568  D-tagatose-bisphosphate aldolase, class II, non-catalytic subunit  24.76 
 
 		 426 aa  53.1  0.000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3322  D-tagatose-bisphosphate aldolase, class II, non-catalytic subunit  24.76 
 
 		 426 aa  53.1  0.000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3572  tagatose-bisphosphate aldolase noncatalytic subunit  24.28 
 
 		 431 aa  53.1  0.000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.219278 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0994  D-tagatose-bisphosphate aldolase, class II, non-catalytic subunit  24.44 
 
 		 432 aa  48.5  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1195  tagatose-6-phosphate kinase  28.79 
 
 		 422 aa  48.1  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.60962 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3376  D-tagatose-bisphosphate aldolase  24.2 
 
 		 432 aa  47.4  0.0005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.338504 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0385  Tagatose-6-phosphate kinase  22.31 
 
 		 408 aa  46.6  0.0008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3179  D-tagatose-bisphosphate aldolase, class II, non-catalytic subunit  24.04 
 
 		 457 aa  45.8  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.265096  normal  0.0346233 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3106  tagatose-6-phosphate kinase  27.81 
 
 		 429 aa  43.9  0.006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00963647  hitchhiker  0.000335639 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>