66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_2534 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_2534  tagatose-bisphosphate aldolase noncatalytic subunit  100 
 
 		 428 aa  882    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2601  tagatose-bisphosphate aldolase noncatalytic subunit  98.83 
 
 		 428 aa  870    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2700  tagatose-bisphosphate aldolase noncatalytic subunit  98.6 
 
 		 428 aa  871    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1195  tagatose-6-phosphate kinase  60.61 
 
 		 422 aa  487  1e-136  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.60962 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02997  tagatose 6-phosphate aldolase 1, kbaZ subunit  53.18 
 
 		 426 aa  426  1e-118  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0573  D-tagatose-bisphosphate aldolase, class II, non-catalytic subunit  53.41 
 
 		 426 aa  428  1e-118  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02948  hypothetical protein  53.18 
 
 		 426 aa  426  1e-118  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4446  D-tagatose-bisphosphate aldolase, class II, non-catalytic subunit  53.41 
 
 		 426 aa  426  1e-118  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.752498  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0568  D-tagatose-bisphosphate aldolase, class II, non-catalytic subunit  53.18 
 
 		 426 aa  425  1e-118  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3612  D-tagatose-bisphosphate aldolase, class II, non-catalytic subunit  53.41 
 
 		 426 aa  427  1e-118  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3322  D-tagatose-bisphosphate aldolase, class II, non-catalytic subunit  53.18 
 
 		 426 aa  425  1e-118  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3429  D-tagatose-bisphosphate aldolase, class II, non-catalytic subunit  52.94 
 
 		 426 aa  422  1e-117  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3848  tagatose-6-phosphate kinase  52.24 
 
 		 427 aa  416  9.999999999999999e-116  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0942  D-tagatose-bisphosphate aldolase, class II, non-catalytic subunit  52.46 
 
 		 432 aa  417  9.999999999999999e-116  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3572  tagatose-bisphosphate aldolase noncatalytic subunit  50.82 
 
 		 431 aa  412  1e-114  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.219278 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2386  D-tagatose-bisphosphate aldolase, class II, non-catalytic subunit  51.06 
 
 		 430 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3376  D-tagatose-bisphosphate aldolase  51.17 
 
 		 432 aa  398  9.999999999999999e-111  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.338504 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1145  tagatose-bisphosphate aldolase noncatalytic subunit  48.81 
 
 		 421 aa  396  1e-109  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2145  putative tagatose 6-phosphate kinase protein  51.16 
 
 		 451 aa  396  1e-109  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000526082  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0994  D-tagatose-bisphosphate aldolase, class II, non-catalytic subunit  51.17 
 
 		 432 aa  398  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3817  D-tagatose-bisphosphate aldolase, class II, non-catalytic subunit  51.18 
 
 		 444 aa  392  1e-108  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.897143  normal  0.959297 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3612  D-tagatose-bisphosphate aldolase  49.05 
 
 		 423 aa  385  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0182354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1986  tagatose-6-phosphate kinase  50.23 
 
 		 450 aa  382  1e-105  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.119411  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2620  D-tagatose-bisphosphate aldolase, class II, non-catalytic subunit  50.23 
 
 		 450 aa  385  1e-105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.634192  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1552  D-tagatose-bisphosphate aldolase, class II, non-catalytic subunit  47.98 
 
 		 420 aa  382  1e-105  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5927  tagatose-bisphosphate aldolase noncatalytic subunit  49.77 
 
 		 450 aa  384  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1143  putative tagatose-6-phosphate kinase  48.22 
 
 		 420 aa  384  1e-105  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.291767  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2383  D-tagatose-bisphosphate aldolase, class II, non-catalytic subunit  48.22 
 
 		 420 aa  384  1e-105  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3515  D-tagatose-bisphosphate aldolase, class II, non-catalytic subunit  48.81 
 
 		 441 aa  382  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.166887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2231  putative tagatose-6-phosphate kinase  47.98 
 
 		 420 aa  382  1e-105  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.26036  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3552  D-tagatose-bisphosphate aldolase, class II, non-catalytic subunit  49.05 
 
 		 423 aa  383  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.263704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3446  D-tagatose-bisphosphate aldolase, class II, non-catalytic subunit  49.05 
 
 		 423 aa  385  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0192859  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3444  D-tagatose-bisphosphate aldolase, class II, non-catalytic subunit  49.05 
 
 		 441 aa  383  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3074  putative tagatose-6-phosphate kinase  47.98 
 
 		 420 aa  382  1e-105  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00154416 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1562  D-tagatose-bisphosphate aldolase, class II, non-catalytic subunit  48.22 
 
 		 420 aa  384  1e-105  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0080189  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2596  tagatose-6-phosphate kinase  50.23 
 
 		 450 aa  382  1e-105  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3106  tagatose-6-phosphate kinase  46.9 
 
 		 429 aa  379  1e-104  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00963647  hitchhiker  0.000335639 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02021  putative tagatose 6-phosphate kinase 1  47.98 
 
 		 420 aa  381  1e-104  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01987  hypothetical protein  47.98 
 
 		 420 aa  381  1e-104  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3179  D-tagatose-bisphosphate aldolase, class II, non-catalytic subunit  48.24 
 
 		 457 aa  376  1e-103  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.265096  normal  0.0346233 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2644  tagatose-6-phosphate kinase  49.77 
 
 		 452 aa  372  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2512  D-tagatose-bisphosphate aldolase, class II, non-catalytic subunit  50 
 
 		 452 aa  374  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.670435 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0969  putative tagatose-6-phosphate kinase  47.51 
 
 		 420 aa  373  1e-102  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.566701 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0701  D-tagatose-bisphosphate aldolase, class II, non-catalytic subunit  50.69 
 
 		 443 aa  364  2e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.344652  normal  0.544688 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0640  tagatose-bisphosphate aldolase noncatalytic subunit  51.06 
 
 		 427 aa  363  3e-99  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.581785  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0694  hypothetical protein  44.98 
 
 		 477 aa  361  1e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.772161  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4762  D-tagatose-bisphosphate aldolase, class II, non-catalytic subunit  47.9 
 
 		 433 aa  352  7e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.715507  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0317  D-tagatose-bisphosphate aldolase, class II, non-catalytic subunit  46.57 
 
 		 432 aa  344  2e-93  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0839239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0288  tagatose-6-phosphate kinase  46.96 
 
 		 428 aa  344  2e-93  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1008  D-tagatose-bisphosphate aldolase class II accessory protein AgaZ  44.21 
 
 		 438 aa  336  5.999999999999999e-91  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.833631  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1033  putative tagatose 6-phosphate kinase protein  43.28 
 
 		 498 aa  332  6e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0870  tagatose 6-phosphate kinase  43.16 
 
 		 498 aa  330  4e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0874  tagatose 6-phosphate kinase  42.32 
 
 		 498 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.210909  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5361  D-tagatose-bisphosphate aldolase, class II, non-catalytic subunit  45.23 
 
 		 432 aa  325  1e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.583103  normal  0.44842 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4765  tagatose-6-phosphate kinase  48.18 
 
 		 426 aa  322  6e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.648377 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2464  putative tagatose 6-phosphate kinase gatZ  42.82 
 
 		 481 aa  295  9e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0630  tagatose 6 phosphate kinase  42.82 
 
 		 481 aa  295  9e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14550  predicted tagatose 6-phosphate kinase  41.22 
 
 		 444 aa  295  1e-78  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.107814 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4847  tagatose-6-phosphate kinase  42.38 
 
 		 425 aa  295  1e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.722709 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0291  D-tagatose-bisphosphate aldolase class II accessory protein AgaZ  42.68 
 
 		 425 aa  283  6.000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.849518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3587  hypothetical protein  43.79 
 
 		 426 aa  282  8.000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.00157379  normal  0.457211 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1192  tagatose-6-phosphate kinase  44.62 
 
 		 427 aa  282  9e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0262  Tagatose-6-phosphate kinase  43.8 
 
 		 431 aa  280  3e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0385  Tagatose-6-phosphate kinase  34.56 
 
 		 408 aa  272  8.000000000000001e-72  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2483  tagatose-6-phosphate kinase  42.71 
 
 		 290 aa  185  1.0000000000000001e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2543  hypothetical protein  29.62 
 
 		 420 aa  47  0.0006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>