68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_4847 on replicon NC_008688
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008688  Pden_4847  tagatose-6-phosphate kinase  100 
 
 
425 aa  859    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.722709 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4765  tagatose-6-phosphate kinase  67.92 
 
 
426 aa  550  1e-155  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.648377 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0288  tagatose-6-phosphate kinase  63.84 
 
 
428 aa  506  9.999999999999999e-143  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4762  D-tagatose-bisphosphate aldolase, class II, non-catalytic subunit  58.17 
 
 
433 aa  457  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.715507  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5361  D-tagatose-bisphosphate aldolase, class II, non-catalytic subunit  58.77 
 
 
432 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.583103  normal  0.44842 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2386  D-tagatose-bisphosphate aldolase, class II, non-catalytic subunit  51.72 
 
 
430 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3429  D-tagatose-bisphosphate aldolase, class II, non-catalytic subunit  52.09 
 
 
426 aa  405  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0942  D-tagatose-bisphosphate aldolase, class II, non-catalytic subunit  50.95 
 
 
432 aa  406  1.0000000000000001e-112  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02997  tagatose 6-phosphate aldolase 1, kbaZ subunit  51.6 
 
 
426 aa  401  1e-111  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0573  D-tagatose-bisphosphate aldolase, class II, non-catalytic subunit  51.84 
 
 
426 aa  403  1e-111  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02948  hypothetical protein  51.6 
 
 
426 aa  401  1e-111  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4446  D-tagatose-bisphosphate aldolase, class II, non-catalytic subunit  51.84 
 
 
426 aa  403  1e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.752498  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3612  D-tagatose-bisphosphate aldolase, class II, non-catalytic subunit  51.84 
 
 
426 aa  404  1e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0568  D-tagatose-bisphosphate aldolase, class II, non-catalytic subunit  51.6 
 
 
426 aa  401  9.999999999999999e-111  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3322  D-tagatose-bisphosphate aldolase, class II, non-catalytic subunit  51.6 
 
 
426 aa  401  9.999999999999999e-111  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3179  D-tagatose-bisphosphate aldolase, class II, non-catalytic subunit  53.19 
 
 
457 aa  399  9.999999999999999e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.265096  normal  0.0346233 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2145  putative tagatose 6-phosphate kinase protein  52.43 
 
 
451 aa  393  1e-108  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000526082  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3376  D-tagatose-bisphosphate aldolase  49.76 
 
 
432 aa  391  1e-107  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.338504 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0994  D-tagatose-bisphosphate aldolase, class II, non-catalytic subunit  49.53 
 
 
432 aa  390  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3848  tagatose-6-phosphate kinase  49.39 
 
 
427 aa  390  1e-107  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3572  tagatose-bisphosphate aldolase noncatalytic subunit  49.29 
 
 
431 aa  391  1e-107  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.219278 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5927  tagatose-bisphosphate aldolase noncatalytic subunit  51.64 
 
 
450 aa  388  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0291  D-tagatose-bisphosphate aldolase class II accessory protein AgaZ  54.18 
 
 
425 aa  387  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.849518  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3106  tagatose-6-phosphate kinase  47.16 
 
 
429 aa  387  1e-106  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00963647  hitchhiker  0.000335639 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2596  tagatose-6-phosphate kinase  50.93 
 
 
450 aa  387  1e-106  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1986  tagatose-6-phosphate kinase  50.93 
 
 
450 aa  387  1e-106  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.119411  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2620  D-tagatose-bisphosphate aldolase, class II, non-catalytic subunit  52.8 
 
 
450 aa  386  1e-106  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.634192  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0317  D-tagatose-bisphosphate aldolase, class II, non-catalytic subunit  52.21 
 
 
432 aa  383  1e-105  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0839239  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0262  Tagatose-6-phosphate kinase  54.42 
 
 
431 aa  384  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1145  tagatose-bisphosphate aldolase noncatalytic subunit  47.94 
 
 
421 aa  384  1e-105  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3587  hypothetical protein  57.81 
 
 
426 aa  379  1e-104  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.00157379  normal  0.457211 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3446  D-tagatose-bisphosphate aldolase, class II, non-catalytic subunit  48.4 
 
 
423 aa  375  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0192859  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3552  D-tagatose-bisphosphate aldolase, class II, non-catalytic subunit  49.01 
 
 
423 aa  376  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.263704  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3612  D-tagatose-bisphosphate aldolase  49.01 
 
 
423 aa  375  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0182354  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2644  tagatose-6-phosphate kinase  50.47 
 
 
452 aa  372  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3515  D-tagatose-bisphosphate aldolase, class II, non-catalytic subunit  49.01 
 
 
441 aa  372  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.166887  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3444  D-tagatose-bisphosphate aldolase, class II, non-catalytic subunit  48.77 
 
 
441 aa  375  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2512  D-tagatose-bisphosphate aldolase, class II, non-catalytic subunit  50.47 
 
 
452 aa  370  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.670435 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3817  D-tagatose-bisphosphate aldolase, class II, non-catalytic subunit  48.23 
 
 
444 aa  371  1e-101  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.897143  normal  0.959297 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0694  hypothetical protein  49.52 
 
 
477 aa  359  6e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.772161  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0701  D-tagatose-bisphosphate aldolase, class II, non-catalytic subunit  52.83 
 
 
443 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.344652  normal  0.544688 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0640  tagatose-bisphosphate aldolase noncatalytic subunit  51.54 
 
 
427 aa  355  5.999999999999999e-97  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.581785  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1143  putative tagatose-6-phosphate kinase  45.68 
 
 
420 aa  352  5e-96  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.291767  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1552  D-tagatose-bisphosphate aldolase, class II, non-catalytic subunit  45.68 
 
 
420 aa  352  7e-96  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2231  putative tagatose-6-phosphate kinase  45.68 
 
 
420 aa  352  7e-96  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.26036  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1008  D-tagatose-bisphosphate aldolase class II accessory protein AgaZ  43.95 
 
 
438 aa  351  1e-95  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.833631  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1562  D-tagatose-bisphosphate aldolase, class II, non-catalytic subunit  45.43 
 
 
420 aa  350  2e-95  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0080189  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02021  putative tagatose 6-phosphate kinase 1  45.68 
 
 
420 aa  350  2e-95  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2383  D-tagatose-bisphosphate aldolase, class II, non-catalytic subunit  45.43 
 
 
420 aa  350  2e-95  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01987  hypothetical protein  45.68 
 
 
420 aa  350  2e-95  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3074  putative tagatose-6-phosphate kinase  45.43 
 
 
420 aa  350  3e-95  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00154416 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0969  putative tagatose-6-phosphate kinase  45.19 
 
 
420 aa  345  1e-93  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.566701 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0874  tagatose 6-phosphate kinase  48.28 
 
 
498 aa  339  5e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.210909  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1195  tagatose-6-phosphate kinase  50 
 
 
422 aa  339  5.9999999999999996e-92  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.60962 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0870  tagatose 6-phosphate kinase  48.28 
 
 
498 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1033  putative tagatose 6-phosphate kinase protein  46.67 
 
 
498 aa  335  7e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0630  tagatose 6 phosphate kinase  47.88 
 
 
481 aa  322  5e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2464  putative tagatose 6-phosphate kinase gatZ  47.88 
 
 
481 aa  322  5e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2483  tagatose-6-phosphate kinase  60.49 
 
 
290 aa  319  6e-86  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2601  tagatose-bisphosphate aldolase noncatalytic subunit  44.29 
 
 
428 aa  319  7.999999999999999e-86  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2534  tagatose-bisphosphate aldolase noncatalytic subunit  44.05 
 
 
428 aa  317  3e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2700  tagatose-bisphosphate aldolase noncatalytic subunit  44.05 
 
 
428 aa  315  8e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1192  tagatose-6-phosphate kinase  46.34 
 
 
427 aa  285  1.0000000000000001e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14550  predicted tagatose 6-phosphate kinase  40.94 
 
 
444 aa  281  2e-74  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.107814 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0385  Tagatose-6-phosphate kinase  36.65 
 
 
408 aa  270  2.9999999999999997e-71  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2543  hypothetical protein  30.26 
 
 
420 aa  72.4  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0014  hypothetical protein  29.89 
 
 
426 aa  51.2  0.00003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.109361  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1969  fructose-bisphosphate aldolase  26.13 
 
 
379 aa  43.9  0.006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>