32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2462 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_2462  hypothetical protein  100 
 
 		 356 aa  675    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.323144 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4365  major facilitator transporter  28.89 
 
 		 413 aa  78.2  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4848  major facilitator transporter  28.48 
 
 		 406 aa  74.7  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.869631  normal  0.114324 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0342  major facilitator superfamily permease  30.43 
 
 		 396 aa  55.5  0.000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0850  major facilitator superfamily MFS_1  34.62 
 
 		 406 aa  50.4  0.00004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0190  major facilitator transporter  28.39 
 
 		 388 aa  50.8  0.00004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0726  putative multidrug resistance protein  27.03 
 
 		 487 aa  48.9  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4675  major facilitator transporter  27.61 
 
 		 498 aa  48.9  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.235622 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2031  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  32.61 
 
 		 465 aa  46.6  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.232006  normal  0.319665 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0992  major facilitator transporter  32.61 
 
 		 486 aa  46.6  0.0007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2236  major facilitator superfamily MFS_1  32.61 
 
 		 465 aa  45.4  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.763805 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0904  major facilitator transporter  32.61 
 
 		 465 aa  46.2  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.674587  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2234  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.61 
 
 		 465 aa  45.8  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.610226  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0628  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  30 
 
 		 467 aa  45.1  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0297622 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0636  hypothetical protein  34.31 
 
 		 400 aa  45.1  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.108521  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1753  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.61 
 
 		 465 aa  45.4  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3953  major facilitator transporter  27.11 
 
 		 431 aa  45.1  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.690116  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4300  major facilitator superfamily MFS_1  25.95 
 
 		 467 aa  44.7  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.838701  normal  0.409906 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3562  major facilitator transporter  34.86 
 
 		 428 aa  44.7  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.66626  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2504  tetracycline-efflux transporter, putative  32.33 
 
 		 411 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00179141  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2709  major facilitator superfamily MFS_1  26.57 
 
 		 414 aa  43.9  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2968  major facilitator superfamily MFS_1  26.57 
 
 		 414 aa  43.5  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0277943 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2339  major facilitator transporter  34.06 
 
 		 406 aa  43.5  0.006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0304665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2462  major facilitator superfamily MFS_1  30.66 
 
 		 411 aa  43.1  0.007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000109307  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0735  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  20.97 
 
 		 388 aa  43.1  0.007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0719  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  20.97 
 
 		 388 aa  43.1  0.007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1545  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.52 
 
 		 486 aa  43.1  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4078  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 417 aa  42.7  0.009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3733  major facilitator transporter  31.52 
 
 		 474 aa  42.7  0.009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.231199  normal  0.165814 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1512  major facilitator superfamily transporter  28.7 
 
 		 441 aa  42.7  0.009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0073  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.52 
 
 		 465 aa  42.7  0.01  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0234689  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1168  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.52 
 
 		 465 aa  42.7  0.01  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.579921  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>