59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2167 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_2167  general stress protein  100 
 
 		 154 aa  314  3e-85  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.115401  normal  0.509563 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2404  general stress protein  57.14 
 
 		 154 aa  193  7e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02295  general stress protein  53.42 
 
 		 146 aa  176  1e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.944357  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2041  general stress protein  49.67 
 
 		 163 aa  145  1.0000000000000001e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00366  general stress protein  43.31 
 
 		 162 aa  126  1.0000000000000001e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.222659  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3141  general stress protein  41.61 
 
 		 161 aa  106  1e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0462992 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0955  putative general stress protein 26  39.87 
 
 		 159 aa  94.4  5e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3508  hypothetical protein  34.96 
 
 		 167 aa  85.9  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.398913 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3213  hypothetical protein  35.77 
 
 		 167 aa  85.1  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2384  hypothetical protein  40.16 
 
 		 186 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00852398  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1047  hypothetical protein  40.16 
 
 		 186 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00624108  normal  0.760938 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4608  putative general stress protein 26  36.6 
 
 		 160 aa  80.5  0.000000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1889  hypothetical protein  39.37 
 
 		 165 aa  77  0.00000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.632194  normal  0.504186 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3632  hypothetical protein  33.33 
 
 		 167 aa  73.9  0.0000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.963892  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0757  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding protein  36.19 
 
 		 167 aa  64.7  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0041  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  33.33 
 
 		 160 aa  62  0.000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0014  putative general stress protein 26  29.88 
 
 		 165 aa  58.9  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0043  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  31.75 
 
 		 160 aa  59.3  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03010  uncharacterized stress protein (general stress protein 26)  31.58 
 
 		 146 aa  58.2  0.00000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0534  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding protein  30.23 
 
 		 170 aa  58.2  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.536525 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6194  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding protein  30.86 
 
 		 167 aa  57.8  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.000117715  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00185  general stress protein  29.6 
 
 		 166 aa  55.8  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.78634  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4832  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding  30.46 
 
 		 166 aa  55.8  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0468  general stress protein  26.45 
 
 		 165 aa  54.3  0.0000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1439  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  26.77 
 
 		 165 aa  52.4  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.123209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1506  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding  28.19 
 
 		 167 aa  52.4  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00738794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2296  general stress protein  24.09 
 
 		 186 aa  52  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0248237 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0544  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  29.82 
 
 		 164 aa  51.6  0.000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000110488  unclonable  0.00000000107777 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0017  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  29.84 
 
 		 168 aa  51.6  0.000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0687493  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4161  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  29.84 
 
 		 168 aa  51.6  0.000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0415  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  28.12 
 
 		 169 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0380541 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6338  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  25.53 
 
 		 159 aa  50.8  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0207  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  31.94 
 
 		 164 aa  50.4  0.000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.0000595835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0891  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  34.38 
 
 		 169 aa  50.4  0.000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.457578 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1306  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-like FMN-binding protein  28.28 
 
 		 153 aa  50.1  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0235  hypothetical protein  24.29 
 
 		 161 aa  50.1  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0424787  normal  0.647212 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3362  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  28.12 
 
 		 166 aa  49.7  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4901  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  25 
 
 		 152 aa  48.9  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000931865  normal  0.0570738 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1688  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  25.69 
 
 		 165 aa  49.3  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.317072  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0186  hypothetical protein  29.17 
 
 		 164 aa  48.5  0.00003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000256938  normal  0.169414 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1723  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  28.12 
 
 		 169 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0380368  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2143  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  28.57 
 
 		 167 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.429446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6715  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding  29.13 
 
 		 178 aa  48.1  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2178  uncharacterized stress protein  30 
 
 		 194 aa  48.1  0.00004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.747799  normal  0.211573 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3048  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  27.1 
 
 		 159 aa  46.6  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4578  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  25.42 
 
 		 159 aa  47  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.208727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0477  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  25.93 
 
 		 162 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.130245  normal  0.542758 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04320  uncharacterized stress protein (general stress protein 26)  42.86 
 
 		 162 aa  46.2  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2950  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding protein  28.93 
 
 		 171 aa  45.8  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2175  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  26.61 
 
 		 169 aa  44.3  0.0007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0214  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  25.19 
 
 		 162 aa  43.9  0.0009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.384494  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36910  uncharacterized stress protein (general stress protein 26)  30.09 
 
 		 161 aa  42.7  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.408882 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4934  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding protein  36.36 
 
 		 159 aa  42.7  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5080  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  27.62 
 
 		 167 aa  42.4  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.71556 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3651  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  26.15 
 
 		 159 aa  42  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.187958  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0323  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  24.44 
 
 		 162 aa  42.4  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.17098  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21290  uncharacterized stress protein (general stress protein 26)  28.23 
 
 		 160 aa  41.6  0.004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.967363  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4563  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  22.68 
 
 		 167 aa  41.2  0.006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.535991  normal  0.356279 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0067  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  26.51 
 
 		 163 aa  40.8  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.663335  normal  0.459209 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>