19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_1652 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008532  STER_1652  lactococcin A ABC transporter permease protein  100 
 
 		 455 aa  919    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0083  lactococcin A ABC transporter permease protein  28.79 
 
 		 449 aa  169  6e-41  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008503  LACR_A01  lactococcin A ABC transporter permease protein  25.84 
 
 		 456 aa  130  7.000000000000001e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1083  bacteriocin ABC transporter, bacteriocin-binding protein, putative  23.77 
 
 		 500 aa  62  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.102695  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0320  antibiotic ABC transporter  21.5 
 
 		 324 aa  54.3  0.000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0426  bacteriocin ABC transporter, bacteriocin-binding protein, putative  26.47 
 
 		 383 aa  54.3  0.000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0511  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  22.38 
 
 		 441 aa  49.3  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23530  putative secretion protein  28.18 
 
 		 355 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0127928 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1992  putative secretion protein  28.18 
 
 		 344 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2429  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.37 
 
 		 441 aa  45.8  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.281145  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0328  hypothetical protein  20.75 
 
 		 466 aa  45.8  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00489922  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4382  secretion protein HlyD  23.46 
 
 		 515 aa  45.1  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.807644  normal  0.164924 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3836  secretion protein HlyD family protein  25.42 
 
 		 457 aa  45.8  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.395614  normal  0.929001 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2264  hypothetical protein  30.95 
 
 		 627 aa  45.8  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0004  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  27.27 
 
 		 442 aa  45.1  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.197437  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3996  secretion protein HlyD  31.11 
 
 		 450 aa  44.3  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.497269  hitchhiker  0.0000000255952 
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6495  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  22.38 
 
 		 479 aa  43.9  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1513  secretion protein HlyD  28.67 
 
 		 404 aa  43.5  0.008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.461504  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0168  hypothetical protein  19.78 
 
 		 437 aa  43.5  0.008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>