136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0883 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP0883  hypothetical protein  100 
 
 		 341 aa  712    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1377  hypothetical protein  81.82 
 
 		 351 aa  607  1e-173  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0014162  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1404  hypothetical protein  81.82 
 
 		 351 aa  607  1e-173  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.265494  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1756  hypothetical protein  60.7 
 
 		 341 aa  449  1e-125  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0152757  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0857  threonine aldolase  52.2 
 
 		 341 aa  378  1e-104  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2927  Threonine aldolase  48.99 
 
 		 345 aa  366  1e-100  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2181  threonine aldolase  52.66 
 
 		 346 aa  359  4e-98  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0421215  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0635  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  49.85 
 
 		 344 aa  351  8e-96  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.538663  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0005  L-threonine aldolase, low-specificity  48.68 
 
 		 351 aa  345  5e-94  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1162  Threonine aldolase  48.52 
 
 		 345 aa  325  5e-88  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0576287 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1081  Threonine aldolase  46.92 
 
 		 344 aa  320  3e-86  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00175946  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7125  Threonine aldolase  47.8 
 
 		 339 aa  313  1.9999999999999998e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08120  L-threonine aldolase  44.28 
 
 		 344 aa  312  5.999999999999999e-84  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000672977  hitchhiker  0.0000000548027 
 
 
-
 
NC_002950  PG0474  low-specificity L-threonine aldolase  45.45 
 
 		 345 aa  305  6e-82  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0102  Threonine aldolase  42.94 
 
 		 342 aa  295  7e-79  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0904  threonine aldolase  38.44 
 
 		 350 aa  263  3e-69  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000336158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04194  threonine aldolase  42.14 
 
 		 282 aa  234  1.0000000000000001e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0300  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  35.96 
 
 		 337 aa  213  3.9999999999999995e-54  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1657  L-threonine aldolase  32.18 
 
 		 339 aa  160  3e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.789065  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01000  L-threonine aldolase  32.47 
 
 		 357 aa  160  3e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2606  threonine aldolase  32.94 
 
 		 346 aa  154  2e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000143153  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9381  Threonine aldolase  31.67 
 
 		 352 aa  147  4.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1286  threonine aldolase  30.03 
 
 		 340 aa  145  7.0000000000000006e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.78945  normal  0.413936 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0686  L-threonine aldolase  29.5 
 
 		 352 aa  144  2e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.55205  normal  0.813644 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4955  L-threonine aldolase  29.62 
 
 		 346 aa  141  9.999999999999999e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0859  L-threonine aldolase  29.5 
 
 		 346 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.837968  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0809  L-threonine aldolase  30.45 
 
 		 350 aa  140  3.9999999999999997e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.107149 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4134  L-threonine aldolase  30.03 
 
 		 346 aa  139  7.999999999999999e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00000248279  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3617  Threonine aldolase  26.93 
 
 		 350 aa  139  8.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2289  Threonine aldolase  30.41 
 
 		 353 aa  138  2e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000548444 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3121  threonine aldolase  29.03 
 
 		 346 aa  138  2e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.021379  normal  0.710874 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3442  Threonine aldolase  29.03 
 
 		 346 aa  138  2e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4766  threonine aldolase  29.41 
 
 		 346 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.168867 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0572  Threonine aldolase  29.74 
 
 		 341 aa  136  6.0000000000000005e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0393816 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5210  L-threonine aldolase  29.45 
 
 		 346 aa  136  7.000000000000001e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00923139 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3318  Threonine aldolase  29.59 
 
 		 346 aa  135  8e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.564887 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3736  threonine aldolase  27.27 
 
 		 348 aa  135  9e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0824  Threonine aldolase  29.74 
 
 		 348 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.285953 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0880  L-threonine aldolase  28.24 
 
 		 349 aa  135  9.999999999999999e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5153  threonine aldolase  30.87 
 
 		 374 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.7123  normal  0.210542 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0921  Threonine aldolase  29.74 
 
 		 350 aa  135  9.999999999999999e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0410  threonine aldolase, low-specificity  29.41 
 
 		 346 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1658  L-threonine aldolase  29.48 
 
 		 362 aa  134  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.771324  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1928  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  29.82 
 
 		 352 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0114767  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1475  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  29.65 
 
 		 356 aa  134  3e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0754  Threonine aldolase  29.74 
 
 		 348 aa  134  3e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0601486 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0329  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  29.02 
 
 		 375 aa  133  5e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5175  Threonine aldolase  28.24 
 
 		 359 aa  133  5e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1179  threonine aldolase  27.19 
 
 		 343 aa  132  6e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.191301  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1236  threonine aldolase  31.79 
 
 		 368 aa  132  6.999999999999999e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0865335 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5568  Threonine aldolase  28.77 
 
 		 353 aa  132  1.0000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1651  Threonine aldolase  28.15 
 
 		 365 aa  131  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000248071 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1870  threonine aldolase  27.62 
 
 		 355 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.163709  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5537  threonine aldolase  28.4 
 
 		 348 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.145661  normal  0.0220713 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2821  Threonine aldolase  27.19 
 
 		 343 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.177516  normal  0.0977479 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2555  Threonine aldolase  29.82 
 
 		 352 aa  130  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.913127  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4886  threonine aldolase  29.12 
 
 		 346 aa  130  3e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.694097 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1982  Threonine aldolase  29.34 
 
 		 351 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000148999  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1314  L-threonine aldolase  29.49 
 
 		 343 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.341483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0343  threonine aldolase  29.41 
 
 		 346 aa  129  8.000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05504  putative low specificity L-threonine aldolase protein  28.86 
 
 		 365 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.264443 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0942  L-threonine aldolase  29.08 
 
 		 361 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2745  L-threonine aldolase  27.64 
 
 		 352 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71440  low specificity l-threonine aldolase  29.12 
 
 		 346 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000654342  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1610  threonine aldolase  26.82 
 
 		 343 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.692532  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0321  threonine aldolase  29.41 
 
 		 346 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000281363 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5263  L-threonine aldolase  28.03 
 
 		 358 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5352  L-threonine aldolase  28.03 
 
 		 358 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5642  L-threonine aldolase  28.03 
 
 		 358 aa  127  3e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6201  low specificity l-threonine aldolase  29.12 
 
 		 346 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0230725  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0983  threonine aldolase  29.3 
 
 		 348 aa  126  5e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00961292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0742  threonine aldolase  27.91 
 
 		 339 aa  126  5e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.622811 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3408  L-threonine aldolase, low-specificity  27.51 
 
 		 351 aa  125  8.000000000000001e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2249  L-threonine aldolase  26.61 
 
 		 349 aa  125  1e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3664  threonine aldolase  25.14 
 
 		 347 aa  125  1e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3318  Threonine aldolase  26.65 
 
 		 350 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.410103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0344  threonine aldolase  28.82 
 
 		 346 aa  124  3e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0808  low specificity L-threonine aldolase protein  29.53 
 
 		 345 aa  123  4e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.672671 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4278  threonine aldolase  27.45 
 
 		 349 aa  123  4e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.431757  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1646  L-threonine aldolase  25.87 
 
 		 349 aa  123  6e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1003  Threonine aldolase  28.49 
 
 		 361 aa  122  6e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1000  Threonine aldolase  28.49 
 
 		 371 aa  122  8e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.744976  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3333  Threonine aldolase  27.91 
 
 		 347 aa  122  9e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4433  threonine aldolase  25.14 
 
 		 353 aa  120  3e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1898  Threonine aldolase  27.65 
 
 		 375 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1555  threonine aldolase  28.25 
 
 		 364 aa  120  3.9999999999999996e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.746494 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3503  L-threonine aldolase  28.11 
 
 		 353 aa  120  4.9999999999999996e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1277  Threonine aldolase  26.76 
 
 		 357 aa  119  9e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.520088  normal  0.294941 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30040  L-threonine aldolase  27.51 
 
 		 353 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0678  Threonine aldolase  27.89 
 
 		 362 aa  117  3e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000267715 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2712  threonine aldolase  26.3 
 
 		 348 aa  116  5e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4021  threonine aldolase  26.44 
 
 		 350 aa  116  5e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0531782  normal  0.267182 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1966  threonine aldolase  26.09 
 
 		 345 aa  115  1.0000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0052  threonine aldolase, low-specificity, putative  28.43 
 
 		 349 aa  113  5e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.753871  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0977  threonine aldolase  24.93 
 
 		 341 aa  112  8.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.722961  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2014  Threonine aldolase  24.71 
 
 		 351 aa  112  1.0000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.316829  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0496  threonine aldolase  27.96 
 
 		 336 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.96601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1813  threonine aldolase  27.27 
 
 		 353 aa  109  8.000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.183317 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2153  L-threonine aldolase  25.72 
 
 		 338 aa  108  1e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.708772  normal  0.227327 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0112  Threonine aldolase  25.81 
 
 		 387 aa  108  1e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>