181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0300 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_0300  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  100 
 
 
337 aa  692    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1081  Threonine aldolase  39.64 
 
 
344 aa  246  4.9999999999999997e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00175946  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0474  low-specificity L-threonine aldolase  39.58 
 
 
345 aa  245  9.999999999999999e-64  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0904  threonine aldolase  40.35 
 
 
350 aa  243  3.9999999999999997e-63  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000336158  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2181  threonine aldolase  39.18 
 
 
346 aa  227  2e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0421215  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0635  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  36.55 
 
 
344 aa  224  1e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.538663  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0005  L-threonine aldolase, low-specificity  36.84 
 
 
351 aa  221  1.9999999999999999e-56  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7125  Threonine aldolase  37.76 
 
 
339 aa  218  7.999999999999999e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1162  Threonine aldolase  37.13 
 
 
345 aa  218  1e-55  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0576287 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0857  threonine aldolase  35.88 
 
 
341 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0883  hypothetical protein  35.96 
 
 
341 aa  213  3.9999999999999995e-54  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04194  threonine aldolase  38.63 
 
 
282 aa  207  2e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1756  hypothetical protein  35.5 
 
 
341 aa  207  3e-52  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0152757  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2927  Threonine aldolase  36.69 
 
 
345 aa  206  5e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0102  Threonine aldolase  36.06 
 
 
342 aa  199  5e-50  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08120  L-threonine aldolase  36.9 
 
 
344 aa  199  6e-50  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000672977  hitchhiker  0.0000000548027 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1377  hypothetical protein  34.51 
 
 
351 aa  198  1.0000000000000001e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0014162  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1404  hypothetical protein  34.51 
 
 
351 aa  198  1.0000000000000001e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.265494  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0686  L-threonine aldolase  34.82 
 
 
352 aa  170  4e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.55205  normal  0.813644 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1286  threonine aldolase  31.76 
 
 
340 aa  154  2e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.78945  normal  0.413936 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0572  Threonine aldolase  33.14 
 
 
341 aa  152  7e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0393816 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9381  Threonine aldolase  32.74 
 
 
352 aa  152  8.999999999999999e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01000  L-threonine aldolase  31.49 
 
 
357 aa  143  3e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1179  threonine aldolase  30.21 
 
 
343 aa  143  4e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.191301  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1657  L-threonine aldolase  29.94 
 
 
339 aa  139  6e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.789065  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1658  L-threonine aldolase  30.68 
 
 
362 aa  136  4e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.771324  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2555  Threonine aldolase  30.4 
 
 
352 aa  136  5e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.913127  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5153  threonine aldolase  30.41 
 
 
374 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.7123  normal  0.210542 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5210  L-threonine aldolase  30.21 
 
 
346 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00923139 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3121  threonine aldolase  31.53 
 
 
346 aa  129  9.000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.021379  normal  0.710874 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3442  Threonine aldolase  31.53 
 
 
346 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1651  Threonine aldolase  29.15 
 
 
365 aa  128  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000248071 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0977  threonine aldolase  26.92 
 
 
341 aa  127  3e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.722961  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5175  Threonine aldolase  27.08 
 
 
359 aa  126  5e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4134  L-threonine aldolase  29.03 
 
 
346 aa  125  7e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00000248279  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2606  threonine aldolase  26.84 
 
 
346 aa  125  1e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000143153  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1898  Threonine aldolase  30.21 
 
 
375 aa  125  1e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0880  L-threonine aldolase  29.87 
 
 
349 aa  124  2e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3318  Threonine aldolase  29.93 
 
 
346 aa  124  2e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.564887 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1475  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  31.27 
 
 
356 aa  123  5e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0824  Threonine aldolase  29.67 
 
 
348 aa  122  6e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.285953 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1870  threonine aldolase  27.87 
 
 
355 aa  122  9e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.163709  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0754  Threonine aldolase  28.24 
 
 
348 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0601486 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1176  L-threonine aldolase  29.45 
 
 
340 aa  120  3e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1982  Threonine aldolase  27.57 
 
 
351 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000148999  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0808  low specificity L-threonine aldolase protein  29.67 
 
 
345 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.672671 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0859  L-threonine aldolase  29.33 
 
 
346 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.837968  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1555  threonine aldolase  28.67 
 
 
364 aa  118  9.999999999999999e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.746494 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0343  threonine aldolase  28.53 
 
 
346 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2821  Threonine aldolase  27.65 
 
 
343 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.177516  normal  0.0977479 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4532  Threonine aldolase  28.91 
 
 
369 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.334548  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1610  threonine aldolase  27.06 
 
 
343 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.692532  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0809  L-threonine aldolase  27.22 
 
 
350 aa  117  3e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.107149 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1003  Threonine aldolase  28.45 
 
 
361 aa  117  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0329  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  26.21 
 
 
375 aa  117  3.9999999999999997e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0321  threonine aldolase  28.24 
 
 
346 aa  116  5e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000281363 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1000  Threonine aldolase  28.45 
 
 
371 aa  116  5e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.744976  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4766  threonine aldolase  27.73 
 
 
346 aa  115  7.999999999999999e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.168867 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5263  L-threonine aldolase  28.12 
 
 
358 aa  115  8.999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5352  L-threonine aldolase  28.12 
 
 
358 aa  115  8.999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0410  threonine aldolase, low-specificity  28.74 
 
 
346 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5642  L-threonine aldolase  28.12 
 
 
358 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6201  low specificity l-threonine aldolase  29.77 
 
 
346 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0230725  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4886  threonine aldolase  28.78 
 
 
346 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.694097 
 
 
-
 
NC_003296  RS05504  putative low specificity L-threonine aldolase protein  28.91 
 
 
365 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.264443 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1314  L-threonine aldolase  28.81 
 
 
343 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.341483  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71440  low specificity l-threonine aldolase  29.77 
 
 
346 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000654342  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0344  threonine aldolase  27.94 
 
 
346 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3503  L-threonine aldolase  26.36 
 
 
353 aa  114  3e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0942  L-threonine aldolase  28.15 
 
 
361 aa  114  3e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1236  threonine aldolase  27.68 
 
 
368 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0865335 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3333  Threonine aldolase  25.87 
 
 
347 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2302  L-threonine aldolase  26.63 
 
 
341 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1646  L-threonine aldolase  28.41 
 
 
349 aa  112  1.0000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3408  L-threonine aldolase, low-specificity  25.45 
 
 
351 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4955  L-threonine aldolase  25.74 
 
 
346 aa  110  4.0000000000000004e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30040  L-threonine aldolase  25.64 
 
 
353 aa  108  9.000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1928  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  28.99 
 
 
352 aa  108  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0114767  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2289  Threonine aldolase  27.09 
 
 
353 aa  107  3e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000548444 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2745  L-threonine aldolase  27.4 
 
 
352 aa  105  8e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0678  Threonine aldolase  29.39 
 
 
362 aa  105  9e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000267715 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0921  Threonine aldolase  27.33 
 
 
350 aa  105  1e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5537  threonine aldolase  27.42 
 
 
348 aa  105  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.145661  normal  0.0220713 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0983  threonine aldolase  28.41 
 
 
348 aa  104  3e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00961292  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4021  threonine aldolase  26.88 
 
 
350 aa  104  3e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0531782  normal  0.267182 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0742  threonine aldolase  28.92 
 
 
339 aa  103  3e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.622811 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2198  threonine aldolase  28.65 
 
 
341 aa  103  4e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4278  threonine aldolase  28.8 
 
 
349 aa  103  5e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.431757  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2249  L-threonine aldolase  27.14 
 
 
349 aa  102  8e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3617  Threonine aldolase  27.95 
 
 
350 aa  102  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3664  threonine aldolase  27.48 
 
 
347 aa  101  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2014  Threonine aldolase  26.67 
 
 
351 aa  100  3e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.316829  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3736  threonine aldolase  27.22 
 
 
348 aa  100  4e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1277  Threonine aldolase  26.35 
 
 
357 aa  99.8  6e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.520088  normal  0.294941 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4433  threonine aldolase  28.86 
 
 
353 aa  99  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3318  Threonine aldolase  27.27 
 
 
350 aa  98.6  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.410103  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2153  L-threonine aldolase  26.61 
 
 
338 aa  97.1  4e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.708772  normal  0.227327 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0052  threonine aldolase, low-specificity, putative  28.52 
 
 
349 aa  96.3  7e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.753871  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5568  Threonine aldolase  25.07 
 
 
353 aa  94  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1966  threonine aldolase  27.41 
 
 
345 aa  93.2  5e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>