168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0635 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_0635  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  100 
 
 
344 aa  718    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.538663  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1162  Threonine aldolase  60.41 
 
 
345 aa  452  1.0000000000000001e-126  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0576287 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2181  threonine aldolase  61.7 
 
 
346 aa  439  9.999999999999999e-123  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0421215  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0005  L-threonine aldolase, low-specificity  55.85 
 
 
351 aa  405  1.0000000000000001e-112  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1081  Threonine aldolase  55.72 
 
 
344 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00175946  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08120  L-threonine aldolase  50.58 
 
 
344 aa  367  1e-100  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000672977  hitchhiker  0.0000000548027 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1756  hypothetical protein  51.63 
 
 
341 aa  355  5.999999999999999e-97  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0152757  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0474  low-specificity L-threonine aldolase  51.92 
 
 
345 aa  355  7.999999999999999e-97  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0883  hypothetical protein  49.85 
 
 
341 aa  351  8.999999999999999e-96  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7125  Threonine aldolase  49.42 
 
 
339 aa  343  2e-93  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1377  hypothetical protein  48.09 
 
 
351 aa  334  1e-90  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0014162  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1404  hypothetical protein  48.09 
 
 
351 aa  334  1e-90  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.265494  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2927  Threonine aldolase  47.08 
 
 
345 aa  328  9e-89  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0102  Threonine aldolase  46.92 
 
 
342 aa  328  1.0000000000000001e-88  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04194  threonine aldolase  55.43 
 
 
282 aa  304  1.0000000000000001e-81  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0857  threonine aldolase  43.07 
 
 
341 aa  294  1e-78  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0904  threonine aldolase  40.63 
 
 
350 aa  284  1.0000000000000001e-75  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000336158  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0300  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  36.55 
 
 
337 aa  224  1e-57  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0686  L-threonine aldolase  32.34 
 
 
352 aa  177  3e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.55205  normal  0.813644 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1286  threonine aldolase  31.38 
 
 
340 aa  172  5e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.78945  normal  0.413936 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1657  L-threonine aldolase  32.18 
 
 
339 aa  167  2e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.789065  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0572  Threonine aldolase  30.79 
 
 
341 aa  164  3e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0393816 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2606  threonine aldolase  30.99 
 
 
346 aa  160  2e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000143153  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01000  L-threonine aldolase  31.18 
 
 
357 aa  159  7e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9381  Threonine aldolase  31.47 
 
 
352 aa  158  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1658  L-threonine aldolase  33.04 
 
 
362 aa  153  4e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.771324  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1651  Threonine aldolase  32.19 
 
 
365 aa  152  1e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000248071 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1236  threonine aldolase  31.66 
 
 
368 aa  150  2e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0865335 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5568  Threonine aldolase  31.34 
 
 
353 aa  149  5e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0329  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  27.3 
 
 
375 aa  149  5e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4955  L-threonine aldolase  29.28 
 
 
346 aa  149  8e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1003  Threonine aldolase  29.57 
 
 
361 aa  148  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1000  Threonine aldolase  29.57 
 
 
371 aa  148  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.744976  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1610  threonine aldolase  28.61 
 
 
343 aa  147  3e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.692532  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3442  Threonine aldolase  29.74 
 
 
346 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3121  threonine aldolase  29.74 
 
 
346 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.021379  normal  0.710874 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0942  L-threonine aldolase  29.28 
 
 
361 aa  146  5e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2821  Threonine aldolase  28.99 
 
 
343 aa  146  6e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.177516  normal  0.0977479 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1982  Threonine aldolase  30.93 
 
 
351 aa  145  8.000000000000001e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000148999  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4021  threonine aldolase  30.23 
 
 
350 aa  145  1e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0531782  normal  0.267182 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2555  Threonine aldolase  30.4 
 
 
352 aa  145  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.913127  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5175  Threonine aldolase  29.12 
 
 
359 aa  145  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4766  threonine aldolase  30.72 
 
 
346 aa  144  2e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.168867 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1179  threonine aldolase  27.54 
 
 
343 aa  144  3e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.191301  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1314  L-threonine aldolase  28.99 
 
 
343 aa  143  4e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.341483  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0410  threonine aldolase, low-specificity  29.74 
 
 
346 aa  143  5e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4886  threonine aldolase  29.07 
 
 
346 aa  143  5e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.694097 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0921  Threonine aldolase  29.46 
 
 
350 aa  143  6e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3408  L-threonine aldolase, low-specificity  30.03 
 
 
351 aa  142  8e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1475  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  29.74 
 
 
356 aa  141  9.999999999999999e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0859  L-threonine aldolase  29.24 
 
 
346 aa  142  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.837968  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5210  L-threonine aldolase  29.65 
 
 
346 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00923139 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4134  L-threonine aldolase  29.07 
 
 
346 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00000248279  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4433  threonine aldolase  29.6 
 
 
353 aa  140  3e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0880  L-threonine aldolase  28.49 
 
 
349 aa  140  3e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0824  Threonine aldolase  28.7 
 
 
348 aa  140  3e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.285953 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0808  low specificity L-threonine aldolase protein  30.14 
 
 
345 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.672671 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3318  Threonine aldolase  27.7 
 
 
346 aa  139  6e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.564887 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4532  Threonine aldolase  32.46 
 
 
369 aa  139  8.999999999999999e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.334548  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0809  L-threonine aldolase  27.59 
 
 
350 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.107149 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0754  Threonine aldolase  28.57 
 
 
348 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0601486 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0343  threonine aldolase  28.65 
 
 
346 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05504  putative low specificity L-threonine aldolase protein  28.12 
 
 
365 aa  137  4e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.264443 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5537  threonine aldolase  29.15 
 
 
348 aa  136  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.145661  normal  0.0220713 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0321  threonine aldolase  28.36 
 
 
346 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000281363 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5263  L-threonine aldolase  31.53 
 
 
358 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5352  L-threonine aldolase  31.53 
 
 
358 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71440  low specificity l-threonine aldolase  29.36 
 
 
346 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000654342  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5642  L-threonine aldolase  31.53 
 
 
358 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1870  threonine aldolase  28.07 
 
 
355 aa  134  3e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.163709  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0344  threonine aldolase  27.91 
 
 
346 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3664  threonine aldolase  27.71 
 
 
347 aa  133  5e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6201  low specificity l-threonine aldolase  29.36 
 
 
346 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0230725  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3333  Threonine aldolase  27.46 
 
 
347 aa  129  7.000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2289  Threonine aldolase  27.99 
 
 
353 aa  129  9.000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000548444 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2249  L-threonine aldolase  28.41 
 
 
349 aa  129  9.000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1555  threonine aldolase  27.35 
 
 
364 aa  129  9.000000000000001e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.746494 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30040  L-threonine aldolase  28.57 
 
 
353 aa  129  9.000000000000001e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5153  threonine aldolase  28.18 
 
 
374 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.7123  normal  0.210542 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1928  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  27.41 
 
 
352 aa  125  8.000000000000001e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0114767  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3503  L-threonine aldolase  28.86 
 
 
353 aa  125  8.000000000000001e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1646  L-threonine aldolase  27.54 
 
 
349 aa  125  8.000000000000001e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4278  threonine aldolase  26.78 
 
 
349 aa  125  1e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.431757  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3736  threonine aldolase  28.45 
 
 
348 aa  123  4e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1966  threonine aldolase  27.6 
 
 
345 aa  123  4e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1898  Threonine aldolase  29.12 
 
 
375 aa  122  7e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0983  threonine aldolase  27.86 
 
 
348 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00961292  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3617  Threonine aldolase  25.44 
 
 
350 aa  120  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2745  L-threonine aldolase  28.49 
 
 
352 aa  116  6e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0496  threonine aldolase  29.82 
 
 
336 aa  115  7.999999999999999e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.96601  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3876  Threonine aldolase  27.01 
 
 
350 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.533395 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0052  threonine aldolase, low-specificity, putative  26.21 
 
 
349 aa  114  2.0000000000000002e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.753871  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1844  threonine aldolase  26.2 
 
 
355 aa  114  2.0000000000000002e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.95316  normal  0.0155245 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0678  Threonine aldolase  30.86 
 
 
362 aa  112  6e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000267715 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3267  L-threonine aldolase  25.95 
 
 
338 aa  112  8.000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1176  L-threonine aldolase  28.69 
 
 
340 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0742  threonine aldolase  29.18 
 
 
339 aa  112  1.0000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.622811 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1277  Threonine aldolase  28.2 
 
 
357 aa  110  3e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.520088  normal  0.294941 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3318  Threonine aldolase  26.02 
 
 
350 aa  109  6e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.410103  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1430  L-threonine aldolase  26.98 
 
 
350 aa  109  7.000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>