248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0304 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP0304  nucleoside permease NupC, putative  100 
 
 		 409 aa  814    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0682  Na+ dependent nucleoside transporter  86.31 
 
 		 409 aa  719    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0667  Na+ dependent nucleoside transporter  86.31 
 
 		 409 aa  719    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0742551  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0101  Na+ dependent nucleoside transporter  53.53 
 
 		 403 aa  445  1.0000000000000001e-124  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000176042  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0796  nucleoside permease  53 
 
 		 407 aa  399  9.999999999999999e-111  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.150874  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2710  nucleoside transporter  43.77 
 
 		 397 aa  333  2e-90  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.166776  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3026  nucleoside transporter, NupC family  44.01 
 
 		 397 aa  334  2e-90  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.446251  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2987  nucleoside transporter, NupC family  44.01 
 
 		 397 aa  333  2e-90  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000283568 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2780  NupC family nucleoside transporter  44.01 
 
 		 397 aa  333  3e-90  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.110088  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2729  nucleoside transporter  44.01 
 
 		 397 aa  333  3e-90  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2991  NupC family nucleoside transporter  44.01 
 
 		 397 aa  333  3e-90  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0241796  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2992  nucleoside transporter, NupC family  43.52 
 
 		 397 aa  329  4e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3027  NupC family nucleoside transporter  44.01 
 
 		 397 aa  328  8e-89  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.240911  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2253  nucleoside transporter, NupC family  44.01 
 
 		 397 aa  328  9e-89  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.164569 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2787  nucleoside transporter  42.79 
 
 		 397 aa  325  7e-88  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.416184  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2701  nucleoside transporter  35.75 
 
 		 394 aa  227  3e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0555199  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1281  pyrimidine nucleoside transporter  33.82 
 
 		 393 aa  225  9e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00013711  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1492  NupC family nucleoside transporter  33.82 
 
 		 393 aa  224  2e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0149107  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0161  nucleoside permease NupC  32.03 
 
 		 404 aa  223  4e-57  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1207  nucleoside transporter  35.57 
 
 		 393 aa  221  9.999999999999999e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00208272  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1753  nucleoside transporter  33.33 
 
 		 393 aa  219  7e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000013033  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2965  nucleoside transporter  34.16 
 
 		 398 aa  218  1e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2927  nucleoside transporter  34 
 
 		 395 aa  218  1e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0518898  normal  0.239717 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1976  nucleoside transporter NupC  33.09 
 
 		 393 aa  218  2e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000181124  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1313  nucleoside transporter  34.99 
 
 		 398 aa  218  2e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.284324  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3624  nucleoside transporter NupC  34.53 
 
 		 400 aa  218  2e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00341076  normal  0.575462 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3416  nucleoside transporter  34.61 
 
 		 395 aa  217  2.9999999999999998e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000564336  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2552  nucleoside transporter NupC  34.72 
 
 		 400 aa  217  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00708575  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2601  nucleoside transporter NupC  34.72 
 
 		 400 aa  217  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.263795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1326  nucleoside transporter NupC  34.97 
 
 		 394 aa  217  2.9999999999999998e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000589339  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1438  nucleoside transporter  34.97 
 
 		 394 aa  217  2.9999999999999998e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0187769  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2667  nucleoside transporter NupC  34.72 
 
 		 400 aa  217  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2530  nucleoside transporter NupC  34.27 
 
 		 400 aa  216  4e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.290287  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02302  nucleoside (except guanosine) transporter  34.27 
 
 		 400 aa  216  4e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.189478  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1265  nucleoside transporter  34.27 
 
 		 400 aa  216  4e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.683871  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02263  hypothetical protein  34.27 
 
 		 400 aa  216  4e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.179637  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2683  nucleoside transporter NupC  34.27 
 
 		 400 aa  216  4e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000153474  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2761  nucleoside transporter NupC  34.27 
 
 		 400 aa  216  4e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.246953  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2643  nucleoside transporter NupC  34.46 
 
 		 400 aa  216  4e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1277  nucleoside transporter  34.27 
 
 		 400 aa  216  4e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.875115  normal  0.0905888 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2544  nucleoside transporter NupC  34.27 
 
 		 400 aa  216  4e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000306295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2773  nucleoside transporter NupC  34.72 
 
 		 400 aa  216  5.9999999999999996e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.571863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3640  Na+ dependent nucleoside transporter  33.09 
 
 		 393 aa  216  7e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1896  nucleoside transporter NupC  32.84 
 
 		 393 aa  215  9e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000063998  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3450  nucleoside transporter NupC  32.84 
 
 		 393 aa  215  9e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00363674  hitchhiker  1.36656e-16 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1755  nucleoside transporter NupC  32.84 
 
 		 393 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0165255  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1733  nucleoside transporter  32.84 
 
 		 393 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000121674  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1893  nucleoside transporter NupC  32.84 
 
 		 393 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00196927  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2003  nucleoside transporter NupC  32.84 
 
 		 393 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000635472  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1928  nucleoside transporter NupC  32.84 
 
 		 393 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.80258e-46 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1704  nucleoside transporter  32.6 
 
 		 393 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00533341  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0543  Na+ dependent nucleoside transporter  32.48 
 
 		 404 aa  213  4.9999999999999996e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0557  Na+ dependent nucleoside transporter  32.48 
 
 		 404 aa  213  4.9999999999999996e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0674  NupC family nucleoside transporter  32.92 
 
 		 392 aa  209  5e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0733  nucleoside transporter, NupC family  32.92 
 
 		 392 aa  209  5e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.998503  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4694  nucleoside transporter, NupC family  32.92 
 
 		 392 aa  209  7e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0178149  hitchhiker  0.000000000152911 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0662  nucleoside transporter, NupC family  33 
 
 		 392 aa  209  9e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.31194e-30 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0644  nucleoside transporter, NupC family  32.92 
 
 		 392 aa  209  9e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.617148  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5198  NupC family nucleoside transporter  33.25 
 
 		 393 aa  208  1e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000185206  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5166  nucleoside transporter, NupC family  33.25 
 
 		 393 aa  208  1e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.19661e-59 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0573  NupC family nucleoside transporter  33.08 
 
 		 392 aa  209  1e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0517  nucleoside permease  33.08 
 
 		 392 aa  208  1e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4766  NupC family nucleoside transporter  33.25 
 
 		 393 aa  208  1e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  3.81544e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4785  NupC family nucleoside transporter  33.25 
 
 		 393 aa  208  1e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000762295  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0606  NupC family nucleoside transporter  33.08 
 
 		 392 aa  209  1e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3637  Na+ dependent nucleoside transporter  34.64 
 
 		 394 aa  208  1e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.9572 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4922  NupC family nucleoside transporter  33.25 
 
 		 393 aa  208  2e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000367634  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5298  NupC family nucleoside transporter  33.25 
 
 		 393 aa  208  2e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000710562  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3641  Na+ dependent nucleoside transporter  32.59 
 
 		 393 aa  208  2e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0933275  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4861  nucleoside transporter  33.08 
 
 		 394 aa  207  2e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00699711 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5203  nucleoside transporter, NupC family  32.99 
 
 		 393 aa  208  2e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000345335  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4883  Na+ dependent nucleoside transporter  32.99 
 
 		 393 aa  207  3e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000732708  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5213  nucleoside transporter, NupC family  32.99 
 
 		 393 aa  206  5e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000156802  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0517  nucleoside permease  33.08 
 
 		 392 aa  206  6e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4884  Na+ dependent nucleoside transporter  33.76 
 
 		 393 aa  206  8e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000642278  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5199  NupC family nucleoside transporter  33.51 
 
 		 393 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000293226  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5204  nucleoside transporter, NupC family  33.51 
 
 		 393 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000290265  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5214  nucleoside transporter, NupC family  33.51 
 
 		 393 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000833528  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1544  Na+ dependent nucleoside transporter  33.68 
 
 		 394 aa  201  3e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.13082 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4923  NupC family nucleoside transporter  33.25 
 
 		 393 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000248626  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4786  NupC family nucleoside transporter  33.25 
 
 		 393 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000304389  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5299  NupC family nucleoside transporter  33.25 
 
 		 393 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000694938  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4767  NupC family nucleoside transporter  33.25 
 
 		 393 aa  200  5e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  7.53669e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5167  nucleoside transporter, NupC family  33.25 
 
 		 393 aa  200  5e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.6707700000000002e-61 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0044  nucleoside transporter, NupC family  33.25 
 
 		 393 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000638682  unclonable  9.769680000000001e-26 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0520  Na+ dependent nucleoside transporter  32.42 
 
 		 392 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3332  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  33.67 
 
 		 394 aa  195  1e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.2382  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1150  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  33.09 
 
 		 405 aa  194  3e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0678065  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0296  Na+ dependent nucleoside transporter  28.64 
 
 		 406 aa  193  5e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.589697  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0303  Na+ dependent nucleoside transporter  28.64 
 
 		 406 aa  193  5e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0820  nucleoside permease  31.86 
 
 		 394 aa  190  4e-47  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.890924  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0310  Na+ dependent nucleoside transporter  30.64 
 
 		 398 aa  177  4e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0312  Na+ dependent nucleoside transporter  30.51 
 
 		 398 aa  172  1e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0317  NupC family nucleoside transporter  29.73 
 
 		 398 aa  170  4e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0576601  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0300  nucleoside transporter  29.73 
 
 		 398 aa  170  4e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0304  nucleoside transporter  29.73 
 
 		 398 aa  170  4e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000825173  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0332  NupC family nucleoside transporter  29.73 
 
 		 398 aa  170  4e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0364  nucleoside transporter, NupC family  29.73 
 
 		 398 aa  170  4e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0379  nucleoside transporter, NupC family  29.24 
 
 		 398 aa  169  1e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.633762  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4940  nucleoside transporter, NupC family  29.24 
 
 		 398 aa  169  1e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.386033  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>