248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_2544 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011353  ECH74115_3624  nucleoside transporter NupC  99.5 
 
 		 400 aa  783    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00341076  normal  0.575462 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02302  nucleoside (except guanosine) transporter  100 
 
 		 400 aa  787    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.189478  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1265  nucleoside transporter  100 
 
 		 400 aa  787    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.683871  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2530  nucleoside transporter NupC  100 
 
 		 400 aa  787    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.290287  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02263  hypothetical protein  100 
 
 		 400 aa  787    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.179637  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1438  nucleoside transporter  81 
 
 		 394 aa  636    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0187769  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1277  nucleoside transporter  100 
 
 		 400 aa  787    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.875115  normal  0.0905888 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2773  nucleoside transporter NupC  98 
 
 		 400 aa  778    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.571863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2683  nucleoside transporter NupC  100 
 
 		 400 aa  787    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000153474  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2552  nucleoside transporter NupC  98.25 
 
 		 400 aa  779    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00708575  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2667  nucleoside transporter NupC  98.25 
 
 		 400 aa  779    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1326  nucleoside transporter NupC  81 
 
 		 394 aa  636    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000589339  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2643  nucleoside transporter NupC  97.75 
 
 		 400 aa  752    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2544  nucleoside transporter NupC  100 
 
 		 400 aa  787    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000306295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2601  nucleoside transporter NupC  98.25 
 
 		 400 aa  779    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.263795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2927  nucleoside transporter  95.25 
 
 		 395 aa  746    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0518898  normal  0.239717 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2761  nucleoside transporter NupC  100 
 
 		 400 aa  787    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.246953  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3416  nucleoside transporter  80.5 
 
 		 395 aa  633  1e-180  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000564336  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2701  nucleoside transporter  80.5 
 
 		 394 aa  619  1e-176  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0555199  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2965  nucleoside transporter  77.61 
 
 		 398 aa  611  9.999999999999999e-175  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1313  nucleoside transporter  77.36 
 
 		 398 aa  609  1e-173  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.284324  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1207  nucleoside transporter  77.5 
 
 		 393 aa  608  1e-173  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00208272  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3332  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  72 
 
 		 394 aa  578  1e-164  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.2382  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4861  nucleoside transporter  71 
 
 		 394 aa  572  1.0000000000000001e-162  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00699711 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3637  Na+ dependent nucleoside transporter  70.25 
 
 		 394 aa  574  1.0000000000000001e-162  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.9572 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1544  Na+ dependent nucleoside transporter  71.25 
 
 		 394 aa  546  1e-154  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.13082 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0662  nucleoside transporter, NupC family  60.05 
 
 		 392 aa  470  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.31194e-30 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0644  nucleoside transporter, NupC family  59.8 
 
 		 392 aa  468  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.617148  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0674  NupC family nucleoside transporter  59.55 
 
 		 392 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3640  Na+ dependent nucleoside transporter  58.29 
 
 		 393 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0573  NupC family nucleoside transporter  59.8 
 
 		 392 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0517  nucleoside permease  60.05 
 
 		 392 aa  468  9.999999999999999e-131  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0517  nucleoside permease  59.8 
 
 		 392 aa  467  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0606  NupC family nucleoside transporter  59.8 
 
 		 392 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4694  nucleoside transporter, NupC family  59.55 
 
 		 392 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0178149  hitchhiker  0.000000000152911 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0733  nucleoside transporter, NupC family  59.3 
 
 		 392 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.998503  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0520  Na+ dependent nucleoside transporter  59.8 
 
 		 392 aa  462  1e-129  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5198  NupC family nucleoside transporter  60 
 
 		 393 aa  458  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000185206  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5203  nucleoside transporter, NupC family  60.53 
 
 		 393 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000345335  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4766  NupC family nucleoside transporter  60 
 
 		 393 aa  458  9.999999999999999e-129  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  3.81544e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4785  NupC family nucleoside transporter  60 
 
 		 393 aa  458  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000762295  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5166  nucleoside transporter, NupC family  60 
 
 		 393 aa  458  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.19661e-59 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4922  NupC family nucleoside transporter  59.74 
 
 		 393 aa  457  1e-127  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000367634  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4883  Na+ dependent nucleoside transporter  59.21 
 
 		 393 aa  455  1e-127  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000732708  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5298  NupC family nucleoside transporter  59.74 
 
 		 393 aa  457  1e-127  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000710562  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5213  nucleoside transporter, NupC family  59.47 
 
 		 393 aa  456  1e-127  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000156802  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5199  NupC family nucleoside transporter  60 
 
 		 393 aa  451  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000293226  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3641  Na+ dependent nucleoside transporter  57.54 
 
 		 393 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0933275  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5214  nucleoside transporter, NupC family  60 
 
 		 393 aa  451  1e-125  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000833528  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4923  NupC family nucleoside transporter  60 
 
 		 393 aa  450  1e-125  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000248626  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4767  NupC family nucleoside transporter  60 
 
 		 393 aa  449  1e-125  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  7.53669e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4786  NupC family nucleoside transporter  60 
 
 		 393 aa  450  1e-125  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000304389  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4884  Na+ dependent nucleoside transporter  60 
 
 		 393 aa  450  1e-125  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000642278  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5299  NupC family nucleoside transporter  60 
 
 		 393 aa  450  1e-125  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000694938  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5204  nucleoside transporter, NupC family  59.74 
 
 		 393 aa  449  1e-125  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000290265  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5167  nucleoside transporter, NupC family  60 
 
 		 393 aa  449  1e-125  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.6707700000000002e-61 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0044  nucleoside transporter, NupC family  59.47 
 
 		 393 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000638682  unclonable  9.769680000000001e-26 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1976  nucleoside transporter NupC  59.95 
 
 		 393 aa  442  1e-123  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000181124  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1753  nucleoside transporter  59.95 
 
 		 393 aa  443  1e-123  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000013033  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2003  nucleoside transporter NupC  59.69 
 
 		 393 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000635472  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1896  nucleoside transporter NupC  59.44 
 
 		 393 aa  438  1e-121  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000063998  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1755  nucleoside transporter NupC  59.69 
 
 		 393 aa  438  1e-121  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0165255  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1733  nucleoside transporter  59.69 
 
 		 393 aa  438  1e-121  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000121674  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1704  nucleoside transporter  59.69 
 
 		 393 aa  437  1e-121  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00533341  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1893  nucleoside transporter NupC  59.69 
 
 		 393 aa  438  1e-121  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00196927  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1928  nucleoside transporter NupC  59.44 
 
 		 393 aa  435  1e-121  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.80258e-46 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3450  nucleoside transporter NupC  59.18 
 
 		 393 aa  437  1e-121  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00363674  hitchhiker  1.36656e-16 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1492  NupC family nucleoside transporter  56.23 
 
 		 393 aa  421  1e-117  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0149107  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1281  pyrimidine nucleoside transporter  56.23 
 
 		 393 aa  421  1e-117  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00013711  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0161  nucleoside permease NupC  57.11 
 
 		 404 aa  409  1e-113  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0543  Na+ dependent nucleoside transporter  56.19 
 
 		 404 aa  405  1.0000000000000001e-112  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0557  Na+ dependent nucleoside transporter  56.19 
 
 		 404 aa  405  1.0000000000000001e-112  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1150  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  53.85 
 
 		 405 aa  398  9.999999999999999e-111  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0678065  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0303  Na+ dependent nucleoside transporter  43.55 
 
 		 406 aa  352  5.9999999999999994e-96  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0296  Na+ dependent nucleoside transporter  43.55 
 
 		 406 aa  352  5.9999999999999994e-96  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.589697  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0820  nucleoside permease  45.76 
 
 		 394 aa  315  6e-85  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.890924  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0310  Na+ dependent nucleoside transporter  42.13 
 
 		 398 aa  289  5.0000000000000004e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4940  nucleoside transporter, NupC family  40.61 
 
 		 398 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.386033  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0379  nucleoside transporter, NupC family  40.61 
 
 		 398 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.633762  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0317  NupC family nucleoside transporter  40.56 
 
 		 398 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0576601  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0300  nucleoside transporter  40.56 
 
 		 398 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0304  nucleoside transporter  40.56 
 
 		 398 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000825173  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0332  NupC family nucleoside transporter  40.56 
 
 		 398 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0364  nucleoside transporter, NupC family  40.56 
 
 		 398 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0312  Na+ dependent nucleoside transporter  40.56 
 
 		 398 aa  282  7.000000000000001e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0405  nucleoside transporter, NupC family  41.07 
 
 		 398 aa  282  9e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.525323  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0362  NupC family nucleoside transporter  40.56 
 
 		 398 aa  278  9e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2710  nucleoside transporter  34.61 
 
 		 397 aa  240  4e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.166776  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2253  nucleoside transporter, NupC family  34.17 
 
 		 397 aa  239  4e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.164569 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3027  NupC family nucleoside transporter  34.17 
 
 		 397 aa  239  8e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.240911  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2780  NupC family nucleoside transporter  34.61 
 
 		 397 aa  238  2e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.110088  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2729  nucleoside transporter  34.61 
 
 		 397 aa  238  2e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2991  NupC family nucleoside transporter  34.61 
 
 		 397 aa  238  2e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0241796  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3026  nucleoside transporter, NupC family  34.61 
 
 		 397 aa  237  2e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.446251  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2992  nucleoside transporter, NupC family  34.61 
 
 		 397 aa  236  5.0000000000000005e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2987  nucleoside transporter, NupC family  34.35 
 
 		 397 aa  236  5.0000000000000005e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000283568 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2787  nucleoside transporter  34.09 
 
 		 397 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.416184  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0682  Na+ dependent nucleoside transporter  36.06 
 
 		 409 aa  222  9.999999999999999e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0667  Na+ dependent nucleoside transporter  36.06 
 
 		 409 aa  222  9.999999999999999e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0742551  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0304  nucleoside permease NupC, putative  34.27 
 
 		 409 aa  216  4e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>