24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_4117 on replicon NC_009430
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009430  Rsph17025_4117  hypothetical protein  100 
 
 		 63 aa  127  4.0000000000000003e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4081  resolvase domain-containing protein  69.64 
 
 		 199 aa  89  2e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0381075 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3876  resolvase domain-containing protein  69.64 
 
 		 199 aa  89  2e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.3792 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3680  resolvase domain-containing protein  69.64 
 
 		 199 aa  89  2e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0471  resolvase  49.21 
 
 		 197 aa  69.3  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0955  Resolvase domain protein  57.14 
 
 		 194 aa  69.3  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25710  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  50.85 
 
 		 201 aa  67.4  0.00000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3655  Resolvase domain protein  47.62 
 
 		 212 aa  67  0.00000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0554731  normal  0.301287 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3572  Resolvase domain protein  47.62 
 
 		 213 aa  66.6  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000252709  hitchhiker  0.00189094 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1397  Resolvase domain protein  51.79 
 
 		 209 aa  63.5  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.954133  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3862  resolvase domain-containing protein  43.64 
 
 		 194 aa  45.8  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0506724  unclonable  0.00000235811 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4991  resolvase domain-containing protein  38.46 
 
 		 189 aa  44.3  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4386  resolvase  39.62 
 
 		 219 aa  43.5  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1052  Resolvase domain  39.22 
 
 		 186 aa  42.4  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5093  resolvase domain-containing protein  38.89 
 
 		 201 aa  42  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.993134 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4137  resolvase domain-containing protein  34.92 
 
 		 224 aa  41.2  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.130251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0380  hypothetical protein  62.07 
 
 		 34 aa  41.2  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0371525  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2757  resolvase domain-containing protein  38.46 
 
 		 188 aa  40.8  0.006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4190  resolvase  37.1 
 
 		 190 aa  40.8  0.006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4290  resolvase  37.1 
 
 		 190 aa  40.8  0.006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4459  resolvase  37.1 
 
 		 190 aa  40.8  0.006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2351  resolvase-like protein  38.71 
 
 		 235 aa  40.8  0.006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.329475 
 
 
-
 
NC_009340  Mflv_5591  resolvase domain-containing protein  46.67 
 
 		 180 aa  40.4  0.008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5037  resolvase domain-containing protein  31.48 
 
 		 201 aa  40  0.01  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.931406  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>