18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3735 on replicon NC_009429
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009429  Rsph17025_3735  hypothetical protein  100 
 
 
200 aa  408  1e-113  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0556  hypothetical protein  66.15 
 
 
196 aa  277  6e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1681  hypothetical protein  61.14 
 
 
196 aa  262  2e-69  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000644612 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1610  hypothetical protein  60.1 
 
 
203 aa  254  4e-67  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.591771  normal  0.0598234 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2211  hypothetical protein  57.81 
 
 
202 aa  250  8.000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.631963  normal  0.769285 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2290  hypothetical protein  35.05 
 
 
191 aa  120  9.999999999999999e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2495  hypothetical protein  36.04 
 
 
188 aa  117  9.999999999999999e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0291  hypothetical protein  33.67 
 
 
194 aa  114  6.9999999999999995e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1893  hypothetical protein  32.28 
 
 
192 aa  106  3e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0786568  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1297  hypothetical protein  32.98 
 
 
179 aa  102  3e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.202094  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5023  putative cytoplasmic protein  32.82 
 
 
193 aa  101  8e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.490812  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0337  hypothetical protein  28.73 
 
 
200 aa  88.6  5e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.000413901  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02970  protein of unknown function (DUF1788)  34.33 
 
 
200 aa  85.5  4e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4843  hypothetical protein  27.84 
 
 
202 aa  52.8  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0250264  normal  0.110684 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1122  hypothetical protein  21.95 
 
 
191 aa  46.6  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1154  hypothetical protein  21.97 
 
 
211 aa  41.2  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0599  hypothetical protein  23.56 
 
 
205 aa  41.2  0.01  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1233  hypothetical protein  23.56 
 
 
205 aa  41.2  0.01  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.548904 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>