15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_1154 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011891  A2cp1_1154  hypothetical protein  100 
 
 		 211 aa  421  1e-117  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3082  hypothetical protein  58.77 
 
 		 211 aa  258  6e-68  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0599  hypothetical protein  58.79 
 
 		 205 aa  242  3e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1233  hypothetical protein  58.79 
 
 		 205 aa  242  3e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.548904 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1122  hypothetical protein  30.73 
 
 		 191 aa  94.4  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2109  hypothetical protein  33.16 
 
 		 199 aa  75.9  0.0000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2211  hypothetical protein  25.43 
 
 		 202 aa  57.8  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.631963  normal  0.769285 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0556  hypothetical protein  23.12 
 
 		 196 aa  57  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1681  hypothetical protein  22.54 
 
 		 196 aa  55.1  0.0000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000644612 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1610  hypothetical protein  21.97 
 
 		 203 aa  50.1  0.00003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.591771  normal  0.0598234 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1297  hypothetical protein  21.89 
 
 		 179 aa  47  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.202094  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1893  hypothetical protein  23.08 
 
 		 192 aa  45.1  0.0009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0786568  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2495  hypothetical protein  24.28 
 
 		 188 aa  43.9  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2290  hypothetical protein  26.9 
 
 		 191 aa  43.5  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1910  hypothetical protein  36.76 
 
 		 193 aa  42.4  0.005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.100044  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>