22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_1297 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_1297  hypothetical protein  100 
 
 
179 aa  360  8e-99  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.202094  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2290  hypothetical protein  40 
 
 
191 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1893  hypothetical protein  36.02 
 
 
192 aa  131  3.9999999999999996e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0786568  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2495  hypothetical protein  34.25 
 
 
188 aa  128  4.0000000000000003e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0291  hypothetical protein  34.05 
 
 
194 aa  126  2.0000000000000002e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5023  putative cytoplasmic protein  32.45 
 
 
193 aa  124  9e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.490812  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0337  hypothetical protein  34.62 
 
 
200 aa  115  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.000413901  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1610  hypothetical protein  37.5 
 
 
203 aa  112  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.591771  normal  0.0598234 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0556  hypothetical protein  32.46 
 
 
196 aa  106  1e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3735  hypothetical protein  32.98 
 
 
200 aa  102  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1681  hypothetical protein  34.54 
 
 
196 aa  100  1e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000644612 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2211  hypothetical protein  30.73 
 
 
202 aa  94.7  7e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.631963  normal  0.769285 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02970  protein of unknown function (DUF1788)  26.63 
 
 
200 aa  65.9  0.0000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4843  hypothetical protein  28.65 
 
 
202 aa  62  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0250264  normal  0.110684 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1122  hypothetical protein  26.88 
 
 
191 aa  56.6  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2109  hypothetical protein  25.64 
 
 
199 aa  51.6  0.000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1910  hypothetical protein  28.24 
 
 
193 aa  50.4  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.100044  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3082  hypothetical protein  23.39 
 
 
211 aa  50.1  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1154  hypothetical protein  21.89 
 
 
211 aa  47  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3195  hypothetical protein  35.38 
 
 
196 aa  43.9  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0599  hypothetical protein  23.53 
 
 
205 aa  43.1  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1233  hypothetical protein  23.53 
 
 
205 aa  43.1  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.548904 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>