18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4843 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_4843  hypothetical protein  100 
 
 		 202 aa  405  1.0000000000000001e-112  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0250264  normal  0.110684 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2495  hypothetical protein  25.81 
 
 		 188 aa  64.7  0.0000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2290  hypothetical protein  27.81 
 
 		 191 aa  63.9  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1297  hypothetical protein  28.65 
 
 		 179 aa  62  0.000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.202094  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5023  putative cytoplasmic protein  27.05 
 
 		 193 aa  55.1  0.0000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.490812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1893  hypothetical protein  24.57 
 
 		 192 aa  52.8  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0786568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1328  hypothetical protein  25.58 
 
 		 184 aa  52.8  0.000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3735  hypothetical protein  27.84 
 
 		 200 aa  52.8  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0291  hypothetical protein  26.26 
 
 		 194 aa  52.4  0.000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0556  hypothetical protein  25.28 
 
 		 196 aa  49.7  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3235  hypothetical protein  29.63 
 
 		 187 aa  49.3  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1610  hypothetical protein  25.7 
 
 		 203 aa  48.9  0.00005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.591771  normal  0.0598234 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0337  hypothetical protein  25.87 
 
 		 200 aa  47  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.000413901  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2211  hypothetical protein  25.14 
 
 		 202 aa  46.2  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.631963  normal  0.769285 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1817  hypothetical protein  25.29 
 
 		 180 aa  45.1  0.0007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0233956 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1707  hypothetical protein  25.44 
 
 		 180 aa  44.7  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0681131 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2243  hypothetical protein  33.78 
 
 		 186 aa  43.5  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.711218 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1681  hypothetical protein  25.69 
 
 		 196 aa  43.9  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000644612 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>