19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_1610 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007969  Pcryo_1610  hypothetical protein  100 
 
 
203 aa  418  1e-116  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.591771  normal  0.0598234 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1681  hypothetical protein  77.37 
 
 
196 aa  317  1e-85  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000644612 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0556  hypothetical protein  75 
 
 
196 aa  307  5.9999999999999995e-83  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2211  hypothetical protein  65.48 
 
 
202 aa  266  1e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.631963  normal  0.769285 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3735  hypothetical protein  60.1 
 
 
200 aa  254  4e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1297  hypothetical protein  37.5 
 
 
179 aa  112  3e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.202094  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2495  hypothetical protein  34.03 
 
 
188 aa  112  5e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1893  hypothetical protein  34.27 
 
 
192 aa  111  6e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0786568  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0291  hypothetical protein  31.66 
 
 
194 aa  111  6e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2290  hypothetical protein  33.16 
 
 
191 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5023  putative cytoplasmic protein  32.61 
 
 
193 aa  98.2  7e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.490812  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0337  hypothetical protein  29.44 
 
 
200 aa  88.6  6e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.000413901  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02970  protein of unknown function (DUF1788)  25.26 
 
 
200 aa  84.7  8e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1122  hypothetical protein  21.95 
 
 
191 aa  50.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1154  hypothetical protein  21.97 
 
 
211 aa  50.1  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4843  hypothetical protein  25.7 
 
 
202 aa  48.9  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0250264  normal  0.110684 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3082  hypothetical protein  23.16 
 
 
211 aa  46.6  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0599  hypothetical protein  21.71 
 
 
205 aa  44.7  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1233  hypothetical protein  21.71 
 
 
205 aa  44.7  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.548904 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>