19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_2211 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_2211  hypothetical protein  100 
 
 
202 aa  409  1e-113  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.631963  normal  0.769285 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0556  hypothetical protein  65.82 
 
 
196 aa  285  2.9999999999999996e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1681  hypothetical protein  66.49 
 
 
196 aa  279  2e-74  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000644612 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1610  hypothetical protein  65.48 
 
 
203 aa  266  1e-70  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.591771  normal  0.0598234 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3735  hypothetical protein  57.81 
 
 
200 aa  250  8.000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2495  hypothetical protein  34.9 
 
 
188 aa  127  8.000000000000001e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1893  hypothetical protein  37.95 
 
 
192 aa  122  3e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0786568  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2290  hypothetical protein  30.21 
 
 
191 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0291  hypothetical protein  32.18 
 
 
194 aa  107  2e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5023  putative cytoplasmic protein  33.5 
 
 
193 aa  99.8  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.490812  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0337  hypothetical protein  30.32 
 
 
200 aa  95.1  6e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.000413901  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02970  protein of unknown function (DUF1788)  29 
 
 
200 aa  95.1  7e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1297  hypothetical protein  30.73 
 
 
179 aa  94.7  9e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.202094  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1122  hypothetical protein  25.61 
 
 
191 aa  62  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1154  hypothetical protein  25.43 
 
 
211 aa  57.8  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3082  hypothetical protein  24.86 
 
 
211 aa  54.3  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0599  hypothetical protein  22.99 
 
 
205 aa  52.8  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1233  hypothetical protein  22.99 
 
 
205 aa  52.8  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.548904 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4843  hypothetical protein  25.14 
 
 
202 aa  46.2  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0250264  normal  0.110684 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>