20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_0556 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_0556  hypothetical protein  100 
 
 
196 aa  402  1e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1681  hypothetical protein  84.69 
 
 
196 aa  358  3e-98  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000644612 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1610  hypothetical protein  75 
 
 
203 aa  307  5.9999999999999995e-83  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.591771  normal  0.0598234 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2211  hypothetical protein  65.82 
 
 
202 aa  285  2e-76  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.631963  normal  0.769285 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3735  hypothetical protein  66.15 
 
 
200 aa  277  6e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0291  hypothetical protein  35.6 
 
 
194 aa  123  1e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2290  hypothetical protein  34.03 
 
 
191 aa  118  3.9999999999999996e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2495  hypothetical protein  33.33 
 
 
188 aa  116  1.9999999999999998e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1893  hypothetical protein  33.85 
 
 
192 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0786568  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1297  hypothetical protein  32.46 
 
 
179 aa  106  2e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.202094  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5023  putative cytoplasmic protein  33.33 
 
 
193 aa  103  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.490812  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02970  protein of unknown function (DUF1788)  28.96 
 
 
200 aa  96.7  2e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0337  hypothetical protein  29.1 
 
 
200 aa  93.2  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.000413901  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1122  hypothetical protein  25.61 
 
 
191 aa  58.9  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1154  hypothetical protein  23.12 
 
 
211 aa  57  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3082  hypothetical protein  25.42 
 
 
211 aa  52.4  0.000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4843  hypothetical protein  25.28 
 
 
202 aa  49.7  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0250264  normal  0.110684 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0599  hypothetical protein  22.41 
 
 
205 aa  45.1  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1233  hypothetical protein  22.41 
 
 
205 aa  45.1  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.548904 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2109  hypothetical protein  23.57 
 
 
199 aa  41.6  0.008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>