170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_0025 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007493  RSP_1367  nicotinate phosphoribosyltransferase  95.35 
 
 
430 aa  857    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0022  nicotinate phosphoribosyltransferase  82.33 
 
 
430 aa  741    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3432  nicotinate phosphoribosyltransferase  82.98 
 
 
429 aa  732    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.743424  normal  0.533019 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0852  nicotinate phosphoribosyltransferase  80.51 
 
 
435 aa  722    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.625001  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0035  nicotinate phosphoribosyltransferase  95.58 
 
 
430 aa  858    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0025  nicotinate phosphoribosyltransferase  100 
 
 
430 aa  887    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2365  nicotinate phosphoribosyltransferase  70.59 
 
 
430 aa  655    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.229166  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3345  nicotinate phosphoribosyltransferase  81.63 
 
 
430 aa  736    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1724  nicotinate phosphoribosyltransferase  68.14 
 
 
430 aa  621  1e-177  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0741751  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0414  nicotinate phosphoribosyltransferase  67.44 
 
 
430 aa  619  1e-176  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0198979 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4562  nicotinate phosphoribosyltransferase  68.06 
 
 
432 aa  611  1e-173  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.021535  normal  0.183994 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5022  nicotinate phosphoribosyltransferase  67.59 
 
 
432 aa  609  1e-173  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0626666 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5079  nicotinate phosphoribosyltransferase  67.59 
 
 
432 aa  597  1e-169  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.803975 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2142  nicotinate phosphoribosyltransferase  64.19 
 
 
430 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.440789 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0250  nicotinate phosphoribosyltransferase  60.79 
 
 
434 aa  558  1e-157  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.221329  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0112  nicotinate phosphoribosyltransferase  59.16 
 
 
434 aa  540  9.999999999999999e-153  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0125  nicotinate phosphoribosyltransferase  59.4 
 
 
434 aa  540  9.999999999999999e-153  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.937129  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0109  nicotinate phosphoribosyltransferase  58.7 
 
 
447 aa  535  1e-151  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0248268  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4138  nicotinate phosphoribosyltransferase  58 
 
 
434 aa  534  1e-150  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.775581  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4452  nicotinate phosphoribosyltransferase  58 
 
 
434 aa  534  1e-150  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.47988 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1739  nicotinate phosphoribosyltransferase  58.33 
 
 
434 aa  532  1e-150  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.208469  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0200  nicotinate phosphoribosyltransferase  57.54 
 
 
434 aa  527  1e-148  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1307  nicotinate phosphoribosyltransferase  56.9 
 
 
424 aa  517  1.0000000000000001e-145  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2592  nicotinate phosphoribosyltransferase  55.5 
 
 
438 aa  508  1e-143  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.061351  normal  0.969404 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3403  nicotinate phosphoribosyltransferase  58.1 
 
 
434 aa  508  1e-143  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0308  nicotinate phosphoribosyltransferase  57.64 
 
 
434 aa  510  1e-143  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.273883 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0980  nicotinate phosphoribosyltransferase  33.57 
 
 
399 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000687395  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0896  nicotinate phosphoribosyltransferase  33.74 
 
 
389 aa  214  2.9999999999999995e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.477693  normal  0.0227421 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0976  nicotinate phosphoribosyltransferase  33.49 
 
 
399 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000451173  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0621  nicotinate phosphoribosyltransferase  33.57 
 
 
399 aa  212  1e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000681686  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1100  nicotinate phosphoribosyltransferase  33.57 
 
 
399 aa  212  1e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000027143  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0961  nicotinate phosphoribosyltransferase  33.5 
 
 
389 aa  211  2e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0623252 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1059  nicotinate phosphoribosyltransferase  33.57 
 
 
399 aa  211  2e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000644735  normal  0.317841 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4213  nicotinate phosphoribosyltransferase  33.57 
 
 
399 aa  210  3e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000018976  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1031  nicotinate phosphoribosyltransferase  33.17 
 
 
404 aa  210  4e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.120152  normal  0.855005 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0442  nicotinate phosphoribosyltransferase  35 
 
 
394 aa  209  5e-53  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2932  nicotinate phosphoribosyltransferase  33.25 
 
 
398 aa  208  1e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000292258  normal  0.907447 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0385  nicotinate phosphoribosyltransferase  35 
 
 
394 aa  208  1e-52  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1052  nicotinate phosphoribosyltransferase  33.25 
 
 
412 aa  208  2e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000386017  normal  0.414868 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1697  nicotinate phosphoribosyltransferase  33.01 
 
 
399 aa  207  4e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000000128882  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0510  nicotinate phosphoribosyltransferase  33.49 
 
 
399 aa  206  5e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0109492  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2501  nicotinate phosphoribosyltransferase  33.49 
 
 
399 aa  206  5e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000365732  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2781  nicotinate phosphoribosyltransferase  33.49 
 
 
399 aa  206  5e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116025  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2812  nicotinate phosphoribosyltransferase  33.49 
 
 
399 aa  206  5e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000325875  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2873  nicotinate phosphoribosyltransferase  33.49 
 
 
399 aa  206  5e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0365801  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1824  nicotinate phosphoribosyltransferase  33.49 
 
 
399 aa  206  5e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00156311  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0808  nicotinate phosphoribosyltransferase  33.17 
 
 
399 aa  206  7e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000395003  normal  0.217385 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2931  nicotinate phosphoribosyltransferase  33.25 
 
 
424 aa  206  8e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000120174  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2203  nicotinate phosphoribosyltransferase  32.77 
 
 
399 aa  206  8e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000037467  normal  0.397068 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2284  nicotinate phosphoribosyltransferase  33.67 
 
 
392 aa  203  6e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0887476  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2449  nicotinate phosphoribosyltransferase  34.34 
 
 
399 aa  203  6e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000692172  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0559  nicotinate phosphoribosyltransferase  32.91 
 
 
393 aa  202  9e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.618565  normal  0.0393004 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0338  nicotinate phosphoribosyltransferase  32.61 
 
 
390 aa  202  9.999999999999999e-51  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1411  nicotinate phosphoribosyltransferase  34.29 
 
 
399 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.997998 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2095  nicotinate phosphoribosyltransferase  34.31 
 
 
389 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0425605 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1450  nicotinate phosphoribosyltransferase  34.6 
 
 
400 aa  198  2.0000000000000003e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1639  nicotinate phosphoribosyltransferase  34.66 
 
 
401 aa  197  3e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0109745  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56900  nicotinate phosphoribosyltransferase  34.22 
 
 
398 aa  196  7e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3719  nicotinate phosphoribosyltransferase  34.61 
 
 
397 aa  195  1e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00517667  normal  0.0126108 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1041  nicotinate phosphoribosyltransferase  34.75 
 
 
400 aa  194  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000300411 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4945  nicotinate phosphoribosyltransferase  33.98 
 
 
398 aa  194  3e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1118  nicotinate phosphoribosyltransferase  34.75 
 
 
400 aa  193  4e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0150287  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2245  nicotinate phosphoribosyltransferase  33.17 
 
 
399 aa  193  5e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1106  nicotinate phosphoribosyltransferase  34.75 
 
 
400 aa  193  6e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.634691 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1730  nicotinate phosphoribosyltransferase  35.59 
 
 
406 aa  192  7e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.404013  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1073  nicotinate phosphoribosyltransferase  34.75 
 
 
400 aa  192  8e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000104663 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1732  nicotinate phosphoribosyltransferase  34.26 
 
 
401 aa  192  8e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00128231  normal  0.731039 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00935  nicotinate phosphoribosyltransferase  34.17 
 
 
400 aa  192  1e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00018823  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2712  nicotinate phosphoribosyltransferase  34.17 
 
 
400 aa  192  1e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000536664  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00942  hypothetical protein  34.17 
 
 
400 aa  192  1e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000138975  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0941  nicotinate phosphoribosyltransferase  33.49 
 
 
390 aa  192  1e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2189  nicotinate phosphoribosyltransferase  34.17 
 
 
400 aa  192  1e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.084522  normal  0.514532 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2665  nicotinate phosphoribosyltransferase  34.17 
 
 
416 aa  192  1e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000296295  normal  0.0229075 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1014  nicotinate phosphoribosyltransferase  34.5 
 
 
400 aa  192  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000000238457  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1039  nicotinate phosphoribosyltransferase  34.17 
 
 
400 aa  192  1e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00414982  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1031  nicotinate phosphoribosyltransferase  34.17 
 
 
400 aa  192  1e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00456308  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2387  nicotinate phosphoribosyltransferase  33.92 
 
 
400 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0828745  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5606  nicotinate phosphoribosyltransferase  33.97 
 
 
399 aa  191  2.9999999999999997e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.643272 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0581  nicotinate phosphoribosyltransferase  32.47 
 
 
407 aa  190  4e-47  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.190832  normal  0.770292 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0167  nicotinate phosphoribosyltransferase  32.93 
 
 
406 aa  190  5e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1293  nicotinate phosphoribosyltransferase  33.49 
 
 
413 aa  189  7e-47  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1944  nicotinate phosphoribosyltransferase  32.2 
 
 
399 aa  189  9e-47  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1092  nicotinate phosphoribosyltransferase  33.92 
 
 
400 aa  189  1e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000112466  normal  0.614516 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1089  nicotinate phosphoribosyltransferase  32.57 
 
 
416 aa  188  1e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.472913 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0595  nicotinate phosphoribosyltransferase  33.49 
 
 
407 aa  187  3e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.12402 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64960  nicotinate phosphoribosyltransferase  33.01 
 
 
399 aa  187  3e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.500667  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5645  nicotinate phosphoribosyltransferase  33.01 
 
 
399 aa  187  3e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.574753  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0976  nicotinate phosphoribosyltransferase  33.82 
 
 
398 aa  186  5e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.147591  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2647  nicotinate phosphoribosyltransferase  33.42 
 
 
406 aa  185  1.0000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0524303  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2557  nicotinate phosphoribosyltransferase  33.42 
 
 
401 aa  185  1.0000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000810876  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06575  nicotinate phosphoribosyltransferase  32.83 
 
 
436 aa  185  1.0000000000000001e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0548  nicotinate phosphoribosyltransferase  33.25 
 
 
407 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.220672  normal  0.267523 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4740  nicotinate phosphoribosyltransferase  31.93 
 
 
406 aa  184  3e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.35755  normal  0.607195 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6283  nicotinate phosphoribosyltransferase  33.58 
 
 
395 aa  184  3e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000174127  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1981  nicotinate phosphoribosyltransferase  33.17 
 
 
416 aa  184  4.0000000000000006e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000489265  normal  0.809116 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4921  nicotinate phosphoribosyltransferase  33.01 
 
 
407 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2067  nicotinate phosphoribosyltransferase  31.46 
 
 
406 aa  183  5.0000000000000004e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.398487  hitchhiker  0.00430299 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1786  nicotinate phosphoribosyltransferase  32.66 
 
 
401 aa  183  6e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00758127  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3080  nicotinate phosphoribosyltransferase  31.65 
 
 
395 aa  181  2e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.257894  normal  0.114116 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2472  nicotinate phosphoribosyltransferase  30.66 
 
 
391 aa  181  2e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>