154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_2592 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007778  RPB_2592  nicotinate phosphoribosyltransferase  100 
 
 
438 aa  905    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.061351  normal  0.969404 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0125  nicotinate phosphoribosyltransferase  66.21 
 
 
434 aa  616  1e-175  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.937129  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0112  nicotinate phosphoribosyltransferase  65.75 
 
 
434 aa  613  9.999999999999999e-175  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0109  nicotinate phosphoribosyltransferase  65.53 
 
 
447 aa  610  1e-173  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0248268  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4138  nicotinate phosphoribosyltransferase  64.84 
 
 
434 aa  602  1.0000000000000001e-171  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.775581  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1739  nicotinate phosphoribosyltransferase  64.16 
 
 
434 aa  598  1e-170  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.208469  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4452  nicotinate phosphoribosyltransferase  64.61 
 
 
434 aa  600  1e-170  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.47988 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0250  nicotinate phosphoribosyltransferase  64.16 
 
 
434 aa  595  1e-169  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.221329  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0200  nicotinate phosphoribosyltransferase  63.7 
 
 
434 aa  589  1e-167  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0308  nicotinate phosphoribosyltransferase  65.81 
 
 
434 aa  584  1e-166  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.273883 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3403  nicotinate phosphoribosyltransferase  65.53 
 
 
434 aa  579  1e-164  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5022  nicotinate phosphoribosyltransferase  62.07 
 
 
432 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0626666 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1307  nicotinate phosphoribosyltransferase  62.06 
 
 
424 aa  574  1.0000000000000001e-162  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4562  nicotinate phosphoribosyltransferase  61.84 
 
 
432 aa  571  1e-161  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.021535  normal  0.183994 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5079  nicotinate phosphoribosyltransferase  62.59 
 
 
432 aa  545  1e-154  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.803975 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2365  nicotinate phosphoribosyltransferase  59.08 
 
 
430 aa  540  9.999999999999999e-153  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.229166  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0414  nicotinate phosphoribosyltransferase  59.95 
 
 
430 aa  526  1e-148  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0198979 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1724  nicotinate phosphoribosyltransferase  59.91 
 
 
430 aa  523  1e-147  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0741751  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2142  nicotinate phosphoribosyltransferase  61.79 
 
 
430 aa  514  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.440789 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0025  nicotinate phosphoribosyltransferase  55.5 
 
 
430 aa  508  1e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1367  nicotinate phosphoribosyltransferase  55.5 
 
 
430 aa  505  9.999999999999999e-143  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0035  nicotinate phosphoribosyltransferase  55.73 
 
 
430 aa  507  9.999999999999999e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0852  nicotinate phosphoribosyltransferase  56.88 
 
 
435 aa  497  1e-139  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.625001  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3345  nicotinate phosphoribosyltransferase  55.05 
 
 
430 aa  488  1e-137  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0022  nicotinate phosphoribosyltransferase  56.81 
 
 
430 aa  487  1e-136  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3432  nicotinate phosphoribosyltransferase  54.84 
 
 
429 aa  478  1e-133  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.743424  normal  0.533019 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0808  nicotinate phosphoribosyltransferase  31.06 
 
 
399 aa  205  1e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000395003  normal  0.217385 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0442  nicotinate phosphoribosyltransferase  32.3 
 
 
394 aa  204  2e-51  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2781  nicotinate phosphoribosyltransferase  31.81 
 
 
399 aa  204  3e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116025  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1824  nicotinate phosphoribosyltransferase  31.81 
 
 
399 aa  204  3e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00156311  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0385  nicotinate phosphoribosyltransferase  32.46 
 
 
394 aa  203  5e-51  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1052  nicotinate phosphoribosyltransferase  31.41 
 
 
412 aa  202  7e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000386017  normal  0.414868 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0510  nicotinate phosphoribosyltransferase  31.57 
 
 
399 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0109492  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2931  nicotinate phosphoribosyltransferase  31.57 
 
 
424 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000120174  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2932  nicotinate phosphoribosyltransferase  31.08 
 
 
398 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000292258  normal  0.907447 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2501  nicotinate phosphoribosyltransferase  31.57 
 
 
399 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000365732  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2812  nicotinate phosphoribosyltransferase  31.57 
 
 
399 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000325875  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2873  nicotinate phosphoribosyltransferase  31.57 
 
 
399 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0365801  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1697  nicotinate phosphoribosyltransferase  31.81 
 
 
399 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000000128882  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0559  nicotinate phosphoribosyltransferase  31.81 
 
 
393 aa  201  1.9999999999999998e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.618565  normal  0.0393004 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2449  nicotinate phosphoribosyltransferase  32.62 
 
 
399 aa  200  3.9999999999999996e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000692172  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2203  nicotinate phosphoribosyltransferase  31.81 
 
 
399 aa  199  7e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000037467  normal  0.397068 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4213  nicotinate phosphoribosyltransferase  31.57 
 
 
399 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000018976  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0896  nicotinate phosphoribosyltransferase  31.74 
 
 
389 aa  197  3e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.477693  normal  0.0227421 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0980  nicotinate phosphoribosyltransferase  31.12 
 
 
399 aa  195  1e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000687395  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0976  nicotinate phosphoribosyltransferase  31.12 
 
 
399 aa  195  1e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000451173  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1031  nicotinate phosphoribosyltransferase  30.4 
 
 
404 aa  194  3e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.120152  normal  0.855005 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0621  nicotinate phosphoribosyltransferase  31.12 
 
 
399 aa  194  3e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000681686  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1100  nicotinate phosphoribosyltransferase  31.12 
 
 
399 aa  194  3e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000027143  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1059  nicotinate phosphoribosyltransferase  31.33 
 
 
399 aa  193  7e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000644735  normal  0.317841 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0961  nicotinate phosphoribosyltransferase  31.26 
 
 
389 aa  192  8e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0623252 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1450  nicotinate phosphoribosyltransferase  33.25 
 
 
400 aa  192  1e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1106  nicotinate phosphoribosyltransferase  33.25 
 
 
400 aa  191  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.634691 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1118  nicotinate phosphoribosyltransferase  33.25 
 
 
400 aa  191  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0150287  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1041  nicotinate phosphoribosyltransferase  33.25 
 
 
400 aa  191  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000300411 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1073  nicotinate phosphoribosyltransferase  33.25 
 
 
400 aa  191  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000104663 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1014  nicotinate phosphoribosyltransferase  33.25 
 
 
400 aa  190  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000000238457  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0548  nicotinate phosphoribosyltransferase  32.37 
 
 
407 aa  189  7e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.220672  normal  0.267523 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5606  nicotinate phosphoribosyltransferase  32.46 
 
 
399 aa  187  3e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.643272 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3306  nicotinate phosphoribosyltransferase  30.9 
 
 
402 aa  187  4e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0926787  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1411  nicotinate phosphoribosyltransferase  31.23 
 
 
399 aa  187  4e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.997998 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0595  nicotinate phosphoribosyltransferase  32.52 
 
 
407 aa  186  6e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.12402 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4921  nicotinate phosphoribosyltransferase  32.52 
 
 
407 aa  186  8e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4740  nicotinate phosphoribosyltransferase  30.82 
 
 
406 aa  186  9e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.35755  normal  0.607195 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0167  nicotinate phosphoribosyltransferase  33.5 
 
 
406 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1730  nicotinate phosphoribosyltransferase  32.77 
 
 
406 aa  186  1.0000000000000001e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.404013  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0581  nicotinate phosphoribosyltransferase  32.17 
 
 
407 aa  185  1.0000000000000001e-45  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.190832  normal  0.770292 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1639  nicotinate phosphoribosyltransferase  32.11 
 
 
401 aa  185  1.0000000000000001e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0109745  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1944  nicotinate phosphoribosyltransferase  31.59 
 
 
399 aa  185  2.0000000000000003e-45  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64960  nicotinate phosphoribosyltransferase  31.23 
 
 
399 aa  184  3e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.500667  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5645  nicotinate phosphoribosyltransferase  30.95 
 
 
399 aa  184  3e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.574753  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1732  nicotinate phosphoribosyltransferase  32.18 
 
 
401 aa  184  3e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00128231  normal  0.731039 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2387  nicotinate phosphoribosyltransferase  32.13 
 
 
400 aa  184  4.0000000000000006e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0828745  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06575  nicotinate phosphoribosyltransferase  31.14 
 
 
436 aa  183  5.0000000000000004e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6283  nicotinate phosphoribosyltransferase  32.23 
 
 
395 aa  182  9.000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000174127  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2665  nicotinate phosphoribosyltransferase  31.88 
 
 
416 aa  182  9.000000000000001e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000296295  normal  0.0229075 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00935  nicotinate phosphoribosyltransferase  31.88 
 
 
400 aa  182  1e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00018823  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2712  nicotinate phosphoribosyltransferase  32.21 
 
 
400 aa  182  1e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000536664  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1293  nicotinate phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 
413 aa  182  1e-44  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2284  nicotinate phosphoribosyltransferase  30.71 
 
 
392 aa  182  1e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0887476  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1039  nicotinate phosphoribosyltransferase  31.88 
 
 
400 aa  182  1e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00414982  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1031  nicotinate phosphoribosyltransferase  31.88 
 
 
400 aa  182  1e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00456308  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00942  hypothetical protein  31.88 
 
 
400 aa  182  1e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000138975  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2189  nicotinate phosphoribosyltransferase  32.21 
 
 
400 aa  182  1e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.084522  normal  0.514532 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3080  nicotinate phosphoribosyltransferase  30.24 
 
 
395 aa  181  2e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.257894  normal  0.114116 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56900  nicotinate phosphoribosyltransferase  31.8 
 
 
398 aa  181  2e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4945  nicotinate phosphoribosyltransferase  31.55 
 
 
398 aa  181  2e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1089  nicotinate phosphoribosyltransferase  32.12 
 
 
416 aa  180  4e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.472913 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1092  nicotinate phosphoribosyltransferase  31.97 
 
 
400 aa  179  1e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000112466  normal  0.614516 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1620  nicotinate phosphoribosyltransferase  30.71 
 
 
399 aa  179  1e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1786  nicotinate phosphoribosyltransferase  31.86 
 
 
401 aa  177  2e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00758127  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2095  nicotinate phosphoribosyltransferase  32.5 
 
 
389 aa  177  2e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0425605 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2058  nicotinate phosphoribosyltransferase  31.86 
 
 
401 aa  177  3e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.52163  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0041  nicotinate phosphoribosyltransferase  31.86 
 
 
435 aa  176  5e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0976  nicotinate phosphoribosyltransferase  32.22 
 
 
398 aa  175  9.999999999999999e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.147591  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0321  nicotinate phosphoribosyltransferase  32.63 
 
 
405 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2245  nicotinate phosphoribosyltransferase  30.19 
 
 
399 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1368  nicotinate phosphoribosyltransferase  29.52 
 
 
398 aa  174  2.9999999999999996e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00031505  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2492  nicotinate phosphoribosyltransferase  29.52 
 
 
398 aa  174  2.9999999999999996e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.398443  normal  0.0193027 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2067  nicotinate phosphoribosyltransferase  29.58 
 
 
406 aa  174  2.9999999999999996e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.398487  hitchhiker  0.00430299 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>