More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0945 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007643  Rru_A0945  cell division protein FtsA  100 
 
 
440 aa  887    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.000880063  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2426  cell division protein FtsA  52.76 
 
 
436 aa  443  1e-123  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000116428  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0068  cell division protein FtsA  49.17 
 
 
437 aa  379  1e-104  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2072  cell division protein FtsA  45.26 
 
 
443 aa  373  1e-102  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.327697 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1749  cell division protein FtsA  46.79 
 
 
440 aa  353  4e-96  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2075  cell division protein FtsA  42.96 
 
 
442 aa  352  8.999999999999999e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00118301 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1383  cell division protein FtsA  46.32 
 
 
440 aa  349  7e-95  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1426  cell division protein FtsA  46.32 
 
 
440 aa  348  9e-95  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.365599  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3175  cell division protein FtsA  42.69 
 
 
440 aa  346  5e-94  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0332764  normal  0.87705 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2351  cell division protein FtsA  42.69 
 
 
440 aa  345  1e-93  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.442272  normal  0.661359 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3132  cell division protein FtsA  42.69 
 
 
440 aa  344  2e-93  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.48829  normal  0.202735 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2884  cell division protein  41.27 
 
 
441 aa  344  2e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0459922  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2948  cell division protein FtsA  43.2 
 
 
419 aa  343  5e-93  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.576909  normal  0.0698479 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7437  cell division protein FtsA  42.46 
 
 
441 aa  342  7e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.05738  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3165  cell division protein FtsA  48.68 
 
 
464 aa  340  2.9999999999999998e-92  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2846  cell division protein FtsA  40.14 
 
 
443 aa  339  7e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.67917  hitchhiker  0.00813822 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2002  cell division protein FtsA  44.6 
 
 
437 aa  339  7e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0360528  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2587  cell division protein FtsA  39.68 
 
 
443 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6698  cell division protein FtsA  42.23 
 
 
441 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.535042  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3494  cell division protein FtsA  40.84 
 
 
438 aa  333  3e-90  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.815355 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0697  cell division protein FtsA  41.3 
 
 
438 aa  325  9e-88  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.505091  normal  0.501331 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0688  cell division protein FtsA  38.7 
 
 
450 aa  314  1.9999999999999998e-84  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0260143  decreased coverage  0.000277221 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0942  cell division protein FtsA  41.33 
 
 
432 aa  310  4e-83  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000255015  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2417  cell division protein  38.38 
 
 
445 aa  301  2e-80  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000659549  normal  0.582955 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0327  cell division protein FtsA  39.35 
 
 
441 aa  298  1e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.740051  normal  0.521585 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3299  cell division protein FtsA  38.99 
 
 
440 aa  294  2e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1285  cell division protein FtsA  38.62 
 
 
440 aa  294  2e-78  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2113  cell division protein FtsA  37.53 
 
 
444 aa  293  5e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0789  cell division protein FtsA  37.53 
 
 
444 aa  293  5e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.150702  normal  0.197586 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1057  cell division protein FtsA  38.23 
 
 
440 aa  292  6e-78  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.209259  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0699  cell division protein FtsA  37.36 
 
 
444 aa  292  1e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.181959  normal  0.281367 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6167  cell division protein ATPase  38.99 
 
 
439 aa  291  2e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0801863 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3387  cell division protein FtsA  37.67 
 
 
427 aa  290  4e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0127671 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3658  cell division protein FtsA  40.57 
 
 
441 aa  288  1e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.219923 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2003  cell division protein FtsA  37.27 
 
 
441 aa  288  1e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.302134  normal  0.480609 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0748  cell division protein FtsA  38.24 
 
 
412 aa  283  6.000000000000001e-75  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000107961  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2751  cell division protein FtsA  35.71 
 
 
444 aa  281  1e-74  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.411174  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4041  cell division protein FtsA  37.67 
 
 
440 aa  280  4e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4488  cell division protein FtsA  37.14 
 
 
444 aa  274  2.0000000000000002e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00787322  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0948  cell division protein FtsA  36.78 
 
 
418 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.249697  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2264  cell division protein FtsA  35.97 
 
 
412 aa  272  9e-72  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0392802  hitchhiker  0.00222131 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3777  cell division protein FtsA  36.17 
 
 
410 aa  271  1e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.11031  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2186  cell division protein FtsA  36.93 
 
 
423 aa  271  2e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0110179  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4404  cell division protein FtsA  35.89 
 
 
418 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0640092  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4098  cell division protein FtsA  35.89 
 
 
418 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.14475  normal  0.627944 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3833  cell division protein FtsA  35.92 
 
 
410 aa  270  4e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3917  cell division protein FtsA  35.92 
 
 
410 aa  270  4e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0852  cell division protein FtsA  35.77 
 
 
409 aa  270  4e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000127132  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13290  cell division protein FtsA  35.75 
 
 
415 aa  270  5e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00675344  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1967  cell division protein  36.84 
 
 
413 aa  270  5e-71  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.000000443484  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2424  cell division protein FtsA  36.78 
 
 
411 aa  269  7e-71  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0673361  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4980  cell division protein FtsA  36.45 
 
 
417 aa  269  7e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.248977  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0926  cell division protein FtsA  35.66 
 
 
415 aa  269  7e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0559098  normal  0.998938 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57290  cell division protein FtsA  36.45 
 
 
417 aa  269  7e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4669  cell division protein FtsA  35.17 
 
 
419 aa  269  8.999999999999999e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000165844  normal  0.464968 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2086  cell division protein FtsA  36.39 
 
 
412 aa  269  8.999999999999999e-71  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0360839  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3941  cell division protein FtsA  36.89 
 
 
419 aa  267  2e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0124  cell division protein FtsA  35.84 
 
 
411 aa  268  2e-70  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0427264  normal  0.0337696 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0229  cell division protein FtsA  36.63 
 
 
410 aa  268  2e-70  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  5.72026e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0416  cell division protein FtsA  36.78 
 
 
411 aa  267  4e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.840628  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1341  cell division protein FtsA  36.12 
 
 
443 aa  266  8e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.722513  normal  0.0156243 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4508  cell division protein FtsA  36.12 
 
 
420 aa  266  8e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00626998  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09120  cell division protein FtsA  34.83 
 
 
421 aa  266  8e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000811489  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4383  cell division protein FtsA  36.12 
 
 
420 aa  266  8e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000385058  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3284  cell division protein FtsA  36.96 
 
 
412 aa  265  1e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000382408  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0587  cell division protein FtsA  34.69 
 
 
417 aa  264  2e-69  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000283199  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3064  cell division protein FtsA  36.41 
 
 
411 aa  263  3e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3969  cell division protein FtsA  36.17 
 
 
411 aa  263  3e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000373054  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0665  cell division protein FtsA  36.47 
 
 
411 aa  263  4.999999999999999e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000156077  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0513  cell division protein FtsA  36.17 
 
 
411 aa  261  2e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1117  cell division protein FtsA  36.61 
 
 
411 aa  259  5.0000000000000005e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.0000192043  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0496  cell division protein FtsA  35.82 
 
 
411 aa  259  6e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00048929  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1876  cell division protein FtsA  35.95 
 
 
418 aa  259  6e-68  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.236246 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0774  cell division protein FtsA  36.39 
 
 
412 aa  258  1e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.125422  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2448  cell division protein FtsA  35.29 
 
 
411 aa  258  1e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00757496  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0876  cell division protein FtsA  36.27 
 
 
411 aa  258  2e-67  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2197  cell division protein FtsA  35.84 
 
 
409 aa  258  2e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.0721100000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2188  cell division protein FtsA  35.51 
 
 
412 aa  258  2e-67  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.083381  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3893  cell division protein FtsA  37.32 
 
 
409 aa  257  4e-67  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.948827  normal  0.179605 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5215  cell division protein FtsA  38.26 
 
 
411 aa  256  4e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.344287  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0380  cell division protein FtsA  35.14 
 
 
422 aa  256  5e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00706299  normal  0.0389324 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0201  cell division protein FtsA  35.14 
 
 
422 aa  256  5e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.449643  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2669  cell division protein FtsA  35.19 
 
 
410 aa  255  8e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00924647  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3466  cell division protein FtsA  34.95 
 
 
410 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000117297  hitchhiker  0.00107909 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0490  cell division protein FtsA  34.95 
 
 
410 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00369012  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2783  cell division protein FtsA  35.94 
 
 
407 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000760847  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3494  cell division protein FtsA  34.62 
 
 
409 aa  254  2.0000000000000002e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0808464  normal  0.335158 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3423  cell division protein FtsA  36.3 
 
 
409 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.189914  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0171  cell division protein FtsA  35.44 
 
 
409 aa  254  3e-66  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000130276  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0750  cell division protein FtsA  35.28 
 
 
410 aa  253  5.000000000000001e-66  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3546  cell division protein FtsA  34.96 
 
 
410 aa  252  8.000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3237  cell division protein FtsA  34.96 
 
 
410 aa  252  8.000000000000001e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2547  cell division protein FtsA  34.96 
 
 
410 aa  252  8.000000000000001e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3540  cell division protein FtsA  34.96 
 
 
410 aa  252  8.000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1122  cell division protein FtsA  34.96 
 
 
410 aa  252  8.000000000000001e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3521  cell division protein FtsA  34.96 
 
 
410 aa  252  8.000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1326  cell division protein FtsA  34.96 
 
 
410 aa  252  8.000000000000001e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.792019  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0467  cell division protein FtsA  34.96 
 
 
410 aa  252  8.000000000000001e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.79149  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0492  cell division protein FtsA  34.96 
 
 
410 aa  252  9.000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000474873  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0467  cell division protein FtsA  34.96 
 
 
410 aa  252  9.000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0035462  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>