More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_1285 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011004  Rpal_4041  cell division protein FtsA  82.54 
 
 
440 aa  743    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1057  cell division protein FtsA  93.64 
 
 
440 aa  835    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.209259  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2003  cell division protein FtsA  83.9 
 
 
441 aa  764    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.302134  normal  0.480609 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3299  cell division protein FtsA  84.32 
 
 
440 aa  762    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3387  cell division protein FtsA  83.84 
 
 
427 aa  739    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0127671 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1285  cell division protein FtsA  100 
 
 
440 aa  886    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6167  cell division protein ATPase  84.09 
 
 
439 aa  751    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0801863 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3175  cell division protein FtsA  53.12 
 
 
440 aa  458  9.999999999999999e-129  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0332764  normal  0.87705 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3132  cell division protein FtsA  52.89 
 
 
440 aa  456  1e-127  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.48829  normal  0.202735 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2351  cell division protein FtsA  52.89 
 
 
440 aa  457  1e-127  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.442272  normal  0.661359 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7437  cell division protein FtsA  50.57 
 
 
441 aa  445  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.05738  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2948  cell division protein FtsA  53.85 
 
 
419 aa  444  1e-123  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.576909  normal  0.0698479 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6698  cell division protein FtsA  51.02 
 
 
441 aa  444  1e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.535042  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3494  cell division protein FtsA  49.07 
 
 
438 aa  425  1e-118  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.815355 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0697  cell division protein FtsA  50.35 
 
 
438 aa  422  1e-117  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.505091  normal  0.501331 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0327  cell division protein FtsA  49.88 
 
 
441 aa  412  1e-114  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.740051  normal  0.521585 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2075  cell division protein FtsA  46.87 
 
 
442 aa  403  1e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00118301 
 
 
-
 
NC_004310  BR1426  cell division protein FtsA  49.05 
 
 
440 aa  394  1e-108  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.365599  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1383  cell division protein FtsA  49.05 
 
 
440 aa  394  1e-108  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2587  cell division protein FtsA  45.14 
 
 
443 aa  393  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1749  cell division protein FtsA  48.81 
 
 
440 aa  392  1e-108  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2884  cell division protein  45 
 
 
441 aa  394  1e-108  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0459922  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2846  cell division protein FtsA  44.68 
 
 
443 aa  390  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.67917  hitchhiker  0.00813822 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2002  cell division protein FtsA  48.36 
 
 
437 aa  381  1e-104  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0360528  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0942  cell division protein FtsA  44.44 
 
 
432 aa  367  1e-100  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000255015  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2426  cell division protein FtsA  40.73 
 
 
436 aa  327  2.0000000000000001e-88  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000116428  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0945  cell division protein FtsA  38.62 
 
 
440 aa  294  2e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.000880063  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0068  cell division protein FtsA  40.6 
 
 
437 aa  285  1.0000000000000001e-75  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3658  cell division protein FtsA  38.11 
 
 
441 aa  268  2e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.219923 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2417  cell division protein  36.43 
 
 
445 aa  268  2e-70  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000659549  normal  0.582955 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0688  cell division protein FtsA  36.97 
 
 
450 aa  266  7e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0260143  decreased coverage  0.000277221 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0699  cell division protein FtsA  37.67 
 
 
444 aa  262  8.999999999999999e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.181959  normal  0.281367 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2072  cell division protein FtsA  38.32 
 
 
443 aa  262  1e-68  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.327697 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0789  cell division protein FtsA  36.98 
 
 
444 aa  256  7e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.150702  normal  0.197586 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3165  cell division protein FtsA  37.22 
 
 
464 aa  256  7e-67  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2113  cell division protein FtsA  36.98 
 
 
444 aa  256  7e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2751  cell division protein FtsA  35.19 
 
 
444 aa  249  5e-65  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.411174  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4488  cell division protein FtsA  35.65 
 
 
444 aa  244  1.9999999999999999e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00787322  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5215  cell division protein FtsA  34.31 
 
 
411 aa  224  3e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.344287  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0606  cell division protein FtsA  36.02 
 
 
411 aa  223  6e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.943795  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1876  cell division protein FtsA  32.38 
 
 
418 aa  222  9.999999999999999e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.236246 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04363  cell division protein FtsA  35.55 
 
 
411 aa  221  3e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.757855  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0201  cell division protein FtsA  32.03 
 
 
422 aa  219  6e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.449643  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0380  cell division protein FtsA  32.03 
 
 
422 aa  219  6e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00706299  normal  0.0389324 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2197  cell division protein FtsA  32.16 
 
 
409 aa  218  2e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.0721100000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3941  cell division protein FtsA  32.04 
 
 
419 aa  218  2e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0416  cell division protein FtsA  33.1 
 
 
411 aa  217  2.9999999999999998e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.840628  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0748  cell division protein FtsA  31.53 
 
 
412 aa  217  4e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000107961  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1965  cell division protein FtsA  34.91 
 
 
411 aa  215  9.999999999999999e-55  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.00000960191  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2044  cell division protein  34.91 
 
 
411 aa  216  9.999999999999999e-55  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000000655425  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3969  cell division protein FtsA  32.16 
 
 
411 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000373054  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3064  cell division protein FtsA  32.39 
 
 
411 aa  214  2.9999999999999995e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0513  cell division protein FtsA  32.16 
 
 
411 aa  214  2.9999999999999995e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0496  cell division protein FtsA  32.16 
 
 
411 aa  213  4.9999999999999996e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00048929  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3801  cell division protein FtsA  32.71 
 
 
411 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000784597  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2840  cell division protein FtsA  32.99 
 
 
410 aa  212  9e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0358  cell division protein FtsA  32.16 
 
 
411 aa  212  9e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000000107954  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1117  cell division protein FtsA  31.98 
 
 
411 aa  211  2e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.0000192043  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0492  cell division protein FtsA  33.42 
 
 
410 aa  210  3e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000474873  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3649  cell division protein FtsA  33.42 
 
 
410 aa  211  3e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00282858  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0081  cell division protein FtsA  33.42 
 
 
410 aa  211  3e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0000240923  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0467  cell division protein FtsA  33.42 
 
 
410 aa  210  3e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0035462  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0534  cell division protein FtsA  33.42 
 
 
410 aa  211  3e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000483364  normal  0.575152 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0563  cell division protein FtsA  33.42 
 
 
410 aa  211  3e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000205481  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3450  cell division protein FtsA  33.41 
 
 
411 aa  210  4e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000166188  hitchhiker  0.000034496 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4461  cell division protein FtsA  31.26 
 
 
411 aa  210  5e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.232873  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0490  cell division protein FtsA  33.68 
 
 
410 aa  210  5e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00369012  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3494  cell division protein FtsA  30.99 
 
 
409 aa  209  6e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0808464  normal  0.335158 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0587  cell division protein FtsA  30.84 
 
 
417 aa  209  6e-53  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000283199  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0413  cell division protein FtsA  32.7 
 
 
411 aa  209  6e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00909742  hitchhiker  0.00170264 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3466  cell division protein FtsA  33.68 
 
 
410 aa  209  7e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000117297  hitchhiker  0.00107909 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2832  cell division protein FtsA  33.16 
 
 
410 aa  209  8e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000848153  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2186  cell division protein FtsA  32.27 
 
 
423 aa  209  9e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0110179  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3237  cell division protein FtsA  31.38 
 
 
410 aa  208  1e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3546  cell division protein FtsA  31.38 
 
 
410 aa  208  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2547  cell division protein FtsA  31.38 
 
 
410 aa  208  1e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3540  cell division protein FtsA  31.38 
 
 
410 aa  208  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1326  cell division protein FtsA  31.38 
 
 
410 aa  208  1e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.792019  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1122  cell division protein FtsA  31.38 
 
 
410 aa  208  1e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2669  cell division protein FtsA  33.16 
 
 
410 aa  208  1e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00924647  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3521  cell division protein FtsA  31.38 
 
 
410 aa  208  1e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0467  cell division protein FtsA  31.38 
 
 
410 aa  208  1e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.79149  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4530  cell division protein FtsA  32.46 
 
 
411 aa  207  2e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000264478  hitchhiker  0.000036158 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2603  cell division protein FtsA  32.74 
 
 
409 aa  207  3e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0898076  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3515  cell division protein FtsA  31.98 
 
 
409 aa  207  3e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000329989  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0952  cell division protein FtsA  32.94 
 
 
408 aa  207  4e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.39676 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2720  cell division protein FtsA  32.47 
 
 
410 aa  207  4e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.705635  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3085  cell division protein FtsA  32.47 
 
 
410 aa  207  4e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0404  cell division protein FtsA  31.92 
 
 
411 aa  206  6e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000380167  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0416  cell division protein FtsA  31.92 
 
 
411 aa  206  6e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000530477  unclonable  0.0000068927 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0430  cell division protein FtsA  31.92 
 
 
411 aa  206  6e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000124694  hitchhiker  0.0000000000723635 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0405  cell division protein FtsA  31.92 
 
 
411 aa  206  6e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000457966  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3808  cell division protein FtsA  31.74 
 
 
411 aa  206  8e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000197633  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4216  cell division protein FtsA  32.94 
 
 
411 aa  205  1e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0849  cell division protein FtsA  32.55 
 
 
410 aa  205  1e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000717091  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3567  cell division protein FtsA  32.94 
 
 
411 aa  205  1e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000490068  decreased coverage  0.000000000512084 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0389  cell division protein FtsA  32.94 
 
 
411 aa  205  1e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000990996  hitchhiker  0.000418881 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0490  cell division protein FtsA  32.94 
 
 
411 aa  205  1e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000000456423  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3740  cell division protein FtsA  32.94 
 
 
411 aa  205  1e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000982016  hitchhiker  0.0000000353047 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1027  cell division protein FtsA  33.97 
 
 
424 aa  205  2e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000184559  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>