More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_2003 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_4041  cell division protein FtsA  91.16 
 
 		 440 aa  816    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6167  cell division protein ATPase  85.71 
 
 		 439 aa  768    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0801863 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1057  cell division protein FtsA  82.99 
 
 		 440 aa  756    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.209259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2003  cell division protein FtsA  100 
 
 		 441 aa  885    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.302134  normal  0.480609 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3299  cell division protein FtsA  85.26 
 
 		 440 aa  778    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3387  cell division protein FtsA  96.96 
 
 		 427 aa  832    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0127671 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1285  cell division protein FtsA  83.9 
 
 		 440 aa  764    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3175  cell division protein FtsA  49.88 
 
 		 440 aa  442  1e-123  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0332764  normal  0.87705 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2351  cell division protein FtsA  49.88 
 
 		 440 aa  438  9.999999999999999e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.442272  normal  0.661359 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6698  cell division protein FtsA  48.75 
 
 		 441 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.535042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3132  cell division protein FtsA  49.88 
 
 		 440 aa  440  9.999999999999999e-123  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.48829  normal  0.202735 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7437  cell division protein FtsA  48.53 
 
 		 441 aa  436  1e-121  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.05738  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2948  cell division protein FtsA  50.72 
 
 		 419 aa  429  1e-119  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.576909  normal  0.0698479 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3494  cell division protein FtsA  49.43 
 
 		 438 aa  427  1e-118  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.815355 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0327  cell division protein FtsA  51.16 
 
 		 441 aa  424  1e-117  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.740051  normal  0.521585 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0697  cell division protein FtsA  48.97 
 
 		 438 aa  418  1e-116  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.505091  normal  0.501331 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2075  cell division protein FtsA  45.37 
 
 		 442 aa  396  1e-109  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00118301 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2587  cell division protein FtsA  44.21 
 
 		 443 aa  389  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1426  cell division protein FtsA  47.99 
 
 		 440 aa  385  1e-106  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.365599  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1383  cell division protein FtsA  47.99 
 
 		 440 aa  385  1e-106  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2846  cell division protein FtsA  43.75 
 
 		 443 aa  386  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.67917  hitchhiker  0.00813822 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1749  cell division protein FtsA  47.75 
 
 		 440 aa  384  1e-105  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2884  cell division protein  44.21 
 
 		 441 aa  382  1e-105  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0459922  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2002  cell division protein FtsA  48.12 
 
 		 437 aa  377  1e-103  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0360528  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0942  cell division protein FtsA  43.62 
 
 		 432 aa  358  9.999999999999999e-98  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000255015  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2426  cell division protein FtsA  41.89 
 
 		 436 aa  328  1.0000000000000001e-88  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000116428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0068  cell division protein FtsA  42.01 
 
 		 437 aa  291  1e-77  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0945  cell division protein FtsA  37.27 
 
 		 440 aa  288  1e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.000880063  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2417  cell division protein  38.84 
 
 		 445 aa  278  9e-74  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000659549  normal  0.582955 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0688  cell division protein FtsA  37.5 
 
 		 450 aa  270  2.9999999999999997e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0260143  decreased coverage  0.000277221 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2072  cell division protein FtsA  37.15 
 
 		 443 aa  270  5e-71  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.327697 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3658  cell division protein FtsA  35.52 
 
 		 441 aa  264  3e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.219923 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2751  cell division protein FtsA  36.11 
 
 		 444 aa  259  6e-68  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.411174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0699  cell division protein FtsA  37.47 
 
 		 444 aa  257  3e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.181959  normal  0.281367 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0789  cell division protein FtsA  36.97 
 
 		 444 aa  252  7e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.150702  normal  0.197586 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2113  cell division protein FtsA  36.97 
 
 		 444 aa  252  7e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3165  cell division protein FtsA  35.85 
 
 		 464 aa  250  4e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4488  cell division protein FtsA  35.58 
 
 		 444 aa  238  2e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00787322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1876  cell division protein FtsA  34.1 
 
 		 418 aa  226  4e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.236246 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3941  cell division protein FtsA  34.91 
 
 		 419 aa  218  2e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5215  cell division protein FtsA  33.91 
 
 		 411 aa  215  9.999999999999999e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.344287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04363  cell division protein FtsA  33.65 
 
 		 411 aa  214  2.9999999999999995e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.757855  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0606  cell division protein FtsA  33.89 
 
 		 411 aa  214  2.9999999999999995e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.943795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0748  cell division protein FtsA  32.56 
 
 		 412 aa  213  7e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000107961  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2044  cell division protein  33.41 
 
 		 411 aa  211  1e-53  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000000655425  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1965  cell division protein FtsA  33.41 
 
 		 411 aa  212  1e-53  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.00000960191  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0201  cell division protein FtsA  31.38 
 
 		 422 aa  209  6e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.449643  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0380  cell division protein FtsA  31.38 
 
 		 422 aa  209  6e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00706299  normal  0.0389324 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3649  cell division protein FtsA  30.91 
 
 		 410 aa  209  1e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00282858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0416  cell division protein FtsA  30.91 
 
 		 411 aa  208  1e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.840628  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0534  cell division protein FtsA  30.91 
 
 		 410 aa  209  1e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000483364  normal  0.575152 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0081  cell division protein FtsA  30.91 
 
 		 410 aa  209  1e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0000240923  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3969  cell division protein FtsA  31.38 
 
 		 411 aa  209  1e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000373054  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0563  cell division protein FtsA  30.91 
 
 		 410 aa  209  1e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000205481  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2840  cell division protein FtsA  30.91 
 
 		 410 aa  208  2e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0492  cell division protein FtsA  30.91 
 
 		 410 aa  208  2e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000474873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2197  cell division protein FtsA  33.08 
 
 		 409 aa  207  2e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.0721100000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2603  cell division protein FtsA  32.48 
 
 		 409 aa  208  2e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0898076  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0467  cell division protein FtsA  30.91 
 
 		 410 aa  208  2e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0035462  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2720  cell division protein FtsA  30.68 
 
 		 410 aa  207  3e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.705635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3085  cell division protein FtsA  30.68 
 
 		 410 aa  207  3e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3064  cell division protein FtsA  30.91 
 
 		 411 aa  207  4e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2832  cell division protein FtsA  30.68 
 
 		 410 aa  207  4e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000848153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1326  cell division protein FtsA  30.68 
 
 		 410 aa  205  1e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.792019  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0513  cell division protein FtsA  30.68 
 
 		 411 aa  205  1e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2547  cell division protein FtsA  30.68 
 
 		 410 aa  205  1e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3540  cell division protein FtsA  30.68 
 
 		 410 aa  205  1e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1122  cell division protein FtsA  30.68 
 
 		 410 aa  205  1e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0496  cell division protein FtsA  30.68 
 
 		 411 aa  205  1e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00048929  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0490  cell division protein FtsA  30.68 
 
 		 410 aa  205  1e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00369012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3546  cell division protein FtsA  30.68 
 
 		 410 aa  205  1e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3237  cell division protein FtsA  30.68 
 
 		 410 aa  205  1e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3521  cell division protein FtsA  30.68 
 
 		 410 aa  205  1e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0467  cell division protein FtsA  30.68 
 
 		 410 aa  205  1e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.79149  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2669  cell division protein FtsA  30.68 
 
 		 410 aa  204  2e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00924647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3466  cell division protein FtsA  30.68 
 
 		 410 aa  204  2e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000117297  hitchhiker  0.00107909 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0124  cell division protein FtsA  29.77 
 
 		 411 aa  202  9.999999999999999e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0427264  normal  0.0337696 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3124  cell division protein FtsA  29.98 
 
 		 410 aa  202  9.999999999999999e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.59264  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1117  cell division protein FtsA  31.19 
 
 		 411 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.0000192043  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2975  cell division protein FtsA  29.74 
 
 		 410 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.254584  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0171  cell division protein FtsA  30.44 
 
 		 409 aa  201  3e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000130276  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0587  cell division protein FtsA  30.52 
 
 		 417 aa  200  3.9999999999999996e-50  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000283199  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3494  cell division protein FtsA  30.47 
 
 		 409 aa  200  5e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0808464  normal  0.335158 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2264  cell division protein FtsA  30.24 
 
 		 412 aa  199  7e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0392802  hitchhiker  0.00222131 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0745  cell division protein FtsA  31.44 
 
 		 408 aa  198  1.0000000000000001e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0195283  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0952  cell division protein FtsA  31.85 
 
 		 408 aa  198  1.0000000000000001e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.39676 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3450  cell division protein FtsA  30.71 
 
 		 411 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000166188  hitchhiker  0.000034496 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1027  cell division protein FtsA  32.69 
 
 		 424 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000184559  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0413  cell division protein FtsA  30.71 
 
 		 411 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00909742  hitchhiker  0.00170264 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1046  cell division protein FtsA  31.44 
 
 		 408 aa  197  3e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000515882  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3423  cell division protein FtsA  29.27 
 
 		 409 aa  197  3e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.189914  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1138  cell division protein FtsA  32.15 
 
 		 426 aa  197  4.0000000000000005e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3801  cell division protein FtsA  30.24 
 
 		 411 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000784597  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0358  cell division protein FtsA  30.48 
 
 		 411 aa  196  6e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000000107954  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4530  cell division protein FtsA  30.48 
 
 		 411 aa  196  7e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000264478  hitchhiker  0.000036158 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1897  cell division protein FtsA  32.13 
 
 		 422 aa  196  8.000000000000001e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2186  cell division protein FtsA  31.87 
 
 		 423 aa  196  8.000000000000001e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0110179  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0849  cell division protein FtsA  31.32 
 
 		 410 aa  195  1e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000717091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3777  cell division protein FtsA  30.29 
 
 		 410 aa  195  1e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.11031  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3833  cell division protein FtsA  30.29 
 
 		 410 aa  195  1e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>