More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0688 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_0789  cell division protein FtsA  78.15 
 
 
444 aa  723    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.150702  normal  0.197586 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2113  cell division protein FtsA  78.15 
 
 
444 aa  723    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0699  cell division protein FtsA  78.38 
 
 
444 aa  726    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.181959  normal  0.281367 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0688  cell division protein FtsA  100 
 
 
450 aa  911    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0260143  decreased coverage  0.000277221 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2417  cell division protein  69.82 
 
 
445 aa  651    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000659549  normal  0.582955 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2751  cell division protein FtsA  68.02 
 
 
444 aa  634  1e-180  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.411174  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4488  cell division protein FtsA  66.89 
 
 
444 aa  629  1e-179  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00787322  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2426  cell division protein FtsA  41.16 
 
 
436 aa  325  8.000000000000001e-88  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000116428  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7437  cell division protein FtsA  39.87 
 
 
441 aa  318  1e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.05738  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0945  cell division protein FtsA  38.7 
 
 
440 aa  314  1.9999999999999998e-84  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.000880063  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6698  cell division protein FtsA  40.44 
 
 
441 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.535042  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2948  cell division protein FtsA  40.65 
 
 
419 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.576909  normal  0.0698479 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3175  cell division protein FtsA  40.32 
 
 
440 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0332764  normal  0.87705 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3132  cell division protein FtsA  40.55 
 
 
440 aa  306  3e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.48829  normal  0.202735 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2351  cell division protein FtsA  39.53 
 
 
440 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.442272  normal  0.661359 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3494  cell division protein FtsA  40.78 
 
 
438 aa  302  1e-80  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.815355 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0697  cell division protein FtsA  41.86 
 
 
438 aa  302  1e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.505091  normal  0.501331 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2002  cell division protein FtsA  41.74 
 
 
437 aa  302  1e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0360528  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1749  cell division protein FtsA  41.45 
 
 
440 aa  297  3e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2075  cell division protein FtsA  39.67 
 
 
442 aa  294  2e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00118301 
 
 
-
 
NC_004310  BR1426  cell division protein FtsA  40.98 
 
 
440 aa  293  4e-78  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.365599  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1383  cell division protein FtsA  40.98 
 
 
440 aa  293  4e-78  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2884  cell division protein  37.44 
 
 
441 aa  285  9e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0459922  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0068  cell division protein FtsA  37.2 
 
 
437 aa  281  2e-74  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2072  cell division protein FtsA  39.12 
 
 
443 aa  280  3e-74  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.327697 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2587  cell division protein FtsA  38.17 
 
 
443 aa  278  1e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2846  cell division protein FtsA  37.94 
 
 
443 aa  278  2e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.67917  hitchhiker  0.00813822 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0327  cell division protein FtsA  37.3 
 
 
441 aa  276  6e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.740051  normal  0.521585 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0942  cell division protein FtsA  36.94 
 
 
432 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000255015  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4041  cell division protein FtsA  37.91 
 
 
440 aa  273  5.000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3387  cell division protein FtsA  37.91 
 
 
427 aa  273  6e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0127671 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3299  cell division protein FtsA  36.5 
 
 
440 aa  271  1e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2003  cell division protein FtsA  37.5 
 
 
441 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.302134  normal  0.480609 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1057  cell division protein FtsA  37.19 
 
 
440 aa  270  4e-71  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.209259  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6167  cell division protein ATPase  37.39 
 
 
439 aa  268  2e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0801863 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1285  cell division protein FtsA  36.97 
 
 
440 aa  266  7e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3165  cell division protein FtsA  35.55 
 
 
464 aa  254  2.0000000000000002e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3658  cell division protein FtsA  33.77 
 
 
441 aa  244  1.9999999999999999e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.219923 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2424  cell division protein FtsA  34.11 
 
 
411 aa  226  6e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0673361  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3941  cell division protein FtsA  33.74 
 
 
419 aa  218  2e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0490  cell division protein FtsA  33.16 
 
 
410 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00369012  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3466  cell division protein FtsA  33.16 
 
 
410 aa  216  4e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000117297  hitchhiker  0.00107909 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0587  cell division protein FtsA  31.14 
 
 
417 aa  216  9e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000283199  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2197  cell division protein FtsA  32.06 
 
 
409 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.0721100000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3649  cell division protein FtsA  31.58 
 
 
410 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00282858  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1046  cell division protein FtsA  32.21 
 
 
408 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000515882  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0492  cell division protein FtsA  31.58 
 
 
410 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000474873  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0081  cell division protein FtsA  31.58 
 
 
410 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0000240923  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0534  cell division protein FtsA  31.58 
 
 
410 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000483364  normal  0.575152 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0467  cell division protein FtsA  31.58 
 
 
410 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0035462  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0563  cell division protein FtsA  31.58 
 
 
410 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000205481  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3546  cell division protein FtsA  31.58 
 
 
410 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2547  cell division protein FtsA  31.58 
 
 
410 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3540  cell division protein FtsA  31.58 
 
 
410 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3237  cell division protein FtsA  31.58 
 
 
410 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1122  cell division protein FtsA  31.58 
 
 
410 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2669  cell division protein FtsA  32.64 
 
 
410 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00924647  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3521  cell division protein FtsA  31.58 
 
 
410 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0467  cell division protein FtsA  31.58 
 
 
410 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.79149  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1326  cell division protein FtsA  31.58 
 
 
410 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.792019  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2832  cell division protein FtsA  31.34 
 
 
410 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000848153  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4404  cell division protein FtsA  31.84 
 
 
418 aa  212  1e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0640092  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0124  cell division protein FtsA  30.84 
 
 
411 aa  211  1e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0427264  normal  0.0337696 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2783  cell division protein FtsA  31.49 
 
 
407 aa  212  1e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000760847  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0748  cell division protein FtsA  33.89 
 
 
412 aa  212  1e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000107961  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4098  cell division protein FtsA  31.6 
 
 
418 aa  211  2e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.14475  normal  0.627944 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3494  cell division protein FtsA  33.16 
 
 
409 aa  211  2e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0808464  normal  0.335158 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1967  cell division protein  31.53 
 
 
413 aa  211  2e-53  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.000000443484  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2975  cell division protein FtsA  31.09 
 
 
410 aa  210  3e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.254584  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0380  cell division protein FtsA  31.07 
 
 
422 aa  211  3e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00706299  normal  0.0389324 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0201  cell division protein FtsA  31.07 
 
 
422 aa  211  3e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.449643  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0229  cell division protein FtsA  31.53 
 
 
410 aa  210  3e-53  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  5.72026e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3917  cell division protein FtsA  30.86 
 
 
410 aa  208  1e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2264  cell division protein FtsA  30.45 
 
 
412 aa  209  1e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0392802  hitchhiker  0.00222131 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3833  cell division protein FtsA  30.86 
 
 
410 aa  208  1e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2840  cell division protein FtsA  32.81 
 
 
410 aa  208  2e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3777  cell division protein FtsA  30.86 
 
 
410 aa  208  2e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.11031  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2186  cell division protein FtsA  31.9 
 
 
423 aa  207  2e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0110179  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3423  cell division protein FtsA  31.58 
 
 
409 aa  208  2e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.189914  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0774  cell division protein FtsA  31.84 
 
 
412 aa  207  3e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.125422  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4669  cell division protein FtsA  31.53 
 
 
419 aa  207  3e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000165844  normal  0.464968 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0750  cell division protein FtsA  31.25 
 
 
410 aa  207  3e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2196  cell division protein FtsA  32.25 
 
 
411 aa  207  3e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.000929624  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3085  cell division protein FtsA  32.55 
 
 
410 aa  207  4e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2720  cell division protein FtsA  32.55 
 
 
410 aa  207  4e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.705635  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3124  cell division protein FtsA  32.11 
 
 
410 aa  207  4e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.59264  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3473  cell division protein FtsA  32.55 
 
 
406 aa  207  4e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.000668863  normal  0.0927017 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13290  cell division protein FtsA  31.21 
 
 
415 aa  206  5e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00675344  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0454  cell division protein FtsA  31.78 
 
 
416 aa  206  5e-52  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0012381  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0952  cell division protein FtsA  31.01 
 
 
408 aa  206  6e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.39676 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0852  cell division protein FtsA  31.19 
 
 
409 aa  206  7e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000127132  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0166  cell division protein FtsA  29.25 
 
 
412 aa  206  8e-52  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0513  cell division protein FtsA  31.34 
 
 
411 aa  206  8e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5215  cell division protein FtsA  31.82 
 
 
411 aa  205  1e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.344287  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3969  cell division protein FtsA  30.71 
 
 
411 aa  205  1e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000373054  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2663  ATP-binding cell division protein FtsA  32.17 
 
 
412 aa  205  1e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2533  ATP-binding cell division protein FtsA  32.17 
 
 
412 aa  205  1e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57290  cell division protein FtsA  32.15 
 
 
417 aa  205  1e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4980  cell division protein FtsA  32.15 
 
 
417 aa  205  1e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.248977  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0496  cell division protein FtsA  31.1 
 
 
411 aa  204  2e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00048929  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>