More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_4488 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_0699  cell division protein FtsA  72.3 
 
 		 444 aa  682    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.181959  normal  0.281367 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2113  cell division protein FtsA  71.85 
 
 		 444 aa  678    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0789  cell division protein FtsA  71.85 
 
 		 444 aa  678    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.150702  normal  0.197586 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4488  cell division protein FtsA  100 
 
 		 444 aa  900    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00787322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0688  cell division protein FtsA  66.89 
 
 		 450 aa  629  1e-179  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0260143  decreased coverage  0.000277221 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2417  cell division protein  67.12 
 
 		 445 aa  629  1e-179  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000659549  normal  0.582955 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2751  cell division protein FtsA  65.09 
 
 		 444 aa  606  9.999999999999999e-173  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.411174  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0697  cell division protein FtsA  41.63 
 
 		 438 aa  298  1e-79  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.505091  normal  0.501331 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2426  cell division protein FtsA  37.89 
 
 		 436 aa  293  6e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000116428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7437  cell division protein FtsA  38.62 
 
 		 441 aa  286  5.999999999999999e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.05738  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6698  cell division protein FtsA  38.71 
 
 		 441 aa  285  9e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.535042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2351  cell division protein FtsA  39.49 
 
 		 440 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.442272  normal  0.661359 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3175  cell division protein FtsA  39.27 
 
 		 440 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0332764  normal  0.87705 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3132  cell division protein FtsA  39.5 
 
 		 440 aa  283  6.000000000000001e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.48829  normal  0.202735 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2948  cell division protein FtsA  40.33 
 
 		 419 aa  282  1e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.576909  normal  0.0698479 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3494  cell division protein FtsA  38.02 
 
 		 438 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.815355 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0945  cell division protein FtsA  37.14 
 
 		 440 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.000880063  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2002  cell division protein FtsA  37.47 
 
 		 437 aa  262  8e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0360528  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2884  cell division protein  39.75 
 
 		 441 aa  259  6e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0459922  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2075  cell division protein FtsA  39.34 
 
 		 442 aa  257  2e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00118301 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2072  cell division protein FtsA  39.53 
 
 		 443 aa  256  7e-67  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.327697 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0327  cell division protein FtsA  37.33 
 
 		 441 aa  255  1.0000000000000001e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.740051  normal  0.521585 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1749  cell division protein FtsA  39.18 
 
 		 440 aa  255  1.0000000000000001e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1383  cell division protein FtsA  39.49 
 
 		 440 aa  253  6e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1426  cell division protein FtsA  39.49 
 
 		 440 aa  252  7e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.365599  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1057  cell division protein FtsA  35.67 
 
 		 440 aa  249  5e-65  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.209259  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2846  cell division protein FtsA  38.32 
 
 		 443 aa  248  2e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.67917  hitchhiker  0.00813822 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2587  cell division protein FtsA  38.07 
 
 		 443 aa  246  4.9999999999999997e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4041  cell division protein FtsA  35.71 
 
 		 440 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1285  cell division protein FtsA  35.65 
 
 		 440 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0942  cell division protein FtsA  36.34 
 
 		 432 aa  239  5.999999999999999e-62  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000255015  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3299  cell division protein FtsA  34.97 
 
 		 440 aa  238  1e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2003  cell division protein FtsA  35.58 
 
 		 441 aa  238  2e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.302134  normal  0.480609 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3387  cell division protein FtsA  35.17 
 
 		 427 aa  238  2e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0127671 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0068  cell division protein FtsA  35.44 
 
 		 437 aa  235  1.0000000000000001e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3658  cell division protein FtsA  36.36 
 
 		 441 aa  234  3e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.219923 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6167  cell division protein ATPase  33.56 
 
 		 439 aa  231  2e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0801863 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3165  cell division protein FtsA  34.2 
 
 		 464 aa  214  2.9999999999999995e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3941  cell division protein FtsA  33.17 
 
 		 419 aa  213  7.999999999999999e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2264  cell division protein FtsA  30.72 
 
 		 412 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0392802  hitchhiker  0.00222131 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3494  cell division protein FtsA  33.08 
 
 		 409 aa  200  5e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0808464  normal  0.335158 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2424  cell division protein FtsA  32.16 
 
 		 411 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0673361  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2669  cell division protein FtsA  31.36 
 
 		 410 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00924647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1046  cell division protein FtsA  31.9 
 
 		 408 aa  197  3e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000515882  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3237  cell division protein FtsA  29.58 
 
 		 410 aa  196  6e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2547  cell division protein FtsA  29.58 
 
 		 410 aa  196  6e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3540  cell division protein FtsA  29.58 
 
 		 410 aa  196  6e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3649  cell division protein FtsA  29.58 
 
 		 410 aa  196  6e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00282858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1122  cell division protein FtsA  29.58 
 
 		 410 aa  196  6e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0534  cell division protein FtsA  29.58 
 
 		 410 aa  196  6e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000483364  normal  0.575152 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3546  cell division protein FtsA  29.58 
 
 		 410 aa  196  6e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0081  cell division protein FtsA  29.58 
 
 		 410 aa  196  6e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0000240923  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0467  cell division protein FtsA  29.58 
 
 		 410 aa  196  6e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.79149  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1326  cell division protein FtsA  29.58 
 
 		 410 aa  196  6e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.792019  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0563  cell division protein FtsA  29.58 
 
 		 410 aa  196  6e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000205481  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3521  cell division protein FtsA  29.58 
 
 		 410 aa  196  6e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0492  cell division protein FtsA  29.58 
 
 		 410 aa  196  8.000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000474873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0467  cell division protein FtsA  29.58 
 
 		 410 aa  196  8.000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0035462  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0166  cell division protein FtsA  32.13 
 
 		 412 aa  195  1e-48  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3466  cell division protein FtsA  31.36 
 
 		 410 aa  195  1e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000117297  hitchhiker  0.00107909 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0171  cell division protein FtsA  31.54 
 
 		 409 aa  195  2e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000130276  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0490  cell division protein FtsA  31.36 
 
 		 410 aa  194  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00369012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2832  cell division protein FtsA  29.34 
 
 		 410 aa  194  2e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000848153  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0952  cell division protein FtsA  32.14 
 
 		 408 aa  193  4e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.39676 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2975  cell division protein FtsA  31.07 
 
 		 410 aa  193  4e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.254584  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0745  cell division protein FtsA  31.19 
 
 		 408 aa  192  1e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0195283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0185  cell division protein FtsA  31.28 
 
 		 409 aa  191  2e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  unclonable  0.00000000000415608  normal  0.589058 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3124  cell division protein FtsA  30.97 
 
 		 410 aa  191  2e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.59264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1876  cell division protein FtsA  30.12 
 
 		 418 aa  191  2e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.236246 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0750  cell division protein FtsA  30.48 
 
 		 410 aa  191  2.9999999999999997e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3777  cell division protein FtsA  30.92 
 
 		 410 aa  191  2.9999999999999997e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.11031  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2197  cell division protein FtsA  31.59 
 
 		 409 aa  190  5e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.0721100000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5215  cell division protein FtsA  30.55 
 
 		 411 aa  189  7e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.344287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3917  cell division protein FtsA  30.68 
 
 		 410 aa  189  9e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3833  cell division protein FtsA  30.68 
 
 		 410 aa  189  9e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2783  cell division protein FtsA  30.05 
 
 		 407 aa  189  1e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000760847  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0587  cell division protein FtsA  28.7 
 
 		 417 aa  189  1e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000283199  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3423  cell division protein FtsA  31.52 
 
 		 409 aa  189  1e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.189914  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3085  cell division protein FtsA  30.71 
 
 		 410 aa  187  2e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2720  cell division protein FtsA  30.71 
 
 		 410 aa  187  2e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.705635  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2840  cell division protein FtsA  30.45 
 
 		 410 aa  187  4e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2489  cell division protein FtsA  29.23 
 
 		 412 aa  187  5e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.391008  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0380  cell division protein FtsA  31.14 
 
 		 422 aa  186  6e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00706299  normal  0.0389324 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0201  cell division protein FtsA  31.14 
 
 		 422 aa  186  6e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.449643  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0124  cell division protein FtsA  29.25 
 
 		 411 aa  186  1.0000000000000001e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0427264  normal  0.0337696 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0748  cell division protein FtsA  31.68 
 
 		 412 aa  185  1.0000000000000001e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000107961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0852  cell division protein FtsA  28.95 
 
 		 409 aa  184  3e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000127132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1967  cell division protein  29.25 
 
 		 413 aa  184  3e-45  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.000000443484  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0229  cell division protein FtsA  29.25 
 
 		 410 aa  184  4.0000000000000006e-45  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  5.72026e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2698  cell division protein FtsA  31.75 
 
 		 422 aa  184  4.0000000000000006e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.244594  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3473  cell division protein FtsA  30.14 
 
 		 406 aa  183  5.0000000000000004e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.000668863  normal  0.0927017 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0876  cell division protein FtsA  30.64 
 
 		 411 aa  183  6e-45  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0513  cell division protein FtsA  30.81 
 
 		 411 aa  183  6e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0496  cell division protein FtsA  30.33 
 
 		 411 aa  183  7e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00048929  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4404  cell division protein FtsA  28.41 
 
 		 418 aa  182  8.000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0640092  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2663  ATP-binding cell division protein FtsA  29.37 
 
 		 412 aa  182  8.000000000000001e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2533  ATP-binding cell division protein FtsA  29.37 
 
 		 412 aa  182  8.000000000000001e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13290  cell division protein FtsA  28.5 
 
 		 415 aa  182  8.000000000000001e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00675344  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1117  cell division protein FtsA  32.73 
 
 		 411 aa  182  1e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.0000192043  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4098  cell division protein FtsA  28.18 
 
 		 418 aa  182  1e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.14475  normal  0.627944 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>