More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2417 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_0699  cell division protein FtsA  72.75 
 
 		 444 aa  692    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.181959  normal  0.281367 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2113  cell division protein FtsA  73.2 
 
 		 444 aa  692    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0688  cell division protein FtsA  69.82 
 
 		 450 aa  651    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0260143  decreased coverage  0.000277221 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0789  cell division protein FtsA  73.2 
 
 		 444 aa  692    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.150702  normal  0.197586 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2417  cell division protein  100 
 
 		 445 aa  902    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000659549  normal  0.582955 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2751  cell division protein FtsA  68.02 
 
 		 444 aa  628  1e-179  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.411174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4488  cell division protein FtsA  67.12 
 
 		 444 aa  629  1e-179  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00787322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2426  cell division protein FtsA  39.01 
 
 		 436 aa  320  3e-86  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000116428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3494  cell division protein FtsA  40.28 
 
 		 438 aa  302  8.000000000000001e-81  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.815355 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7437  cell division protein FtsA  38.76 
 
 		 441 aa  302  9e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.05738  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0945  cell division protein FtsA  38.38 
 
 		 440 aa  301  2e-80  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.000880063  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0697  cell division protein FtsA  39.63 
 
 		 438 aa  299  6e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.505091  normal  0.501331 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2351  cell division protein FtsA  39.63 
 
 		 440 aa  299  7e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.442272  normal  0.661359 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3175  cell division protein FtsA  39.22 
 
 		 440 aa  297  2e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0332764  normal  0.87705 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2948  cell division protein FtsA  39.63 
 
 		 419 aa  297  3e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.576909  normal  0.0698479 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3132  cell division protein FtsA  39.45 
 
 		 440 aa  297  3e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.48829  normal  0.202735 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6698  cell division protein FtsA  38.16 
 
 		 441 aa  296  5e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.535042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4041  cell division protein FtsA  38.85 
 
 		 440 aa  282  1e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0327  cell division protein FtsA  39.07 
 
 		 441 aa  280  4e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.740051  normal  0.521585 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3387  cell division protein FtsA  39.07 
 
 		 427 aa  279  7e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0127671 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2003  cell division protein FtsA  38.84 
 
 		 441 aa  278  9e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.302134  normal  0.480609 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3299  cell division protein FtsA  37.73 
 
 		 440 aa  277  2e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2072  cell division protein FtsA  39.69 
 
 		 443 aa  278  2e-73  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.327697 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0068  cell division protein FtsA  38.55 
 
 		 437 aa  277  3e-73  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1057  cell division protein FtsA  36.55 
 
 		 440 aa  270  4e-71  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.209259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6167  cell division protein ATPase  37.39 
 
 		 439 aa  269  8.999999999999999e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0801863 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1285  cell division protein FtsA  36.43 
 
 		 440 aa  268  2e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2002  cell division protein FtsA  39.49 
 
 		 437 aa  266  7e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0360528  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2075  cell division protein FtsA  36.8 
 
 		 442 aa  263  4e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00118301 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0942  cell division protein FtsA  38.14 
 
 		 432 aa  261  1e-68  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000255015  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1749  cell division protein FtsA  39.49 
 
 		 440 aa  261  2e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1426  cell division protein FtsA  39.23 
 
 		 440 aa  258  1e-67  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.365599  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3165  cell division protein FtsA  36.49 
 
 		 464 aa  258  1e-67  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1383  cell division protein FtsA  39.23 
 
 		 440 aa  258  1e-67  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2884  cell division protein  35.7 
 
 		 441 aa  257  3e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0459922  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2846  cell division protein FtsA  36.5 
 
 		 443 aa  253  6e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.67917  hitchhiker  0.00813822 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2587  cell division protein FtsA  36.25 
 
 		 443 aa  252  1e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3658  cell division protein FtsA  33.92 
 
 		 441 aa  229  8e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.219923 
 
 
-
 
NC_002978  WD0166  cell division protein FtsA  33.33 
 
 		 412 aa  218  2.9999999999999998e-55  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3941  cell division protein FtsA  32.64 
 
 		 419 aa  215  9.999999999999999e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5215  cell division protein FtsA  31.98 
 
 		 411 aa  208  2e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.344287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1046  cell division protein FtsA  31.73 
 
 		 408 aa  205  2e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000515882  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0876  cell division protein FtsA  32 
 
 		 411 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0849  cell division protein FtsA  34.09 
 
 		 410 aa  201  1.9999999999999998e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000717091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2197  cell division protein FtsA  31.96 
 
 		 409 aa  201  3e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.0721100000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3777  cell division protein FtsA  30.19 
 
 		 410 aa  199  6e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.11031  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0745  cell division protein FtsA  31.25 
 
 		 408 aa  198  1.0000000000000001e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0195283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0748  cell division protein FtsA  34.54 
 
 		 412 aa  199  1.0000000000000001e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000107961  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3917  cell division protein FtsA  29.95 
 
 		 410 aa  198  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3833  cell division protein FtsA  29.95 
 
 		 410 aa  198  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1090  cell division protein FtsA  32.23 
 
 		 415 aa  198  2.0000000000000003e-49  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0513  cell division protein FtsA  30.86 
 
 		 411 aa  196  5.000000000000001e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0496  cell division protein FtsA  30.86 
 
 		 411 aa  196  6e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00048929  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1293  cell division protein FtsA  31.83 
 
 		 453 aa  196  7e-49  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00992361  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0750  cell division protein FtsA  31.49 
 
 		 410 aa  195  1e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0952  cell division protein FtsA  30.77 
 
 		 408 aa  195  1e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.39676 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0201  cell division protein FtsA  32.13 
 
 		 422 aa  195  2e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.449643  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0380  cell division protein FtsA  32.13 
 
 		 422 aa  195  2e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00706299  normal  0.0389324 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3064  cell division protein FtsA  31.1 
 
 		 411 aa  194  3e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2603  cell division protein FtsA  30.29 
 
 		 409 aa  194  3e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0898076  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0587  cell division protein FtsA  29.66 
 
 		 417 aa  193  6e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000283199  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1876  cell division protein FtsA  30.17 
 
 		 418 aa  192  7e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.236246 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2669  cell division protein FtsA  30.77 
 
 		 410 aa  192  8e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00924647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4669  cell division protein FtsA  30.16 
 
 		 419 aa  192  9e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000165844  normal  0.464968 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0416  cell division protein FtsA  31.01 
 
 		 411 aa  192  9e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.840628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0490  cell division protein FtsA  30.51 
 
 		 410 aa  192  9e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00369012  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4404  cell division protein FtsA  30.23 
 
 		 418 aa  192  1e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0640092  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4098  cell division protein FtsA  30 
 
 		 418 aa  192  1e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.14475  normal  0.627944 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3466  cell division protein FtsA  30.51 
 
 		 410 aa  192  1e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000117297  hitchhiker  0.00107909 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3649  cell division protein FtsA  30.31 
 
 		 410 aa  191  2e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00282858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3969  cell division protein FtsA  30.73 
 
 		 411 aa  191  2e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000373054  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0454  cell division protein FtsA  29.88 
 
 		 416 aa  191  2e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0012381  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0534  cell division protein FtsA  30.31 
 
 		 410 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000483364  normal  0.575152 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0081  cell division protein FtsA  30.31 
 
 		 410 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0000240923  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0563  cell division protein FtsA  30.31 
 
 		 410 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000205481  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0492  cell division protein FtsA  30.31 
 
 		 410 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000474873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0467  cell division protein FtsA  30.31 
 
 		 410 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0035462  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57290  cell division protein FtsA  30.88 
 
 		 417 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4980  cell division protein FtsA  30.88 
 
 		 417 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.248977  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3546  cell division protein FtsA  29.85 
 
 		 410 aa  190  4e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3237  cell division protein FtsA  29.85 
 
 		 410 aa  190  4e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2547  cell division protein FtsA  29.85 
 
 		 410 aa  190  4e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3540  cell division protein FtsA  29.85 
 
 		 410 aa  190  4e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1122  cell division protein FtsA  29.85 
 
 		 410 aa  190  4e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3521  cell division protein FtsA  29.85 
 
 		 410 aa  190  4e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0467  cell division protein FtsA  29.85 
 
 		 410 aa  190  4e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.79149  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1326  cell division protein FtsA  29.85 
 
 		 410 aa  190  4e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.792019  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2832  cell division protein FtsA  30.05 
 
 		 410 aa  190  5.999999999999999e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000848153  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13290  cell division protein FtsA  29.95 
 
 		 415 aa  189  5.999999999999999e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00675344  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2186  cell division protein FtsA  29.84 
 
 		 423 aa  189  7e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0110179  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2424  cell division protein FtsA  32.05 
 
 		 411 aa  189  8e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0673361  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3494  cell division protein FtsA  30.1 
 
 		 409 aa  189  1e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0808464  normal  0.335158 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0124  cell division protein FtsA  29.56 
 
 		 411 aa  189  1e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0427264  normal  0.0337696 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1967  cell division protein  29.11 
 
 		 413 aa  188  1e-46  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.000000443484  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0229  cell division protein FtsA  29.11 
 
 		 410 aa  189  1e-46  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  5.72026e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0926  cell division protein FtsA  29.93 
 
 		 415 aa  188  2e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0559098  normal  0.998938 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2489  cell division protein FtsA  29 
 
 		 412 aa  187  2e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.391008  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3284  cell division protein FtsA  30.43 
 
 		 412 aa  188  2e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000382408  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2264  cell division protein FtsA  28.54 
 
 		 412 aa  187  3e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0392802  hitchhiker  0.00222131 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1151  cell division ATP-binding protein FtsA  29.7 
 
 		 421 aa  186  7e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00228368  normal  0.516499 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>