23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_4156 on replicon NC_010678
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012857  Rpic12D_4268  signal peptide protein  100 
 
 		 309 aa  641    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.299048 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4156  putative signal peptide protein  100 
 
 		 309 aa  641    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03196  signal peptide protein  71.67 
 
 		 302 aa  414  9.999999999999999e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3990  hypothetical protein  61.01 
 
 		 299 aa  358  5e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00349291  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5864  hypothetical protein  58.17 
 
 		 299 aa  354  1e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5390  hypothetical protein  60.69 
 
 		 303 aa  350  1e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00108195  hitchhiker  0.00662206 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6952  hypothetical protein  56.31 
 
 		 303 aa  349  3e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.402722  normal  0.506284 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4449  signal peptide protein  56.59 
 
 		 312 aa  349  4e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6457  hypothetical protein  58.76 
 
 		 300 aa  345  7e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.615277  normal  0.275244 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5703  hypothetical protein  56.63 
 
 		 303 aa  344  1e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6392  hypothetical protein  58.59 
 
 		 304 aa  330  2e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7056  hypothetical protein  58.59 
 
 		 304 aa  330  2e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1436  hypothetical protein  58.59 
 
 		 304 aa  330  2e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.428223  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6267  putative signal peptide protein  52 
 
 		 323 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.69254 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5971  putative signal peptide protein  52.84 
 
 		 292 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4059  putative signal peptide protein  48.83 
 
 		 306 aa  288  6e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1992  putative signal peptide protein  50 
 
 		 311 aa  275  7e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.497766 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2457  putative signal peptide protein  48.54 
 
 		 306 aa  267  2e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.28249  normal  0.0976482 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2016  hypothetical protein  39.56 
 
 		 309 aa  210  2e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000702566 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2211  hypothetical protein  39.49 
 
 		 309 aa  204  1e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000554921  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2227  putative signal peptide protein  38.81 
 
 		 331 aa  202  4e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.094679  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1736  hypothetical protein  35.32 
 
 		 317 aa  169  8e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.685716  normal  0.675321 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2282  hypothetical protein  32.65 
 
 		 333 aa  129  6e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>