23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_C6952 on replicon NC_007509
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C6952  hypothetical protein  100 
 
 
303 aa  626  1e-178  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.402722  normal  0.506284 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5703  hypothetical protein  87.79 
 
 
303 aa  554  1e-157  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6457  hypothetical protein  87.13 
 
 
300 aa  545  1e-154  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.615277  normal  0.275244 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1436  hypothetical protein  89.22 
 
 
304 aa  530  1e-149  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.428223  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7056  hypothetical protein  89.22 
 
 
304 aa  530  1e-149  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6392  hypothetical protein  89.22 
 
 
304 aa  530  1e-149  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5390  hypothetical protein  79.87 
 
 
303 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00108195  hitchhiker  0.00662206 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5864  hypothetical protein  63.48 
 
 
299 aa  374  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3990  hypothetical protein  62.01 
 
 
299 aa  375  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00349291  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4449  signal peptide protein  64.04 
 
 
312 aa  373  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03196  signal peptide protein  61.67 
 
 
302 aa  370  1e-101  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4156  putative signal peptide protein  56.31 
 
 
309 aa  349  3e-95  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4268  signal peptide protein  56.31 
 
 
309 aa  349  3e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.299048 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6267  putative signal peptide protein  50.48 
 
 
323 aa  308  9e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.69254 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5971  putative signal peptide protein  53.55 
 
 
292 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4059  putative signal peptide protein  50 
 
 
306 aa  300  2e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2457  putative signal peptide protein  50.93 
 
 
306 aa  292  6e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.28249  normal  0.0976482 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1992  putative signal peptide protein  48.52 
 
 
311 aa  270  2e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.497766 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2227  putative signal peptide protein  42.91 
 
 
331 aa  230  2e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.094679  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2211  hypothetical protein  40.79 
 
 
309 aa  219  3e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000554921  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2016  hypothetical protein  38.15 
 
 
309 aa  208  1e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000702566 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1736  hypothetical protein  37.41 
 
 
317 aa  187  2e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.685716  normal  0.675321 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2282  hypothetical protein  34.29 
 
 
333 aa  163  3e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>