23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_1736 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_1736  hypothetical protein  100 
 
 
317 aa  645    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.685716  normal  0.675321 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2282  hypothetical protein  41.28 
 
 
333 aa  202  7e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2211  hypothetical protein  40.16 
 
 
309 aa  199  3.9999999999999996e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000554921  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6952  hypothetical protein  35.81 
 
 
303 aa  188  1e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.402722  normal  0.506284 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6457  hypothetical protein  35.49 
 
 
300 aa  188  1e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.615277  normal  0.275244 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4449  signal peptide protein  35.96 
 
 
312 aa  187  2e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5703  hypothetical protein  38.58 
 
 
303 aa  187  2e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2016  hypothetical protein  37.01 
 
 
309 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000702566 
 
 
-
 
NC_003296  RS03196  signal peptide protein  35.58 
 
 
302 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5390  hypothetical protein  37.4 
 
 
303 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00108195  hitchhiker  0.00662206 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4059  putative signal peptide protein  34.13 
 
 
306 aa  179  5.999999999999999e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3990  hypothetical protein  35.41 
 
 
299 aa  178  8e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00349291  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5864  hypothetical protein  36.11 
 
 
299 aa  177  1e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6392  hypothetical protein  38.19 
 
 
304 aa  176  3e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7056  hypothetical protein  38.19 
 
 
304 aa  176  3e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1436  hypothetical protein  38.19 
 
 
304 aa  176  3e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.428223  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1992  putative signal peptide protein  35.6 
 
 
311 aa  175  9.999999999999999e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.497766 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2457  putative signal peptide protein  34.26 
 
 
306 aa  174  1.9999999999999998e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.28249  normal  0.0976482 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6267  putative signal peptide protein  34.41 
 
 
323 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.69254 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4156  putative signal peptide protein  35.32 
 
 
309 aa  169  8e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4268  signal peptide protein  35.32 
 
 
309 aa  169  8e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.299048 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5971  putative signal peptide protein  36.05 
 
 
292 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2227  putative signal peptide protein  35.51 
 
 
331 aa  164  2.0000000000000002e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.094679  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>