23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_4059 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_4059  putative signal peptide protein  100 
 
 		 306 aa  641    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4449  signal peptide protein  57.3 
 
 		 312 aa  329  3e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5390  hypothetical protein  52.49 
 
 		 303 aa  318  1e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00108195  hitchhiker  0.00662206 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5864  hypothetical protein  51.82 
 
 		 299 aa  315  9e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6457  hypothetical protein  52.51 
 
 		 300 aa  312  3.9999999999999997e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.615277  normal  0.275244 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5703  hypothetical protein  53.06 
 
 		 303 aa  311  1e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3990  hypothetical protein  57.14 
 
 		 299 aa  311  1e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00349291  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03196  signal peptide protein  49.84 
 
 		 302 aa  305  6e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6952  hypothetical protein  50 
 
 		 303 aa  300  2e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.402722  normal  0.506284 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4268  signal peptide protein  48.83 
 
 		 309 aa  288  6e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.299048 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4156  putative signal peptide protein  48.83 
 
 		 309 aa  288  6e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2457  putative signal peptide protein  52.06 
 
 		 306 aa  287  1e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.28249  normal  0.0976482 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1436  hypothetical protein  52.07 
 
 		 304 aa  286  2e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.428223  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6392  hypothetical protein  52.07 
 
 		 304 aa  286  2e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7056  hypothetical protein  52.07 
 
 		 304 aa  286  2e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1992  putative signal peptide protein  48 
 
 		 311 aa  282  4.0000000000000003e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.497766 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2227  putative signal peptide protein  45.07 
 
 		 331 aa  280  2e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.094679  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5971  putative signal peptide protein  49.32 
 
 		 292 aa  278  6e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6267  putative signal peptide protein  48.32 
 
 		 323 aa  278  1e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.69254 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2211  hypothetical protein  42.28 
 
 		 309 aa  227  2e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000554921  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2016  hypothetical protein  39.25 
 
 		 309 aa  212  5.999999999999999e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000702566 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1736  hypothetical protein  34.13 
 
 		 317 aa  179  7e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.685716  normal  0.675321 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2282  hypothetical protein  33.88 
 
 		 333 aa  162  7e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>