23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_6267 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008392  Bamb_6267  putative signal peptide protein  100 
 
 		 323 aa  672    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.69254 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5971  putative signal peptide protein  95.55 
 
 		 292 aa  587  1e-167  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4449  signal peptide protein  56.23 
 
 		 312 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03196  signal peptide protein  56.16 
 
 		 302 aa  334  2e-90  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3990  hypothetical protein  53.79 
 
 		 299 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00349291  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5864  hypothetical protein  50.51 
 
 		 299 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6457  hypothetical protein  53.54 
 
 		 300 aa  310  2e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.615277  normal  0.275244 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5703  hypothetical protein  52.13 
 
 		 303 aa  310  2e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5390  hypothetical protein  55.12 
 
 		 303 aa  308  6.999999999999999e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00108195  hitchhiker  0.00662206 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6952  hypothetical protein  50.48 
 
 		 303 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.402722  normal  0.506284 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4156  putative signal peptide protein  52 
 
 		 309 aa  306  2.0000000000000002e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4268  signal peptide protein  52 
 
 		 309 aa  306  2.0000000000000002e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.299048 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6392  hypothetical protein  51.16 
 
 		 304 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7056  hypothetical protein  51.16 
 
 		 304 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1436  hypothetical protein  51.16 
 
 		 304 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.428223  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4059  putative signal peptide protein  48.32 
 
 		 306 aa  278  1e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1992  putative signal peptide protein  45.07 
 
 		 311 aa  259  5.0000000000000005e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.497766 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2457  putative signal peptide protein  43.36 
 
 		 306 aa  240  2e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.28249  normal  0.0976482 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2227  putative signal peptide protein  40 
 
 		 331 aa  202  8e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.094679  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2211  hypothetical protein  38.99 
 
 		 309 aa  193  3e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000554921  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2016  hypothetical protein  36.92 
 
 		 309 aa  183  4.0000000000000006e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000702566 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1736  hypothetical protein  37.21 
 
 		 317 aa  171  1e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.685716  normal  0.675321 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2282  hypothetical protein  35.37 
 
 		 333 aa  142  6e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>